LOC110500183 (LOC106609180)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110500183
gene name LOC106609180
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 28341423 ~ 28343734 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU1974550
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>TU1974551
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>TU1974552
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>TU1974553
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>TU1974555
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>TU1974556
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>TU1974557
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Function

NR:

description
electron transfer flavoprotein regulatory factor 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021577388.2 False 904 mRNA 0.43 3 28341423 28342848
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XM_021577391.2 False 1051 mRNA 0.41 3 28341472 28342848
TU1974550 False 1712 TUCP 0.39 3 28341501 28343734
TU1974551 False 774 TUCP 0.43 3 28341501 28342796
TU1974552 False 825 TUCP 0.42 3 28341501 28342847
TU1974553 False 1187 TUCP 0.40 3 28341501 28343209
TU1974555 False 1386 TUCP 0.40 3 28341501 28343209
TU1974556 False 822 TUCP 0.42 3 28341501 28342847
TU1974557 True 1709 TUCP 0.39 3 28341501 28343734

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110501048 LOC106609163 coding upstream 5499 28311018 ~ 28335924 (+)
LOC118942914 NA coding upstream 83820 28254592 ~ 28257603 (+)
LOC110500182 LOC106609326 coding upstream 386986 27937819 ~ 27954437 (+)
LOC110500181 LOC106609325 coding upstream 418245 27905081 ~ 27923178 (+)
LOC110500180 LOC106609324 coding upstream 438526 27890465 ~ 27902897 (+)
utp20 utp20 coding downstream 9103 28351951 ~ 28376045 (+)
LOC110500185 LOC106609173 coding downstream 36974 28379822 ~ 28390596 (+)
LOC110500191 LOC106609184 coding downstream 281914 28624762 ~ 28787436 (+)
aebp2 LOC106609187 coding downstream 446084 28788932 ~ 28807707 (+)
LOC118943023 NA coding downstream 464972 28807820 ~ 28807949 (+)
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G1723558 NA non-coding upstream 74431 28266593 ~ 28266992 (+)
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G1723791 NA non-coding downstream 178225 28521073 ~ 28521505 (+)
G1722079 NA other upstream 1519488 26821647 ~ 26821935 (+)
cep83 LOC106609290 other upstream 2010330 26324744 ~ 26333964 (+)
G1721084 pfkfb3 other upstream 2299580 26038302 ~ 26041843 (+)
G1720853 NA other upstream 2704834 25636335 ~ 25636589 (+)
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G1724262 LOC106609200 other downstream 915412 29256778 ~ 29259929 (+)
G1725312 LOC106576088 other downstream 1547438 29890286 ~ 29891957 (+)
G1726209 LOC106609221 other downstream 2239154 30582002 ~ 30590636 (+)
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Expression


Co-expression Network