LOC110507938 (LOC106591072)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110507938
gene name LOC106591072
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 9487581 ~ 9508460 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_036956803.1
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Function

NR:

description
globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1-like

GO:

id name namespace
GO:0005975 carbohydrate metabolic process biological_process
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016758 transferase activity, transferring hexosyl groups molecular_function

KEGG:

id description
K00709 ABO; histo-blood group ABO system transferase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_036956804.1 True 1640 mRNA 0.45 6 9487583 9508460

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110515809 LOC106592244 coding downstream 7065 9464081 ~ 9480516 (-)
LOC118936574 LOC106592244 coding downstream 107706 9371753 ~ 9379875 (-)
LOC118942865 LOC106593190 coding downstream 210433 9261999 ~ 9277148 (-)
LOC110512574 LOC107758139 coding downstream 282905 9111713 ~ 9204676 (-)
LOC118942995 NA coding downstream 376142 9106908 ~ 9111439 (-)
LOC110510472 LOC108426397 coding upstream 234378 9742838 ~ 9791396 (-)
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G1705386 NA other downstream 954778 8531735 ~ 8532803 (-)
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LOC110499727 LOC106609821 other upstream 1312464 10796557 ~ 10897355 (-)

Expression


Co-expression Network