G1700312


Basic Information

Item Value
gene id G1700312
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 352487 ~ 354509 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1945775
taaaactactactacacacctactactgctgctactactacaactactaatactaccactactactaccaatgatactactaccattactactaccactactacacacctactactgctgctactactactaccactactaccactattaccactaatacaactactactactactactaccactattaccagTAATACAACTACTACCAAtaacactactattactactgctaatactgctacaaccactactaccagtattaccactactaccacaactactactaccactattaccactaatacaactactaataccaccactattaccactactgccactactacacacctacaactactgctgctactactactactactaccactactactaataataataatactactactactaccaccactactaccactatttccactaatacaactactactactactacttttaccacaaaaagtactactactaacactactactactactaatactgctactactacaattacaacaactactactactactactacttccactaccactactaccactactactaccactacaacaactactactactacaacaacgactactactattaccaccattactactactaccactactactactactactactagtactaccactactactaccacgactactactaccacaactactaccactactaccactactactactactactactaccacttctattactactaccactaacactactaccaccactactattactactactaccaccactaccactactactaccaccaattctactactactactactaccacgacCACTACTACCACTTCTTCTatcactactaacactactactaccactactacaactaccactactactaccacgactactactaccacttcttctatcactactaccactactactaccactactacaactaccaccactaccactactactactactgctactactactacttccactactactaccactactattactactactagtactactactactactaccacgaccactactaccacttcttctatcactactaccactactactaccactactacaactaccaccactactaccatgactactactaccacaactaccaccactaccactactacttctactgctactactacttccactactactaccactactactattactactactagtactactactactactactaccacgacCACTACTACCACTTCTTCTATCactcctaccactactactaccactaatactactactactaccaccactactaccacgactactactactaccaccactactattactactactaccaccactaccactactactactaccaattctactactactactactaccacgaccactactaccacttcttctatcactactaccactactactactactactaccaccactactaccatgactactactaccacaactactaccactaccactactactactactaccactactactactactattactactactgctacaaccactactaccactactactaccgccactaccactactacacacctactactgctgctactagtactaccaccactattactacaactactagtactaacactaccactactactactactaccactattttcactactaccaccactactaccactactactactactactactacacctactactattactactacttccactactactactactaccactattttcactactacaactattaccaccattatcactactacaactattaccactattttcactactaccaccactactactactactactactgcaactactactattacta

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1945775 True 1948 TUCP 0.39 2 352487 354509

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110517722 LOC106590767 coding downstream 3502 345973 ~ 348985 (-)
LOC118942822 NA coding downstream 86852 261114 ~ 265635 (-)
LOC118942823 NA coding upstream 226865 581374 ~ 597675 (-)
cacna2d4a cacna2d4 coding upstream 231226 585735 ~ 785374 (-)
LOC110516566 LOC106576623 coding upstream 470081 824590 ~ 851766 (-)
LOC110511372 LOC106592130 coding upstream 964712 1319221 ~ 1348497 (-)
LOC110527029 LOC106592131 coding upstream 994090 1348599 ~ 1357031 (-)
G1700311 NA non-coding downstream 46 351654 ~ 352441 (-)
G1700305 NA non-coding downstream 20231 331521 ~ 332256 (-)
G1700290 NA non-coding downstream 83496 268758 ~ 268991 (-)
G1700232 NA non-coding downstream 94775 195319 ~ 257712 (-)
G1700318 NA non-coding upstream 16388 370897 ~ 372853 (-)
G1700319 NA non-coding upstream 22700 377209 ~ 413123 (-)
G1700358 NA non-coding upstream 122394 476903 ~ 550576 (-)
G1700365 NA non-coding upstream 133785 488294 ~ 489821 (-)
G1700385 NA non-coding upstream 187932 542441 ~ 543472 (-)
LOC118942825 frs2 other upstream 1014640 1363229 ~ 1446417 (-)
LOC110512520 LOC106609724 other upstream 1768020 2113042 ~ 2128710 (-)
G1701041 NA other upstream 1833924 2188433 ~ 2189666 (-)
G1701824 NA other upstream 2218165 2572603 ~ 2577051 (-)

Expression


Co-expression Network