XLOC_036319


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_036319
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 16570519 ~ 16577750 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00072414
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>TCONS_00072415
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>TCONS_00072416
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00072414 False 7224 lncRNA 0.35 1 16570519 16577742
TCONS_00072415 False 637 lncRNA 0.42 3 16570519 16577747
TCONS_00072416 True 6762 lncRNA 0.35 3 16570519 16577750

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_036317 CU467861.7 coding downstream 4040 16565837 ~ 16566479 (-)
XLOC_036316 ttc39a coding downstream 11278 16470358 ~ 16559241 (-)
XLOC_036315 rnf11b coding downstream 106066 16424722 ~ 16464453 (-)
XLOC_036314 faf1 coding downstream 164079 16274778 ~ 16406440 (-)
XLOC_036313 NA coding downstream 301572 16263930 ~ 16268947 (-)
XLOC_036320 calr coding upstream 4589 16582339 ~ 16592491 (-)
XLOC_036321 tor3a coding upstream 19389 16597139 ~ 16609004 (-)
XLOC_036322 NA coding upstream 31872 16609622 ~ 16613663 (-)
XLOC_036323 CU467861.2 coding upstream 34185 16611935 ~ 16612017 (-)
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XLOC_036311 NA non-coding downstream 315858 16218254 ~ 16254661 (-)
XLOC_036310 CR931780.1 non-coding downstream 506109 16062172 ~ 16064410 (-)
XLOC_036309 CR931780.2 non-coding downstream 654192 15916210 ~ 15916327 (-)
XLOC_036332 BX465215.1 non-coding upstream 674489 17252239 ~ 17252354 (-)
XLOC_036335 NA non-coding upstream 1081847 17659597 ~ 17661194 (-)
XLOC_036336 NA non-coding upstream 1200110 17777860 ~ 17784911 (-)

Expression


Co-expression Network