LOC110500885 (LOC106608683)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110500885
gene name LOC106608683
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 51370721 ~ 51413247 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036958136.1
cactttgtttatatacattaaaaaagttatactttaaatgcaCATGTGTAAAAACATcctttttacatttatttcaatttgtgggatgctgcagttttgcaaattgctatttatttttctttgatatggtgcaatattctattatgcTGATCAGATTGTATTCGTTTTGAATGGTTagatttatatgcactttgtttatatacattacaaatgtataatttaaatgcaaatgtttaatagTATTATGTTACATAACAAACCAATGCGTctttaaatacattgtggttaaggtagaTTATGATTTCATTTAATAATTTAATCATAATTGTTTTCACAGcaatcatagtcaaactatcgcaaacggtttgacttgaaaaaatacaaaacatatattttttttaaagagccgtTTGGGAGCCAAAAGAGCCGAGCCGAACGAGccggctcactgaaaagagccgGAATGCCCATCACCACCTATTGCCGATGGCCGAAAAACTAGTAGTGCGCTATGATAACATATGGGGAGGGGCATCCGAGCAGTGAGCTATGTTGTATTTGGTTGTATGTGTAACTTCTTATTTATACCTCAATGTGTGTAACTCCGAGTCGGGGAGATGATGAAGATTAGCCTACGCGCTATGTAAAATTGTTACAGCAGCACAGCCATTCGTAACTATTTGGCGCTCGCGCCACGTGGAGCGAAAGGCTACATTTATCGTGTTACATTTTATCCTACATGTTATCGCTTTGGTTTTTTAGCAACAACCGTCTTTTTTTGTTGCGTAGCAATAATGAAAACACAGTGATCTGACTGCCGCACTTCTCATCTCTACAAGTTTCAACCGATCCCCCGAGCACAGGATGAAGGGTCGAACAGATGCCCCGCGCGATAGGGGCTGGTTGGTGGGGGTTATCTTCTTCATCCTGGGACTCGGGACGCTGCTACCATGGAACTTCTTCATGACCGCCTCCATGTATTTCAACCGCCGCCTTAACAAGACTGAACGGAGCAACGGCACGGTGGTCTCCCACAAAGAGTACTACTTCAACAACTGGATGACTCTGCTGTCCCAGCTCCCCCTGCTGCTCTGCACTCTGCTCAACTCCTTCTTCTATCAGCGgATATCGGAGATGGTGCGGATAGCGGGCAGCCTGGTcttcatcttcatcctcttcatCCTCACTGCCATCCTGGTCAAGATCCCCATGGAGGAGGACCGCTTCTTCTCTGTTACCATGGCTACCATCTGGTTCATCAACTCGTTTGGAGCGGTGCTACAGGGCAGTCTGTTTGGCCTGGTGGGCCTCCTTCCTCAGAAGTACAGCGCTGTGTTCATGAGTGGCCAGGGGCTGGCCGGCACCTTCGCTGCTATCGCCATGCTGGTCTCCATAGccagtgaTACGGACCCTGAGACGGCTGCGTTGGGTTACTTCATCACGCCGTGTGTAGGAACCCTGATCACTTTGCTTAGCTACCTCCTACTGCCTCGCCTGGAGTTTGCCCAGTTTTACTTGGACAAGAGCAGGAGTTATGAGGTGGAGACTGCAAATGAGCTGCTGAAAGTGACAGAGAGTGGCACGGCGGAGAACGGCAAGCTGTATGGCCACGACAATGGCTCATTGGCCAATGGAGGTGCCAGTGGCGAGGAGGTGGAGGTAaagggggctggggtcagtcccAAGCAGGCCTTCTTAACCCTGGAGCAGGCTGAGGTCAGGGACAGGAAGTCCACCGTCATGGAGGTGTTTAAAAAGatatggGTGATGGctttctgtgttgtttttgtcttcACCGTCACTCTCGCTGTGTTCCCTGCCGTCACTGTGGACGTCAAGACCATATACCCTGGGAAATGGGAACCTTATTTCATCTCTGTGTGTTGCTTCCTCATTTTCAACGTGTGTGACTGGATCGGCAGAACTGTCACCACCCTGGTCCAGTGGCCCCCCAAGGAGAGTTGTCTGTTCCCGGGGCTGGTGGTCTCCAGGGTGGTGTTTGTTCCCCTGCTGATGTTCTGTAACGTCCAGAGCCGCTCCTACCTCCCCGTCCTCTTCTCCCACGACGCTGCCTTCGCTTTCATCATGAtgctcttctccctctccaaCGGATACTGCGTCTGCCTCTCCATGTCCTACGCCCCACAGTTGGTGACTCCTAAAGATGCAGAGACGGCCGGGGCCCTGATGACTTTCTTCCTGGCCCTGGGCCTCTCCATCGGGGCCGCCCTGTCCTTCCTGCTGCGACTACTggtctagacacacacacatcagaggaCCACCACCATCAGTCAACAGCCACCTCCATCCCCATCCGTAAAGTGACGGGACACGCCATGACACGCCATAACATCATCCACTTCCATCGTCATACCTAGAAGGACCCAGGCTGGGAATAGAGCTGCCTAAACAAAAGCCTGCATCAAAATGATATTAGTACTGACCACAATAGATATTATACCAGGGATTGAATATCATCTCCCCAGCTGCCTGACATGCACAACACGTATTGAAATAACTGAGATATGAAGGGTATGACGTTACATGACTAGCTACTTTACAACTGGTTTACAGTGGTTAGTAGTAAAAGACTCTGGTTGCCTCTCATCGGACAACAATGAATAGACACAGTCGGTGCCAAACAGTTTTAAACTTGGGTCCTTATTTTTGAGTTGGACCATTTTAAGGAGTCTTTTTGTATAATGTGTGTTTCCCTGTTGTTTTCTTAAGGCACTAACCTTAGTCAAGAACAGTAGCTAGAGGAGTTTATGGAGAACTAATGGATTGTTCCACAAAGTAGATTATTTTCTCATGGAAGTCTTATTTTCATAACGACATCAGATGAAATCAGGATTACTAGCTCTGATGAGTAAGTACTTATATTTTTCAACAAAGCCTTTGATTTGATTGAAAACTTCTGATTTATTTTGGATATCATGACAATATGAAATAGTACATTATTTTTGCACGGAAGACCAATTCAATTATTTCCCTTAGTTTGCATTTGGTTACAGATAGGTTTCTTCATTATGTTATTTGCACATCAGTACAAAGGCACTACATTACACAGACAACATGGACATCGGTCTGTGGACATCAGCATACTCATGTCATTCTAGCCCATTGGAGTGGAGAGGACCACTTGGGGTGTGTTCAATAGAGTGAAATGTAGTTCCTAGAAAATACTCCATTCACTTCCTGTTCATGTCAGGATAATGGCCCAGTAGGACAGGTTTTAGAAACAGGATATGATGCAGTGTAATGATAGGAACAGAGGGCAAGGAGGTGATGGGAACCAGACCACATtccactcctcctccttcccACTGTTCTCCTGAGGGTAGCGTTCAGTCTGACCATAACAGTGTTTCCCAAATTTGGTCCTTGGGACCCCagggggtgcacgttttgttttaatgtcccagcactacacagctgattcaaataatctaCTAATCATCAGGCTTTTGATAATAtgaatcagatgtgtagtgtTAAGGCAAAAAAACTAAACGTGCACCCGTTGGGGTCCCGAGGTTTGATTTTGGGAAATGCTGCCCTAACACCATTCTGTGCTGCTAACCTACCTATTAACCTGTTGCTGTCTAGTCACGTTGTTTGAACAGAGCTTTGGCTTTAGGTATAATGTACAAAGGTGTGCTGTGACAGATTTTTCAAAACAAAAGGGATACACTCCCTGCTTTGTTGTAAACAGGGTGTTGCTTTTGGCTTTCTGTAATAACAAAATGTTTAACTTTTTGTCACCATGAAAAAGTGTCAGCTATTCTGTTTCGATTATGTAAATTAATTGGATTTAAGTAACAGCACTTGTTTTTGTTTCGCTGTTGGTCATTTACTAGACTAAACTATAGTATTTTGAACACAGATGAAGAACAAGAATAGCTTCTAGCGGTCACTGGTTGATGAGCCAGCTAAGGGTAAGGTGTCTGTATCTGCCAATATTTGAGTTCATATTACACAGACACTGGGAGTAAAACACATTAcagaaaaatatttttaaatacattaccATAACACTAAATCACAATTCCATAATTATCTGCCAATTTTCATTCCTTGAATGTATCATGGCCACGATGATTTAATGGAGTCAGATTATACATTTAACGGAGTGCCATTAAACATGAATCGACAACCATTTCTAAAGCTGTGCATTAAGTTATAGATTTATATGTCTATAAACTATTTATTTTTTGCCCATTCTGTTTCCATTCCAGATATGAACACATTGATTAGAACCTTACCAACTCTTGTATGAACTTTGTGTTTGCTCTATTTTGGTTTCTAGACTTTCCTTCCTCTAATATAAGTATCCGTTGTTTTAAAATCCTTTTTATGTTTCTCTCTCATGAAATCTTTGTTTTTGATTTGATTGCTCAACGTTTAAGAGTGTTTTCTGAATGGAGTGAGAATTAACTGTCATACTATATGTAGAAGACAAACAAGGTACCTACCTACCTGTACGTGGTGTTGTTGAGACAAACATCCGTTTGGTTTCAGAATGGCTGGATGAAGGGCTGATGAGGGTAATGGCCTTGTTCAAATACTCTACAGATGCACCCTTCCTTACTTTAGGAAATCACTGGCCTATCACAATTGCATATGTGTTAGCAAGGACTCCAATACACAGCTTTCATCTATTCTGTCACGTTAGAACAGTGGTCGAGGAAGGAAGGAAGCGTTTTTGAACAATACCCGTCTACCTgaaccagtggtgtagtggtgactggagaagtgggtataatCATTTTGCCCCCAAAAATTCAAACGGCCCGCCCAGGGACGGAAAGGCGCCCTGTGAGAAAAATGCTATGAGAAATAGTGATacaaaccacgtttccatccagttTCATACCATATAAAaatcacgacagctgtgatgAAAACGGGTAGTTtaagtacaattttataaatacCGACATATAATTTGTTAATACGCACATGGGAtatttttgtgtcagtaaaattaattatgcgag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Function

NR:

description
equilibrative nucleoside transporter 2-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K15014 SLC29A1_2_3, ENT1_2_3; solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 1/2/3

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036958136.1 True 7427 mRNA 0.42 13 51370721 51413247

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500687 LOC106608680 coding upstream 9187 51350884 ~ 51361534 (+)
LOC110500686 LOC106608678 coding upstream 38529 51316814 ~ 51332192 (+)
LOC110500685 NA coding upstream 69525 51298879 ~ 51301196 (+)
LOC110500679 LOC106608674 coding upstream 139901 51217984 ~ 51230820 (+)
LOC110500680 LOC106608673 coding upstream 153792 51202043 ~ 51216929 (+)
LOC110500691 LOC106608684 coding downstream 43981 51457228 ~ 51485888 (+)
LOC110500694 LOC106608686 coding downstream 88351 51501598 ~ 51507145 (+)
LOC110500695 LOC106608687 coding downstream 96036 51509283 ~ 51554830 (+)
LOC110500700 LOC106608599 coding downstream 1548885 52962132 ~ 52963960 (+)
LOC110500701 LOC106608599 coding downstream 1556261 52969508 ~ 52971316 (+)
G1749659 NA non-coding upstream 5007 51365409 ~ 51365714 (+)
G1749646 NA non-coding upstream 27708 51342486 ~ 51343013 (+)
G1749644 NA non-coding upstream 29128 51341367 ~ 51341593 (+)
G1749642 NA non-coding upstream 30814 51339518 ~ 51339907 (+)
G1749649 NA non-coding downstream 124 51413371 ~ 51414218 (+)
G1749654 NA non-coding downstream 1533 51414780 ~ 51416353 (+)
G1749650 NA non-coding downstream 5722 51418969 ~ 51450475 (+)
G1749655 LOC106608688 non-coding downstream 157164 51570411 ~ 51573264 (+)
G1749651 NA other upstream 7341 51362686 ~ 51363380 (+)
gbrap gbrap other upstream 228713 51134089 ~ 51142008 (+)
LOC110500674 dulda other upstream 237383 51116362 ~ 51133346 (+)
LOC110500883 LOC106577571 other upstream 767444 50598799 ~ 50615280 (+)
LOC110500625 cj011 other upstream 1761141 49606099 ~ 49609714 (+)
G1750012 NA other downstream 658353 52071600 ~ 52079002 (+)
G1750030 LOC106608688 other downstream 681462 52094709 ~ 52095105 (+)
G1750050 NA other downstream 777953 52191200 ~ 52197007 (+)
G1751699 LOC106608599 other downstream 1549202 52962449 ~ 52972383 (+)

Expression


Co-expression Network