G1701238


Basic Information

Item Value
gene id G1701238
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 2773429 ~ 2774646 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1946965
gtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcaaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatgtttagctaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatgtttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcaaatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatggttggctaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttaacaaatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatacacatggttagctaatgttattggtcacatacacatgtttagcaaatgttattggtcacatacacatggttagcagatgttattggtcacatggttagcagatgttattggtcacatacacatgat

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1946965 True 1095 lncRNA 0.37 2 2773429 2774646

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942987 NA coding upstream 41616 2730641 ~ 2731813 (+)
LOC110519348 tbc1d15 coding upstream 106151 2588642 ~ 2667278 (+)
LOC110519746 LOC106597902 coding upstream 192970 2579232 ~ 2580459 (+)
LOC110500958 LOC106609839 coding upstream 198247 2541008 ~ 2575182 (+)
LOC110499736 NA coding upstream 233377 2533735 ~ 2540052 (+)
LOC110499725 trhde coding downstream 45241 2819887 ~ 3237572 (+)
LOC110516257 LOC106590998 coding downstream 610810 3385456 ~ 3391594 (+)
irak3 irak3 coding downstream 769006 3543652 ~ 3562592 (+)
helb LOC106599032 coding downstream 790993 3565639 ~ 3583498 (+)
LOC110516816 LOC107655592 coding downstream 1609370 4384016 ~ 4441236 (+)
G1701236 NA non-coding upstream 9388 2763690 ~ 2764041 (+)
G1701234 NA non-coding upstream 17364 2755607 ~ 2756065 (+)
G1701230 NA non-coding upstream 29503 2740121 ~ 2743926 (+)
G1701204 NA non-coding upstream 71389 2633953 ~ 2702040 (+)
G1701260 NA non-coding downstream 46694 2821340 ~ 2822497 (+)
G1701243 NA non-coding downstream 52368 2827014 ~ 2841800 (+)
G1701265 NA non-coding downstream 70058 2844704 ~ 2849603 (+)
G1701266 NA non-coding downstream 78336 2852982 ~ 2854177 (+)
G1701279 NA non-coding downstream 104086 2878732 ~ 2879497 (+)
G1699934 NA other upstream 903875 1867694 ~ 1869554 (+)
LOC110499743 cnot2 other upstream 1004152 1688942 ~ 1769720 (+)
LOC110500915 LOC106576535 other upstream 1104209 1607414 ~ 1669220 (+)
G1699804 NA other upstream 1234549 1537956 ~ 1538880 (+)
G1701596 NA other downstream 999393 3774039 ~ 3776261 (+)
G1701654 NA other downstream 1158141 3932787 ~ 3936037 (+)
G1702554 NA other downstream 1620347 4394993 ~ 4395515 (+)

Expression


Co-expression Network