LOC110499937 (LOC106609533)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110499937
gene name LOC106609533
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 19810551 ~ 19818578 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

NR:

description
oocyte zinc finger protein XlCOF22-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021576988.2 True 3333 mRNA 0.44 9 19810730 19818578

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110499935 LOC106609535 coding upstream 3679 19797479 ~ 19806872 (+)
LOC110499918 LOC106609536 coding upstream 26366 19763662 ~ 19784185 (+)
LOC110499934 LOC106576387 coding upstream 49258 19755909 ~ 19761293 (+)
LOC110499917 LOC106576387 coding upstream 58247 19742124 ~ 19752304 (+)
LOC118942906 NA coding upstream 100789 19709214 ~ 19709762 (+)
LOC110499940 LOC106609531 coding downstream 42576 19861154 ~ 19885723 (+)
LOC110499945 LOC106609530 coding downstream 73899 19892477 ~ 19900807 (+)
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ube2n LOC106609528 coding downstream 89121 19907699 ~ 19910772 (+)
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si:dkey-159a18.1 LOC106609576 other upstream 1543043 18247128 ~ 18268691 (+)
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nmes1 nmes1 other downstream 290620 20109125 ~ 20113891 (+)
G1715392 NA other downstream 739844 20558422 ~ 20558751 (+)
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G1717516 NA other downstream 2900341 22718919 ~ 22784445 (+)

Expression


Co-expression Network