G1697929


Basic Information

Item Value
gene id G1697929
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048584.1
NCBI id CM023238.2
chromosome length 46616863
location 44932538 ~ 44935045 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1942675
ctctttatgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtgggatctctctctttatgtagtgttgtgggatctctctctttatgtagtgctgtgggatctctctctttatgtagtgttgtggggtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctt
>TU1942680
ctctttatgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtgggatctctctctttatgtagtgttgtgggatctctctctttatgtagtgctgtgggatctctctctttatgtagtgttgtggggtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggggtctctctctttatgtagtgttgtagtgactctctctttatgtagtgttgtggggtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtg
>TU1942676
tgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttg
>TU1942677
tgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgactctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtctctttatgtagtgttgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtggtgtctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttgtagtgtctctctctttatgtagtgttg

Function

NR:

description
PREDICTED: paternally-expressed gene 3 protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1942675 False 856 lncRNA 0.39 2 44932538 44933568
TU1942680 False 506 lncRNA 0.40 2 44932538 44935045
TU1942676 False 750 lncRNA 0.38 3 44932926 44934221
TU1942677 True 638 lncRNA 0.38 2 44932926 44934221

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110499568 LOC106589976 coding upstream 9841 44885773 ~ 44922697 (+)
LOC110499508 LOC106589972 coding upstream 394820 44402023 ~ 44537718 (+)
LOC110499511 LOC106578785 coding upstream 570564 44337645 ~ 44361974 (+)
LOC110499510 LOC106589963 coding upstream 605289 44298168 ~ 44327249 (+)
LOC110499566 LOC105028001 coding upstream 669121 44181988 ~ 44263417 (+)
LOC110515455 jag1 coding downstream 389856 45324901 ~ 45444013 (+)
LOC118942022 NA coding downstream 743880 45678925 ~ 45679902 (+)
LOC118942078 NA coding downstream 1087849 46022894 ~ 46025800 (+)
tsnax tsnax coding downstream 1222589 46157634 ~ 46174248 (+)
disc1 LOC106595121 coding downstream 1243556 46178601 ~ 46308949 (+)
G1697928 NA non-coding upstream 2891 44929442 ~ 44929647 (+)
G1697926 NA non-coding upstream 3370 44928688 ~ 44929168 (+)
G1697925 NA non-coding upstream 4843 44927445 ~ 44927695 (+)
G1697838 NA non-coding upstream 37979 44893264 ~ 44894559 (+)
G1697931 NA non-coding downstream 210 44935255 ~ 44935629 (+)
G1697934 NA non-coding downstream 1398 44936443 ~ 44936733 (+)
G1697935 NA non-coding downstream 1787 44936832 ~ 44937132 (+)
G1697936 NA non-coding downstream 2152 44937197 ~ 44937574 (+)
G1697953 NA non-coding downstream 18545 44953590 ~ 44953864 (+)
G1697374 NA other upstream 432692 44498660 ~ 44499846 (+)
G1697222 NA other upstream 700771 44231322 ~ 44231767 (+)
G1697152 NA other upstream 1027680 43867229 ~ 43908497 (+)
G1696916 NA other upstream 1262185 43669564 ~ 43670353 (+)
G1698119 yo84 other downstream 176521 45111566 ~ 45112361 (+)
G1698413 i2b2b other downstream 761151 45696196 ~ 45697330 (+)
G1698414 NA other downstream 765045 45700090 ~ 45701101 (+)
G1698884 NA other downstream 1253900 46188945 ~ 46190421 (+)
LOC110499521 msmb other downstream 1611727 46546637 ~ 46552961 (+)

Expression


Co-expression Network