G1700236


Basic Information

Item Value
gene id G1700236
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 127454 ~ 129615 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1945681
ggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggataagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggataagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggttatagtaagggttaagataagggttatggtaagggttatggtaagggttatggcaagggttaaggtaagggttaagg
>TU1945682
ggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggataagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggataagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggttaagggttatggtaagggttaaggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggataagggttatggtaagggttaaggtaagggttatggtaagggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggataagggttaaggtaagggttatggtaagggttatggtaagggttaaggt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1945681 False 288 lncRNA 0.42 3 127454 129615
TU1945682 True 377 lncRNA 0.42 2 129134 129615

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942822 NA coding upstream 131499 261114 ~ 265635 (-)
LOC110517722 LOC106590767 coding upstream 216358 345973 ~ 348985 (-)
LOC118942823 NA coding upstream 451759 581374 ~ 597675 (-)
cacna2d4a cacna2d4 coding upstream 456120 585735 ~ 785374 (-)
LOC110516566 LOC106576623 coding upstream 694975 824590 ~ 851766 (-)
G1700222 NA non-coding downstream 20624 103971 ~ 106830 (-)
G1700211 NA non-coding downstream 44123 82415 ~ 83331 (-)
G1700204 NA non-coding downstream 52086 74586 ~ 75368 (-)
G1700229 NA non-coding upstream 34995 164610 ~ 204375 (-)
G1700248 NA non-coding upstream 37876 167491 ~ 177188 (-)
G1700253 NA non-coding upstream 42719 172334 ~ 173476 (-)
G1700255 NA non-coding upstream 46078 175693 ~ 176096 (-)
G1700232 NA non-coding upstream 65704 195319 ~ 257712 (-)
G1700312 NA other upstream 222872 352487 ~ 354509 (-)
LOC110511372 LOC106592130 other upstream 1189612 1319221 ~ 1348497 (-)
LOC118942825 frs2 other upstream 1239534 1363229 ~ 1446417 (-)
LOC110512520 LOC106609724 other upstream 1992914 2113042 ~ 2128710 (-)
G1701041 NA other upstream 2058818 2188433 ~ 2189666 (-)

Expression


Co-expression Network