G1662896


Basic Information

Item Value
gene id G1662896
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048584.1
NCBI id CM023238.2
chromosome length 46616863
location 10771090 ~ 10866967 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1902929
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>TU1902926
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>TU1902927
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Function

NR:

description
PREDICTED: protein quaking-A-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU1902927 True 3925 lncRNA 0.42 3 10834364 10866967

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110498738 NA coding downstream 10520 10758981 ~ 10760570 (-)
LOC118942033 NA coding downstream 25766 10742948 ~ 10746240 (-)
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LOC110498936 LOC106589191 coding downstream 102218 10609747 ~ 10668872 (-)
LOC110498737 ca10 coding downstream 784351 9677900 ~ 9986739 (-)
zgc:112285 LOC106589435 coding upstream 7529 10874496 ~ 10881864 (-)
LOC110498945 LOC106589434 coding upstream 37517 10904484 ~ 10917705 (-)
LOC110498946 LOC106589433 coding upstream 96266 10963233 ~ 10967721 (-)
LOC110498947 LOC106589432 coding upstream 103760 10970727 ~ 10972944 (-)
LOC110498949 LOC106589429 coding upstream 133990 11000957 ~ 11041454 (-)
G1662885 NA non-coding downstream 49171 10721715 ~ 10721919 (-)
G1662353 NA non-coding downstream 51281 10719610 ~ 10719809 (-)
G1662113 NA non-coding downstream 239235 10531404 ~ 10531855 (-)
G1662087 NA non-coding downstream 256750 10514102 ~ 10514340 (-)
G1663012 NA non-coding upstream 77126 10944093 ~ 11027652 (-)
G1663066 NA non-coding upstream 199966 11066933 ~ 11067132 (-)
G1662993 NA non-coding upstream 332598 11199565 ~ 11202116 (-)
G1663122 NA non-coding upstream 371559 11238526 ~ 11255560 (-)
G1662039 NA other downstream 293905 10476963 ~ 10477185 (-)
G1661001 LOC106589450 other downstream 1310975 9422783 ~ 9460115 (-)
G1661023 NA other downstream 1370143 9399117 ~ 9400947 (-)
LOC110498913 h3f3b other downstream 2381836 8386968 ~ 8389308 (-)
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LOC110498953 NA other upstream 254946 11121913 ~ 11158776 (-)
G1663264 NA other upstream 675649 11542616 ~ 11543091 (-)
G1664239 NA other upstream 1383183 12250150 ~ 12251106 (-)
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G1666656 LOC106589183 other upstream 3355232 14222199 ~ 14223019 (-)

Expression


Co-expression Network