G1704709


Basic Information

Item Value
gene id G1704709
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 7271363 ~ 7273200 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1951813
tatgtaaactactgacccactgggaatgtgatgaaagaaataaaagctgaaataaatcattctctctactattattctcacatttcacattcttaaaataaagtggggatcctaactgacctaagacagggaatttttacgaggattaaatgtcaggaattgtgaaaaactgagtttaaatgtatttggctaaggtgtctgtAAATTTCCAACGTCAACTGTATGTAaccatggaacactagtcactttaataatggaacactagtcactttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactagtcactttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactagtcactttaataatggaacactagtcactttaataatggaacactggtccttttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactagtcacttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactgatcactttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactgatcactttaataacggaacactggtcactgtaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactttaataatggaacaccggtccctttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactgatcactttaataatggagcactgatcactttaataatggaacactgatcactttaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtccctttaatattggaacactggtcactttaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactggtccctttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactggtcactttaataatggaacactggtcactataataatggaacaccagtcactttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacgctggtccctttaataatggaacactggtcactgtaataatggaacactggtccctttaataatgtttacatactgttttacta

Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1951813 True 1332 lncRNA 0.35 4 7271363 7273200

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942846 LOC105029310 coding downstream 220456 7048896 ~ 7050907 (-)
LOC118942845 LOC106590959 coding downstream 353827 6890523 ~ 6917536 (-)
LOC118942797 NA coding downstream 753017 6517888 ~ 6518853 (-)
LOC110499738 lmo3 coding downstream 1082553 6067135 ~ 6188810 (-)
LOC118942843 NA coding downstream 1319752 5950034 ~ 5963423 (-)
LOC118942847 LOC106593057 coding upstream 30405 7303605 ~ 7307397 (-)
LOC118942848 LOC106594098 coding upstream 107379 7379889 ~ 7384439 (-)
LOC118936572 LOC108250668 coding upstream 317328 7585971 ~ 7768303 (-)
LOC110516645 LOC106597241 coding upstream 563950 7837150 ~ 7899175 (-)
LOC118942852 NA coding upstream 615711 7888911 ~ 7890273 (-)
G1704708 NA non-coding downstream 99 7270201 ~ 7271264 (-)
G1704435 NA non-coding downstream 7268 7263751 ~ 7264095 (-)
G1704428 NA non-coding downstream 22383 7248767 ~ 7248980 (-)
G1704416 NA non-coding downstream 35057 7236060 ~ 7236306 (-)
G1704407 NA non-coding downstream 140473 7130659 ~ 7130890 (-)
G1704710 NA non-coding upstream 11973 7285173 ~ 7285693 (-)
G1704693 NA non-coding upstream 12793 7285993 ~ 7288950 (-)
G1704696 NA non-coding upstream 15921 7289121 ~ 7289736 (-)
G1704705 NA non-coding upstream 17975 7291175 ~ 7291763 (-)
G1704698 NA non-coding upstream 18893 7292093 ~ 7294556 (-)
G1704412 NA other downstream 114306 7156690 ~ 7157057 (-)
G1704410 NA other downstream 121384 7149565 ~ 7149979 (-)
G1704098 NA other downstream 565518 6700898 ~ 6705845 (-)
G1703896 NA other downstream 928181 6342741 ~ 6343182 (-)
G1703878 NA other downstream 963143 6305553 ~ 6308220 (-)
G1704702 NA other upstream 24725 7297925 ~ 7299086 (-)
G1704700 NA other upstream 26000 7299200 ~ 7301845 (-)
G1704726 NA other upstream 92347 7365547 ~ 7366140 (-)

Expression


Co-expression Network