XLOC_003634


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003634
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 37841257 ~ 37848711 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00008654
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>TCONS_00008653
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00008654 False 6188 lncRNA 0.35 3 37841257 37848711
TCONS_00008653 True 7337 lncRNA 0.34 2 37841257 37848711

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_003633 sox13 coding upstream 9481 37768298 ~ 37831776 (+)
XLOC_003632 snrpe coding upstream 115056 37720552 ~ 37726201 (+)
XLOC_003631 kif17 coding upstream 164051 37652870 ~ 37677206 (+)
XLOC_003630 sh2d5 coding upstream 189378 37638873 ~ 37651879 (+)
XLOC_003629 hp1bp3 coding upstream 207227 37612214 ~ 37634030 (+)
XLOC_003635 si:ch211-112f3.4 coding downstream 56919 37905630 ~ 37923887 (+)
XLOC_003636 NA coding downstream 146355 37995066 ~ 38000612 (+)
XLOC_003637 NA coding downstream 301177 38149888 ~ 38164754 (+)
XLOC_003638 CDK18 coding downstream 431743 38280454 ~ 38420819 (+)
XLOC_003639 mfsd4aa coding downstream 580608 38429319 ~ 38458406 (+)
XLOC_003369 CR854846.2 misc upstream 21718175 16122786 ~ 16123082 (+)
XLOC_003318 CR450764.6 misc upstream 25129261 12711700 ~ 12711996 (+)
XLOC_003317 CR450764.16 misc upstream 25146994 12693967 ~ 12694263 (+)
XLOC_003316 CR450764.11 misc upstream 25155658 12685304 ~ 12685599 (+)
XLOC_003315 CR450764.18 misc upstream 25161229 12679732 ~ 12680028 (+)
XLOC_003628 CR936337.1 non-coding upstream 476697 37364446 ~ 37364560 (+)
XLOC_003626 CABZ01065569.1 non-coding upstream 627034 37214108 ~ 37214223 (+)
XLOC_003623 NA non-coding upstream 670819 37136800 ~ 37170438 (+)
XLOC_003620 BX248521.3 non-coding upstream 846449 36994694 ~ 36994808 (+)
XLOC_003614 CR457444.3 non-coding upstream 1182618 36657025 ~ 36658639 (+)
XLOC_003640 AL929286.1 non-coding downstream 739740 38588451 ~ 38588566 (+)
XLOC_003641 NA non-coding downstream 755023 38603734 ~ 38876352 (+)
XLOC_003642 FO744851.1 non-coding downstream 954900 38803611 ~ 38803738 (+)

Expression


Co-expression Network