LOC118942859


Basic Information

Item Value
gene id LOC118942859
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 9082796 ~ 9084558 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036956776.1
gaatggatgtttcggcggttgtcgttcttcgcgttcaatgataccgaattcctagctgcagactagtaattaatatcaaagacttgttcttattcagTCGGTATGGATAGTCGAAGAATTTAACCAcgtggttaaaagattcagcaaccTTTAggcatctcgtaattgaggtaagctcggtcaagggtcaaggggtctgaatactttccgaatgcactgtttacAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACATGTATTTGCAGATACATACAGGTGTTTACAGGAGTTTGCAGGTATATACAGGTCTTTACAGGTGTTTACAGGTATTTGCAGGTACATACATGTATTTGCAGGTACATACAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTACAGTTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTAAATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGCTATTTGCAGTTACATACAAGTCTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTACAGTTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTtta
>XM_036956777.1
gaatggatgtttcggcggttgtcgttcttcgcgttcaatgataccgaattcctagctgcagactagtaattaatatcaaagacttgttcttattcagTCGGTATGGATAGTCGAAGAATTTAACCAcgtggttaaaagattcagcaaccTTTAggcatctcgtaattgaggtaagctcggtcaagggtcaaggggtctgaatactttccgaatgcactgtttacAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACATGTATTTGCAGATACATACAGGTGTTTACAGGAGTTTGCAGGTATATACAGGTCTTTACAGGTGTTTACAGGTATTTGCAGGTACATACATGTATTTGCAGGTACATACAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTACAGTTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTAAATACAGGTGTttacaggtacatacaggtcTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTACATACAGCTATTTGCAGTTACATACAAGTCTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTACAGTTACATACAGGTATTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTCTGCATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTttgcaggtacatacaggtctTTGCAGGTACATACAGGTGTTTACAGGTATATACAGGTGTTTACATGTACATACAGGTGTTTGCAGGTACATACAGGTGTtta

Function

NR:

description
PREDICTED: MAGE-like protein 2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036956776.1 False 1683 mRNA 0.41 2 9082796 9084558
XM_036956777.1 True 1683 mRNA 0.41 2 9082796 9084558

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942863 NA coding upstream 55780 9024374 ~ 9027016 (+)
LOC118942857 dusp16 coding upstream 184425 8819609 ~ 8898371 (+)
LOC118942858 LOC106612417 coding upstream 213560 8864331 ~ 8869236 (+)
LOC118942855 gpr19 coding upstream 291726 8770887 ~ 8791070 (+)
LOC118936349 tbk1 coding upstream 338331 8684919 ~ 8744666 (+)
zgc:194209 LOC106591857 coding downstream 132667 9217225 ~ 9241339 (+)
LOC110507941 LOC106592244 coding downstream 252323 9336881 ~ 9354472 (+)
LOC118943004 LOC106591072 coding downstream 303159 9387717 ~ 9391585 (+)
LOC118936575 LOC106592244 coding downstream 317936 9402494 ~ 9413171 (+)
LOC118942866 LOC106576670 coding downstream 447546 9532104 ~ 9722986 (+)
eps8a LOC106594571 non-coding upstream 7384 8908286 ~ 9091490 (+)
G1705297 NA non-coding upstream 30503 9051392 ~ 9052293 (+)
G1705296 NA non-coding upstream 34668 9047867 ~ 9048128 (+)
G1705295 NA non-coding upstream 35092 9047297 ~ 9047704 (+)
G1705293 NA non-coding upstream 36082 9046450 ~ 9046714 (+)
G1705304 NA non-coding downstream 10155 9094713 ~ 9095086 (+)
G1705305 NA non-coding downstream 10838 9095396 ~ 9095606 (+)
G1705309 NA non-coding downstream 17876 9102434 ~ 9106488 (+)
G1705323 NA non-coding downstream 67612 9152170 ~ 9153074 (+)
G1705340 NA non-coding downstream 116812 9201370 ~ 9202495 (+)
G1705279 NA other upstream 69633 9011926 ~ 9013163 (+)
G1705267 NA other upstream 106231 8975304 ~ 8976565 (+)
G1705229 NA other upstream 231689 8850398 ~ 8851107 (+)
LOC118942994 LOC106591951 other upstream 521584 8538928 ~ 8564807 (+)
G1704651 NA other upstream 1232676 7849560 ~ 7850120 (+)
G1705918 NA other downstream 570740 9655298 ~ 9655718 (+)
G1705920 NA other downstream 574773 9659331 ~ 9660140 (+)
G1706013 NA other downstream 663627 9748185 ~ 9753473 (+)
G1706090 NA other downstream 831155 9915713 ~ 9918019 (+)
G1706152 NA other downstream 1049830 10134388 ~ 10135384 (+)

Expression


Co-expression Network