G1704693


Basic Information

Item Value
gene id G1704693
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 7285993 ~ 7288950 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1951781
acgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgatatccaaCCCCCCCCTGTCCCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAATGATATCCAATCCCCCCCCCCCTCCTGTCcctaacaacccccccccccccccattctgtccctaacaatcccccccccctcccctcctgtccctAACAATCCTCCCTAGGCCAAAGCCACTTCCTGTCACGCCCCATCCTCAAAAAGACTGAAGTCCCAGTAGGAACCAGGCTGAAAACAAAACACTATTTCTTTAAATCCCTTGTAGTACTAGGGAACGGTTGATTTCTTCCATGGACCTTAAGGTGTGAAAGCTAACGAATGTCTGTCATTATGTTAAATTGGTTCATTCAGGACACTACTATACGGTACACTGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGGTATAGTCTGGAAATGATGAGGTCCTCGTTTTGATCACTTTTGGAATCTCATCATATAAAAAACATTTCAATAAATTACTAAAAGTCTGATTTCTGCTCATTGAttcaaaaagtgtgtgtgtgttaccgttaACCTCCTTAAAG
>TU1951782
cctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcttgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgtgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgtgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAACGCGATCCAATCCTCCTCCTATCTCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgatatccaaCCCCCCCCTGTCCCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAATGATATCCAATCCCCCCCCTTCTGTCCCTAACAATCCCCCCCCCTCCTGTCCCTaacaatcccccccTAGGCCAAAGCCACTTCCTGTCACGCCCCATCCTCAAAAAGACTGAAGTCCCAGTAGGAACCAGGCTGAAAACAAAACACTATTTCTTTAAATCCCTTGTAGTACTAGGGAACGGTTGATTTCTTCCATGGACCTTAAGGTGTGAAAGCTAACGAATGTCTGTCATTATGTTAAATTGGTTCATTCAGGACACTACTATACGGTACACTGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGGTATAGTCTGGAAATGATGAGGTCCTCGTTTTGATCACTTTTGGAATCTCATCATATAAAAAACATTTCAATAAATTACTAAAAGTCTGATTTCTGCTCATTGAttcaaaaagtgtgtgtgtgttaccgttaACCTCCTTAAAG
>TU1951783
cctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcttgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgtgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgtgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAACGCGATCCAATCCTCCTCCTATCTCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaatgatatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAATGATATCCAACCCCTCCTGTCCCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatGAACGCGATCCAACCCCCCCCTGTCCCTGGTATGAACGCGAtccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatgaacgcgatccaatcctcctcctgtccctggtatGAATGATATCCAATCCCCCCCCTTCTGTCCCTAACAATCCCCCCCCCTCCTGTCCCTaacaatcccccccTAGGCCAAAGCCACTTCCTGTCACGCCCCATCCTCAAAAAGACTGAAGTCCCAGTAGGAACCAGGCTGAAAACAAAACACTATTTCTTTAAATCCCTTGTAGTACTAGGGAACGGTTGATTTCTTCCATGGACCTTAAGGTGTGAAAGCTAACGAATGTCTGTCATTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTACTATACTGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTGTGTTAAGTTGGTTCATTCAGGACACTGCTATACGGTACAATGTCTGTCATTATGTTAAGTTGGTGAAGAAGAAGAAGGTATAGTCTGGAAATGATGAGGTCCTCGTTTTGATCACTTTTGGAATCTCATCATATAAAAAACATTTCAATAAATTACTAAAAGTCTGATTTCTGCTCATTGAttcaaaaagtgtgtgtgtgttaccgttaACCTCCTTAAAG

Function

NR:

description
PREDICTED: histidine-rich protein PFHRP-II-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1951781 False 1317 lncRNA 0.46 3 7285993 7288950
TU1951782 False 1744 lncRNA 0.47 3 7285993 7288161
TU1951783 True 1846 lncRNA 0.49 4 7285993 7288161

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942846 LOC105029310 coding downstream 235086 7048896 ~ 7050907 (-)
LOC118942845 LOC106590959 coding downstream 368457 6890523 ~ 6917536 (-)
LOC118942797 NA coding downstream 767647 6517888 ~ 6518853 (-)
LOC110499738 lmo3 coding downstream 1097183 6067135 ~ 6188810 (-)
LOC118942843 NA coding downstream 1334382 5950034 ~ 5963423 (-)
LOC118942847 LOC106593057 coding upstream 14655 7303605 ~ 7307397 (-)
LOC118942848 LOC106594098 coding upstream 91629 7379889 ~ 7384439 (-)
LOC118936572 LOC108250668 coding upstream 301578 7585971 ~ 7768303 (-)
LOC110516645 LOC106597241 coding upstream 548200 7837150 ~ 7899175 (-)
LOC118942852 NA coding upstream 599961 7888911 ~ 7890273 (-)
G1704710 NA non-coding downstream 300 7285173 ~ 7285693 (-)
G1704709 NA non-coding downstream 12793 7271363 ~ 7273200 (-)
G1704708 NA non-coding downstream 14729 7270201 ~ 7271264 (-)
G1704435 NA non-coding downstream 21898 7263751 ~ 7264095 (-)
G1704428 NA non-coding downstream 37013 7248767 ~ 7248980 (-)
G1704696 NA non-coding upstream 171 7289121 ~ 7289736 (-)
G1704705 NA non-coding upstream 2225 7291175 ~ 7291763 (-)
G1704698 NA non-coding upstream 3143 7292093 ~ 7294556 (-)
G1704721 NA non-coding upstream 60595 7349545 ~ 7350511 (-)
G1704694 NA non-coding upstream 63312 7352262 ~ 7353242 (-)
G1704412 NA other downstream 128936 7156690 ~ 7157057 (-)
G1704410 NA other downstream 136014 7149565 ~ 7149979 (-)
G1704098 NA other downstream 580148 6700898 ~ 6705845 (-)
G1703896 NA other downstream 942811 6342741 ~ 6343182 (-)
G1703878 NA other downstream 977773 6305553 ~ 6308220 (-)
G1704702 NA other upstream 8975 7297925 ~ 7299086 (-)
G1704700 NA other upstream 10250 7299200 ~ 7301845 (-)
G1704726 NA other upstream 76597 7365547 ~ 7366140 (-)

Expression


Co-expression Network