G1696431


Basic Information

Item Value
gene id G1696431
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048584.1
NCBI id CM023238.2
chromosome length 46616863
location 43150604 ~ 43155908 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1940479
tcgaAGCCACACCCTCCTCACTTGCGTTAGAAGTTCAGAATGTGTAGGCTACATAGAAATAATTACGCATTAAACAAAATCATAAGGATTTCTATTATCAAGGTGTAGATTACATATCACATTGCAGTGTTCCCACTTGTTAACAAATCTGCATGGGATTTCGGTTAATGCAACTccatgcagccaatggcaatgtccgctttagTTATAAGGCCGGGAGCCACTCGTGGATTTAACAGCTCAGTTCCACCTCGGACACCCTCAAAATAACCGTTATGAAGATGTTGAGTAGAGCCCAAAGAGGTGTTGAACCTACCAAATTGTTTGCGTAGTCAACTTagacacagctctgacacacacacttatcacagcagacatgccaccaggggtcttttcacagtccccaaatgcCCAATGaattcaagaaaacgtacagtattatatagagctaTGATTGGAAATGGAAATCCCTTTCATCTCAGATTGCTCaggtgaacagcaaacctggctTTAAGAAacacaatgcctctcccctatttAACCTAAATATGCGTATGTACTGATGGATGCTACTGAATTGATATGTAATATATGAAAATGTAAATGATAAATGCAGGACTATAATAATTGGTCTCTCTGTGTTTTTTCCTCCGTATTGAGTCAGTACAGAACATTGTACTTATACTTTTCTTGTTTTaaatgtgtgtagttctgtcctggagctgttcttgtctattaatcttctgtattatgtcatgtttcatgtggactccaggaagagtagctgctgcttttgcaacagccaatggggatcctaataaaataccaacagccaatggggatcctaataaaataccaacagccaatggggatcctaataaaataccaacagccaatggggatcctaataaaataccaacagccaatggagatcctaataaaataccccaAAAAAACATACAGTGAAACTTCACAAACTCAGAAAAAgttgaaaatgaaaatgaaaaaatgaaaatataATGTACTTAAGTGCTTAAATTACTTAAAATAATTTTCCATTTGAAAAGGAAATCATAAACAAATAGTTTGTGGTTAATATATAAAAGGTTTAtttaaaatataaacagtacgTAATATCATGTCACTCTAAATGTGTTTAACTACTACCTATTTCTCTTGCTTTTAGATATCTTTATCAATTTAACTTTCATATATAGGTTCAGGAAAAGACTATGACCATTCATATATATAATTGTGTTGCTATTTAATTAACATACCTCAGGACCTTTCAGTCCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTAATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTCACAGCATAATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTTATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGTGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATATACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATATACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGTGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTTATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGTGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTTTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCGTCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGTTAATTTACAGCATCATTTCTTCCTAATGTACCTGCTAATGCGGCTCTTTGTTCTGCATGTTGTGTGAAAACAAATCTgcgtcgcaaatggcaccctattccgaataaagtgcactacttttcaccaagGCCCTTGGGGCTCGGGtcgtatgtagggaatagggtgccatttgggtcgctGACAAATAACCCATCAATACAGACACTAGTTTTTTTTAAACTACAGTATGATGTTAATGATTGGCTGATTCTACAGTATGATGTTAATGATTGGCTGATTCTACAGTATGATGTTAATGATTGGCTGATTCTACAGTATGATGTTAATGATTGGCTGATTCTACAGTATGATGTTAATGATTGGCtgattctacagtatgttgttaatGATTGGTTGATTCTACAGTGCAGAAATAAGTGTTTTGCAGAAATACACTCAGTGTTtatttagtgtttagtgttttaATGTAAGTTATTTTGTGTGTTGCTGTCCATTGACTGATGGGGATATCAGGCTATTTAGTTATTTTTATATGAATAAAT

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1940479 True 3765 lncRNA 0.35 2 43150604 43155908

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110499564 NA coding upstream 2235 43137388 ~ 43148369 (+)
LOC110499502 pde10a coding upstream 28709 42950949 ~ 43125594 (+)
tbxtb LOC106589941 coding upstream 298865 42846046 ~ 42851739 (+)
LOC118942075 NA coding upstream 323512 42803589 ~ 42827234 (+)
LOC110499501 sft2a coding upstream 376495 42745164 ~ 42774109 (+)
LOC110510394 NA coding downstream 215785 43371693 ~ 43402764 (+)
LOC118942021 micu1 coding downstream 292806 43448714 ~ 43494181 (+)
LOC110499505 LOC106589952 coding downstream 442179 43552789 ~ 43615700 (+)
LOC110499517 LOC106589992 coding downstream 821372 43977280 ~ 43987101 (+)
LOC110499607 NA coding downstream 868111 44024019 ~ 44028357 (+)
G1696542 NA non-coding upstream 15910 43134161 ~ 43134694 (+)
G1696432 NA non-coding upstream 22604 43125707 ~ 43128000 (+)
G1696529 NA non-coding upstream 39535 43107649 ~ 43111069 (+)
G1696528 NA non-coding upstream 40763 43106753 ~ 43109841 (+)
G1696549 NA non-coding downstream 1905 43157813 ~ 43158134 (+)
G1696553 NA non-coding downstream 15555 43171463 ~ 43172287 (+)
G1696554 NA non-coding downstream 16532 43172440 ~ 43172684 (+)
G1696559 NA non-coding downstream 42501 43198409 ~ 43225842 (+)
G1696566 NA non-coding downstream 59035 43214943 ~ 43217189 (+)
G1696541 NA other upstream 16591 43133627 ~ 43134013 (+)
G1696324 NA other upstream 370055 42779999 ~ 42780549 (+)
LOC118942073 NA other upstream 623596 42522510 ~ 42527008 (+)
LOC110499605 LOC106590859 other upstream 639357 42484544 ~ 42511247 (+)
G1696563 NA other downstream 51651 43207559 ~ 43209518 (+)
G1696904 NA other downstream 467576 43623484 ~ 43626360 (+)
G1696905 NA other downstream 470480 43626388 ~ 43661355 (+)
G1696916 NA other downstream 513656 43669564 ~ 43670353 (+)
G1697152 NA other downstream 711321 43867229 ~ 43908497 (+)

Expression


Co-expression Network