XLOC_036297


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_036297
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 14491293 ~ 14495346 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00072407
GAGGAAAAGGGTTAATATATGGTTCTGTTATTGTGGCTCATTTATACTCTGACCCCCCTGGATGCTACATTTAGTCTTAAAGCAGGAGCCAAACAGGTCAGATTAATCTCATTTTACTACCGTCATTCCTTCCCTTACCATCATCCGTATTTTGAGATGCAGTCTTCATTCACAGGTTTAAAACTGTCAGTCGAAATGGAGAGATGGCCTGTTGATGGGGGAGATGTGGAAGACATGCTAAACCACTGCATGGCTCTTGAGGAAAAGGTATTAGGTTCtgttatgttatttatttcaattattataattatattaagggggacacggtagctcagtggttagctctgtcgcttcacagaaagaaggttgttGGCTCTGCCTGagttgggtcagttgacgtttctgtgtcaAGTTTtgatgttctctccgtgttcagctgggtttcctccgggtgctccggtttctccggtctaaagacatgcactataggtgaattgaataaactacattggtCGTAGGATatgagtgtaaataagtgtgcatgggtgtttcctagtgctgggttgcagctggaaggacatccgctgcgtaaaacatgtgctggataagttggtggttcattccgctgtggcgacccctgatgaataaagggactaagccgaaggaaatcaATTACATATACTTGCACACTATTATTAAgcattaatatttcatattatttgtaTGCATGTACATTATGTATTtatacataacaaaataaaagtacCATATTATAATCtacaaactataataataataggttatttacttatatatttctAAGTATCTATACATAAGTAAGTACATTCAGTgcatgctcagcataattgagtacaccctattttgaaaatgattattttttatccatttctcaatgattattgttaatgtattttggtgcatttaaacaaaacagatttattaaacggatatatttattaaaataataatttagtcactaaatatatttagaaataagaAGACATTACAATTAGattcaagcaaaatataaaaaaataatacaaactacaaagtttcaaactaaaaacatttttagcttcccttgatttttcctcttttttatttgtatttaatatttttctataacatcaatttgggtgtactagtttttgaaccaATGTTGTATGTTATTTTCCAATGTtgtatgttattttgttagataagctccagatttggcttcagtactgactaatctaatgcacaaatataatattgtatagatCTTTCTTTTAAATTAGTATGTTTTATGGGatgctttacagtaatatatttgtgcgtctatattagattagtcagaaccaaagccaaaactgaaactaatataACAAAAAAGATCATAGTCCAAAAAATAGTACaccaaaatttacatttttgaaaaaacatttaatacaattttcaGAAACTGAAAAAGTCAAGAGAAACATCACAAAATTTAAATTGTTGAAATATTGAAATTTgtactattatatatttttttgcaattactCATTTGAGTTTAAATGAATTATCTTTCTATtattaaagatgtttggtgaccaaACTCTTGCTTTTACACTTTAACTGccccacaaaaacaaaaacaaaaaattggattgcatttcttaacccctaatgttgctagttaacacactcatttaattttttttcaacaaatcccataatttctaaaatatcaacctcgaCCAAATAGTAGCTATGTCAATATATGGTAAAAGTACTGGGATTTATACATATACtaagaaaaatctgaaaatataaagtgtaagaccagtttatttaaaaacataggCAAAATGAAACAGTTTTGaactctttattttttgaagtatgccataaaatatttcaaattctcATTAAACATGACTTTGGATTTgctgaaaaaaaagagaagaaaaaaacaagtgtagtgtatacacacacacacacacacacacacacatatacgcatGCATAAATCTATATGCCATCATTATACTAAATTTATATAAGGAGATTTTTGATAAGCCCCCCAAATCTAGTTGAAATGTTCAATGAAAAAAGCCGTAAAGAGATTACCTTAAGGGGTTTAgggttaaattacttttaaaggtTCTTACTATCTCCTGTTGTTTAaagatgtttactgtattttgaaaGTAACAAATGTTGCATAGATTTTCCTGCATGATAcataaccatagactgtaaaatatacataacCAAACTTATGTGGGCACTTCTttttctccctccctctctctgaAAGTCACATGCGTTTGTTTGCTTTTATGCttgtaaaataaatgcatttggtCCCATTAGGACATTGTAACGTCACTAAGGTCAGGCTGAGATGTTAGGTGATGCATTCTGACACACACCCATTAGTCATATTCATTGACATTGGTTTCAGGTCTGAACTTTGTGCAGGTCAGTCAGGTTTCACTCAATAAATCATGTCTCTATGACTCTTGATTTGCTTACAGGGCACCCCAGCTAACAATTTTAGATTCTTAAACACATTCACTTAACATTCCCATTGAAGAAATAGGAATTATTATACAgtaatatatatttcattcattaattttccttcccttatgcagtcccttatttatcagtggaatgaatcgccaactattccagcatatgtttttttttctcagctgatgccctaccagccgcaacccagtactgggaaagaatatattattatataacctTACATTTTTTAGGTTATCTGAACTTTTAAAACATCCAGTTTTTTACACAATGTAACATTAGTAACATTAGTAACATAGTTTTATTAATGTTCTTAgaatgttatttaatgttattagAACATTCCATCCACATTAGATTAatagtttatattaattttttatcaACATTATTAGAACATTCACCAACTAACATTCTATAGACATTCCAAGAATGTTGTTCtaagaatgtttttttattaatgttacaaGAATGATCCAAAAACataaatttaaagggatagttcaccacaaaattaaaatgactgCATGATTTACATGTGATagtaaacctttatgagtttctttcttctgttgaacacaaaagaagatactttaaaaaATGGTGGTTGAtagtacccattgacttccataacagGAAAGAaattactgtggaagtcaatggatacattcttcaaaatatcttcttttgtgttcaacagaagaaagaaactcaaattggtttggaacaacgaatagtgagtaaataatgacagaaatttctttctttctatattttcatttttaaatgatttctaTCTCTTTACTGTATATCCCTTGTAGCATTTAAGGAATGTAAATTCCGAATGGTCTTCTGAAGCTGTTCCCAGTTAGCTGGGACAGTGACGCTGGACAAGAAAAAGTACACTCTGTTCAGGTAAACTATTCTCATCATATGATCCAATGCCATGTCAAATGAAGCAGATGAAGTATAAACAAAACTCTTGAAGGCTGGATTGAGATCAGTGTAATAACTACAGAGCAGAGTTGTCTTGAGATCAGCATAAGTCAACCTCTGTCCTAAAAGCTTGCATTCTTTTCACAGAAGAGGCTGTGATGTCAATAAGATGAGTTTGGATCTCTTCCCGAGAATGGCCGTCAACATGTGTTAATGAAGCAGAATGAACGGCCTTGTCAACGAACAGCAGAAATGTAATCTCCATGAAGACGCTTCAAAGATGTGCATCAGTGCCATTTAAGCAGTTACATATTACTGACTAAAGCCCCCGCTCTTTTACCTCAATCTGTCTTGGATAGGACACCTCAACTACTCAAATTTTGTaagtaaatttattattttatttggatAAAACCTAAACGTGATCACATATTAGCCTATACAtgcaattgtttttgtttgctcaATCCAAAACAACAAAATGCATGATGTATATTGGTTCAATTCCCTTCTTATCTAGCTATATTATTAGATGTAGAGTATTTTTCCAAATGAATTACTCCCCCAAAAAATATCA

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00072407 True 4054 lncRNA 0.32 1 14491293 14495346

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_036295 lhx4 coding downstream 6694 14453933 ~ 14484599 (-)
XLOC_036296 NA coding downstream 8836 14474769 ~ 14482457 (-)
XLOC_036294 BX294388.2 coding downstream 38855 14414353 ~ 14452438 (-)
XLOC_036293 xpr1a coding downstream 115403 14244476 ~ 14375890 (-)
XLOC_036292 sin3b coding downstream 252270 14211746 ~ 14239023 (-)
XLOC_036298 qsox1 coding upstream 8264 14503610 ~ 14554785 (-)
XLOC_036299 cep350 coding upstream 64032 14559378 ~ 14609284 (-)
XLOC_036300 NA coding upstream 287868 14783214 ~ 14790721 (-)
XLOC_036301 NA coding upstream 582690 15078036 ~ 15081665 (-)
XLOC_036302 bcar3 coding upstream 589040 15084386 ~ 15229979 (-)
XLOC_036286 BX248385.1 non-coding downstream 396777 14092794 ~ 14094516 (-)
XLOC_036279 CT025854.2 non-coding downstream 613448 13877728 ~ 13877845 (-)
XLOC_036277 NA non-coding downstream 774716 13714942 ~ 13716577 (-)
XLOC_036303 NA non-coding upstream 755837 15251183 ~ 15251469 (-)
XLOC_036307 FP017128.1 non-coding upstream 1137386 15632732 ~ 15632847 (-)
XLOC_036309 CR931780.2 non-coding upstream 1420864 15916210 ~ 15916327 (-)

Expression


Co-expression Network