LOC110499949 (LOC106609526)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110499949
gene name LOC106609526
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 19923790 ~ 19934601 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036957202.1
CTACCTTGTAGTCTACTACCTAAGGTGGGAGGACTTCGGAGGAGGGTACAGTATCGACTTACTCTACTTAAATAAGAGATTGCACATAGAAGTGGAGGGTATGGGGGACTGAACTGCATCCATTAACCCAACATCACGGAGGGAATTCCCTGACAAAACCGCACTAAACGCAATTGGAGTGAATGGGAAAATACACCGTCGTTGGGTAGATTGCCGGTATATCGCGTTATTGGACCTCAGTGATACACATATGCCAGTTTTCTCATCGCCATCCAGAACCTTGGTTTGGTGACTCACTCTTCGTTCGTTCATTTTCTGGATTTCGTTGCCTGCCCGGTGAGGAGAGTTATAACCTACATAATGAAGTTCaagccgaaccagaccagaacttaTGATGGCGAGGGCTTCAAGAAACGAGCGGCATGCTTGTGCTTCAAGAACGACAGTGAAGAAGAGGTGTTGCTGGTGAGCAGCAGTCGGCATCCGGACCAGTGGATCGTCCCAGGTGGAGGGATGGAGCCGGAGGAGGAGCCCTGTGGCGCAGCGGTCAGAGAGGTGTTTGAAGAGGCAGGAGTGAAAGGCAAGTTGGGACGTCTCCTAGGTGTGTTTGAGAATCAAGACCGAAAGCACCGAACGTACGTTTACGTATTGACCGTGACGGAGACATTGGAAGCATGGGAGGACTCGGTCAACATAGgTCGTAAACGGGAGTGGTTCACAGTGGACGAAGCCATTAAAGTCCTGCAACACCACAAGCCGGACCACGCTGAGTACTTGAAGCGGCTTCATCTCAGCTGCTCTCCAACTAATGGGAACTCCCTGCTCCCCAGCCAGCCCCCTAATGACAACTTCCCCCGTTACGGCCCCCCCACCACAGGATCTGTTCTGGGCCCCTCGCGCAGATAGGACTGGCCCCTTCCCACACCTATGAACTATCTTCTACCTGTACAGATACACTGAAAACTGACATTTTGCATGAATATACGAATCCTCAGAGTCACGGCTCACGCCACATGTATGTAAATGACTGTATACTTGGACAAACCAAAGCCATACTTGGAATTGTGTCTGGATGATTCAGTTAAGTAATGCCTTTCAGTAACTTCTTTAAGAATGTTCTATTGGGGtcaattgtattattattttcttcCATAATTAAGAAAATCACACAACATGGTTGCCACAGAAAAGGGGTCATTGGCTGACAATAGGATGGAAAATGGCAGTGTCATTGGACCTCGGGAGCTGGAGCAGTGTTGACAACAAAGAGATGCTACCTCAGTTGGACGAGCACTGGAAGGATGTCTTAACACGGTGTCAGATTCCCTTTGGCTGGTGTTTAACCTGTACAAACTACAGCTCACAAATATGACTGTTTACCTGCTTCAAGTAGTACCATACTGTGTGGGCAGAAGACAAGGGCTCACTATTGTCCCTCCCCCTTCACCTCAGTGATTGGTGCCCTACTTCAAGTTTAGTtgtaaaaacaacacattttgtATTTCTTATAGGGAGCATTTCACATTTAATTGCCTTTAATTGTGTTGCCTTGATTGGCAtcagttttttttctccatctaGCATGATCATGAATAACAATAATTTGATATACTAATTTAATTATTATGCCCGCCCCATATATGACCTGGCCATAAGAGTCTCTTTACTAGTTGAAGGCAGGCCCTCTTTAATATAATATCTGTTGCCACAAATGATGTCTCCTCAATGCTGAGATAATGTACTTTAATCCACAGTTGAGCATCTTGTCTGACCGCTGAATGAGGATTGAACCCCCCCACACAGGGGACCTGTAAATACTTTGCTGCAGAGAAGTGTAGAGTTGTGTGTCTGGTTAACAGAAATGCAACCATATGAACTTTTCTTCTCCATATTTGCGATTGTTTTTGTAATGatgtaacaaacaaaaaaaatgctgTATCATGTAGTGAAGGTAAAAAATGTCCTCCTTTCAGTTCCACCTGAGATCAGAGATGAGATGACATGGAACAACGAATAGGGAAGTTGTCtgaaagagaaagggaatggATGGAAATGAGTGCTTTCCGTGTTAGATTCACGGTGGGACGACACTGATGGTTAGGCTGAACATGGAAATGTTCTTAGAATGGACATGGATGTGAGATATTATAGTTGAGAACACACTTGTAAATTGTAGTGCTTTACTGGAAATTACACAAACATAAGTAGTTTCACTTTTTAATCTTATCACTCAACCACTATCTCACCCAGACTCCCAGCATTCATTTTTATCACAAGAATACCCCTCTGAGGCAGACATGGTCAAATACATACCGGTATGTCAACTTTCAAATACTTGAGGTATTGTAGGGTGGGCGGAGTTTGTACTTTTGGGATTATTTCATTGGTTCCATTTGACTAGGTAAGCTAAATCAAGTGCACTGTATTTTACATGTGTACTTGACCAAGGTCTGCCATTGTGGATAATGCTTGTTTTAATTTGAGCTCATGCTTTATCAAAGCAGTTTTTTGGGAGGGAGTGTTTAGGGGCCAGTAAATAACCGAAGAAAGGGTTAAACAGATGAAGGTGGGATCTATTGTGAGTTTGATATTGACCCTTCTTAAAATCTGTTGCATGAAAAGCTTTCACCGGCCTGTCTGATTGGACAGTCAGCTGGTCCAGTCTTTCAATAAAACCTGTCATTGGATAATGTCTGCCACTTGGTCAGACTACATGTGTTGTTTGTTGCATACATTGTgtctatgtgacaaatacataTCGATCCTGTGCCAAATGACAAATGTTTGATATAATTGGCCAGGCAGAATGATAAAGTCGACTTACTCTATCCATTTCTAATACATGATCATATTTGGTACATTTGGTAATGTTCTAAGGATTTTAAAAAAGACATGGTTATTCATGAAACTATCCCCTTTAACCAGTTGTATTTCTTTATGGATATAACCATTTATGGAGATTGGATTGATGCATACTGGTACACTACATTCAGGAAGGAAAGTAAGGACATTAATGCTATTTGTTCTGAATTGCGAGGACCTTTTTTAAATTTATTGTGGGAAAAAAAGTGGCAAATGTACAGCAGCTGTAGTTTTATTTTGAATGAATTACCCCCATTGTCCCTTATTACTGACACTAAACAGTAATGAATGGGTGGGGGACTGCTGTGAATGTGTGCTGATCAACTTTGTTCCAGGCACTCTCTCACTAGGGTGTCTTGAAGCACTCACTAGTTTATCAATGCAAACAGAATTTCCTTTATGATCATATGAACAGTGAAATTGGATAAAGTGGATTGAAGACTATTCTGTTTGGAATAATAATGAATTAAAAGGGAATTACTTGACTCCAGcctgtctg
>XM_021577008.2
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Function

NR:

description
diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta-like

GO:

id name namespace
GO:0008152 metabolic process biological_process
GO:0016787 hydrolase activity molecular_function

KEGG:

id description
K07766 E3.6.1.52; diphosphoinositol-polyphosphate diphosphatase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036957202.1 False 3361 mRNA 0.42 5 19923790 19934601
XM_021577008.2 True 3360 mRNA 0.42 5 19923794 19934601

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
ube2n LOC106609528 coding upstream 13018 19907699 ~ 19910772 (+)
LOC110499950 LOC106609529 coding upstream 16286 19903585 ~ 19907504 (+)
LOC110499945 LOC106609530 coding upstream 22983 19892477 ~ 19900807 (+)
LOC110499940 LOC106609531 coding upstream 38067 19861154 ~ 19885723 (+)
LOC110499937 LOC106609533 coding upstream 105212 19810551 ~ 19818578 (+)
LOC110499941 pkp2 coding downstream 4850 19939451 ~ 19951917 (+)
LOC110499946 LOC106609525 coding downstream 17913 19952514 ~ 19956800 (+)
LOC110499947 LOC106576403 coding downstream 38845 19973446 ~ 20008614 (+)
LOC110499953 NA coding downstream 120565 20055166 ~ 20092114 (+)
nmes1 nmes1 coding downstream 174524 20109125 ~ 20113891 (+)
G1714679 NA non-coding upstream 10633 19912847 ~ 19913157 (+)
G1714666 NA non-coding upstream 20401 19903054 ~ 19903389 (+)
G1714675 NA non-coding upstream 34259 19889322 ~ 19889531 (+)
G1714674 NA non-coding upstream 36464 19887064 ~ 19887326 (+)
G1714654 cl011 non-coding upstream 72190 19849367 ~ 19851600 (+)
G1714825 NA non-coding downstream 61748 19996349 ~ 19996552 (+)
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G1714829 NA non-coding downstream 67678 20002279 ~ 20002499 (+)
G1714090 NA other upstream 299876 19384972 ~ 19754609 (+)
G1713384 NA other upstream 1186354 18734791 ~ 18737436 (+)
G1713262 NA other upstream 1422916 18497147 ~ 18500874 (+)
si:dkey-159a18.1 LOC106609576 other upstream 1656282 18247128 ~ 18268691 (+)
G1712658 NA other upstream 2255204 17666280 ~ 17668586 (+)
G1715392 NA other downstream 623821 20558422 ~ 20558751 (+)
LOC110499980 LOC106576426 other downstream 1063997 20954576 ~ 21004439 (+)
G1717161 LOC106576319 other downstream 2241362 22175963 ~ 22180897 (+)
G1717516 NA other downstream 2784318 22718919 ~ 22784445 (+)

Expression


Co-expression Network