G1704379


Basic Information

Item Value
gene id G1704379
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 7088765 ~ 7091475 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1951376
CTGTTAGTGGTGTCTGATAGAGTGGTTCAGTAAAACACCAGTCTATTTCAGTGGTACAGTATAACACCAGTCTGTTAGTGGtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtatAACACCAGTCTGTTTCAGATGTACAGTAAAACACTggtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacattaaaacaccagtctattagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtatattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctaTTAGTGGTGTCGGTTTCAGTGGtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacattaaaacaccagtctattagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctaTTAGTGGTGTCGGTTTCAGTGGtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcggtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtgttacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctaTTAGTGGTGTCGGTTTCAGTGGtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctaTTAGTGGTGTCGGTTTCAGTGGTACAGTATAACACCagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaAACACCAGTATATTAGTGGTGCCTGTTTCACAAGtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcacaggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcattggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtatAACAGAGGCGCATGCTAGAGGCCACAGATGCTACAAATTCAGTTTTTTTGGCACGATGTCCGATTGCAATCTAAAAGTTGACATTATTATCTACGGAAGCAGACTGAGCGTTTTAAGAGTGACGGACGGCTGTCACCGGCTCGTTCAG
>TU1951378
CTGTTAGTGGTGTCTGATAGAGTGGTTCAGTAAAACACCAGTCTATTTCAGTGGTACAGTATAACACCAGTCTGTTAGTGGtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtatAACACCAGTCTGTTTCAGATGTACAGTAAAACACTggtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacattaaaacaccagtctattagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgttagtggtgtctgtttcacaggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctattagtggtgtctgtttcattggtacagtataacaccagtctgtttcagtggtacagtaaaacaccagtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtataacaccagtctattagtggtgtctgtttcagtggtacagtatAACAGAGGCGCATGCTAGAGGCCACAGATGCTACAAATTCAGTTTTTTTGGCACGATGTCCGATTGCAATCTAAAAGTTGACATTATTATCTACGGAAGCAGACTGAGCGTTTTAAGAGTGACGGACGGCTGTCACCGGCTCGTTCAG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106590458, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1951376 False 2627 lncRNA 0.41 2 7088765 7091475
TU1951378 True 1057 lncRNA 0.42 2 7088765 7091475

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942846 LOC105029310 coding downstream 37858 7048896 ~ 7050907 (-)
LOC118942845 LOC106590959 coding downstream 171229 6890523 ~ 6917536 (-)
LOC118942797 NA coding downstream 570419 6517888 ~ 6518853 (-)
LOC110499738 lmo3 coding downstream 899955 6067135 ~ 6188810 (-)
LOC118942843 NA coding downstream 1137154 5950034 ~ 5963423 (-)
LOC118942847 LOC106593057 coding upstream 212130 7303605 ~ 7307397 (-)
LOC118942848 LOC106594098 coding upstream 289104 7379889 ~ 7384439 (-)
LOC118936572 LOC108250668 coding upstream 499053 7585971 ~ 7768303 (-)
LOC110516645 LOC106597241 coding upstream 745675 7837150 ~ 7899175 (-)
LOC118942852 NA coding upstream 797436 7888911 ~ 7890273 (-)
G1704373 NA non-coding downstream 5286 7083158 ~ 7083479 (-)
G1704305 NA non-coding downstream 43992 7043785 ~ 7044773 (-)
G1704337 NA non-coding downstream 107004 6981471 ~ 6981761 (-)
G1704330 NA non-coding downstream 140835 6947657 ~ 6947930 (-)
G1704328 NA non-coding downstream 149559 6938788 ~ 6939206 (-)
G1704384 NA non-coding upstream 6706 7098181 ~ 7098411 (-)
G1704385 NA non-coding upstream 7658 7099133 ~ 7099335 (-)
G1704387 NA non-coding upstream 8581 7100056 ~ 7100305 (-)
G1704391 NA non-coding upstream 12803 7104278 ~ 7104770 (-)
G1704402 NA non-coding upstream 34126 7125601 ~ 7127443 (-)
G1704098 NA other downstream 382920 6700898 ~ 6705845 (-)
G1703896 NA other downstream 745583 6342741 ~ 6343182 (-)
G1703878 NA other downstream 780545 6305553 ~ 6308220 (-)
G1703669 NA other downstream 1092339 5984365 ~ 5996426 (-)
G1704410 NA other upstream 58090 7149565 ~ 7149979 (-)
G1704412 NA other upstream 65215 7156690 ~ 7157057 (-)
G1704702 NA other upstream 206450 7297925 ~ 7299086 (-)
G1704700 NA other upstream 207725 7299200 ~ 7301845 (-)
G1704726 NA other upstream 274072 7365547 ~ 7366140 (-)

Expression


Co-expression Network