LOC110499544 (mkk6c)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110499544
gene name mkk6c
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048584.1
NCBI id CM023238.2
chromosome length 46616863
location 38594819 ~ 38638772 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036956317.1
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>XM_036956318.1
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>TU1935706
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>TU1935707
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>TU1935703
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036956318.1 False 4667 mRNA 0.45 12 38607871 38638772
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TU1935703 True 958 lncRNA 0.39 1 38637192 38638149

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110499600 NA coding upstream 514 38580735 ~ 38594305 (+)
LOC110499447 LOC106589900 coding upstream 390849 38083895 ~ 38203970 (+)
LOC110499446 LOC106589902 coding upstream 513549 38075973 ~ 38081270 (+)
LOC110499442 LOC106589867 coding upstream 1609259 36965177 ~ 36985560 (+)
LOC118942467 NA coding upstream 1676168 36918536 ~ 36918651 (+)
LOC118942016 NA coding downstream 823 38639595 ~ 38640649 (+)
LOC110499463 LOC106589886 coding downstream 418264 39057036 ~ 39068138 (+)
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LOC110499465 LOC106589883 coding downstream 485306 39124078 ~ 39196200 (+)
LOC118942069 NA coding downstream 505184 39143956 ~ 39150402 (+)
G1692423 NA non-coding upstream 15764 38578816 ~ 38579055 (+)
G1692421 NA non-coding upstream 16379 38578192 ~ 38578440 (+)
G1692404 NA non-coding upstream 26639 38567872 ~ 38568180 (+)
G1692381 NA non-coding upstream 50146 38544444 ~ 38544673 (+)
G1692378 NA non-coding upstream 52173 38542227 ~ 38542646 (+)
G1692428 NA non-coding downstream 4751 38643523 ~ 38645620 (+)
G1692456 NA non-coding downstream 8125 38646897 ~ 38647109 (+)
G1692459 NA non-coding downstream 12318 38651090 ~ 38651301 (+)
G1692460 NA non-coding downstream 13635 38652407 ~ 38652646 (+)
G1692462 NA non-coding downstream 15300 38654072 ~ 38654310 (+)
G1692406 NA other upstream 25373 38568269 ~ 38569446 (+)
G1691992 NA other upstream 366268 38228015 ~ 38228551 (+)
G1691990 aatk other upstream 372084 38222505 ~ 38222735 (+)
G1691267 NA other upstream 785758 37804543 ~ 37809061 (+)
G1691189 NA other upstream 940755 37650626 ~ 37654064 (+)
G1692568 NA other downstream 72179 38710951 ~ 38712291 (+)
G1692702 NA other downstream 201162 38839934 ~ 38840271 (+)
G1693184 NA other downstream 717573 39356345 ~ 39359635 (+)
G1693699 NA other downstream 1242577 39881349 ~ 39881843 (+)
G1693700 NA other downstream 1243186 39881958 ~ 39882625 (+)
G1692440 NA non-coding upstream 32375 38603092 ~ 38603485 (+)

Expression


Co-expression Network