G1704698


Basic Information

Item Value
gene id G1704698
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 7292093 ~ 7294556 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1951793
CACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCTTCCTTTAGTACCAGAACCCATGTACTACCAGATTAGTCTTCCTTTAGTTCCATGTACTACCAGATTAGTCCTCCTAAAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCATGTAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTAGAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCACGTTCTACCAAATTAGTCCTCCTTTAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGGACCGTGTTCTACCAGAAACAGTGGATTATATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTAGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGGGATTATATATGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACATTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACATTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAA
>TU1951794
CACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTTCCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCTTCCTTTAGTACCAGAACCCATGTACTACCAGATTAGTCTTCCTTTAGTTCCATGTACTACCAGATTAGTCCTCCTAAAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCATGTAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTATTCCTCCTTTAGTCCCATGTTCTACCAGATTAGTCTTCCGATAGTGCCAGACCCCTTGTTCCACCAGATTAGTCCTCCTAGAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCACGTTCTACCAAATTAGTCCTCCTTTAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGGACCGTGTTCTACCAGAAACAGTGGATTATATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTAGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAA
>TU1951797
ACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATAAATCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTATTCCTCCTTTAGTCCCATGTTCTACCAGATTAGTCTTCCGATAGTGCCAGACCCCTTGTTCCACCAGATTAGTCCTCCTAGAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATCGTACCAGACCCCACGTTCTACCAAATTAGTCCTCCTTTAGAACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGGACCGTGTTCTACCAGAAACAGTGGATTATATCTGGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAAACAGTGGATTATCTAGTGTGTATGGTGCTGTGTGGAA
>TU1951796
ACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATAAATCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTAACACATTCTACCAGATAAGTCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATAAGTCCTCCATTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATAAGTCCTCCTTTAGTACCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATAAGTCCTCCATTAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTTCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTTTAGTACCAGACCCCATGTTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTATAGTACCACATTCTACCAGATTAGTCCTCCTAT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1951793 False 574 lncRNA 0.42 2 7292093 7292776
TU1951794 False 609 lncRNA 0.43 2 7292093 7292776
TU1951797 False 1442 lncRNA 0.42 3 7292093 7294556
TU1951796 True 1551 lncRNA 0.41 2 7292878 7294556

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942846 LOC105029310 coding downstream 241186 7048896 ~ 7050907 (-)
LOC118942845 LOC106590959 coding downstream 374557 6890523 ~ 6917536 (-)
LOC118942797 NA coding downstream 773747 6517888 ~ 6518853 (-)
LOC110499738 lmo3 coding downstream 1103283 6067135 ~ 6188810 (-)
LOC118942843 NA coding downstream 1340482 5950034 ~ 5963423 (-)
LOC118942847 LOC106593057 coding upstream 9049 7303605 ~ 7307397 (-)
LOC118942848 LOC106594098 coding upstream 86023 7379889 ~ 7384439 (-)
LOC118936572 LOC108250668 coding upstream 295972 7585971 ~ 7768303 (-)
LOC110516645 LOC106597241 coding upstream 542594 7837150 ~ 7899175 (-)
LOC118942852 NA coding upstream 594355 7888911 ~ 7890273 (-)
G1704705 NA non-coding downstream 330 7291175 ~ 7291763 (-)
G1704696 NA non-coding downstream 2357 7289121 ~ 7289736 (-)
G1704693 NA non-coding downstream 3143 7285993 ~ 7288950 (-)
G1704710 NA non-coding downstream 6400 7285173 ~ 7285693 (-)
G1704709 NA non-coding downstream 18893 7271363 ~ 7273200 (-)
G1704721 NA non-coding upstream 54989 7349545 ~ 7350511 (-)
G1704694 NA non-coding upstream 57706 7352262 ~ 7353242 (-)
G1704697 NA non-coding upstream 60326 7354882 ~ 7355953 (-)
G1704692 NA non-coding upstream 61559 7356115 ~ 7359498 (-)
G1704722 NA non-coding upstream 66835 7361391 ~ 7364261 (-)
G1704412 NA other downstream 135036 7156690 ~ 7157057 (-)
G1704410 NA other downstream 142114 7149565 ~ 7149979 (-)
G1704098 NA other downstream 586248 6700898 ~ 6705845 (-)
G1703896 NA other downstream 948911 6342741 ~ 6343182 (-)
G1703878 NA other downstream 983873 6305553 ~ 6308220 (-)
G1704702 NA other upstream 3369 7297925 ~ 7299086 (-)
G1704700 NA other upstream 4644 7299200 ~ 7301845 (-)
G1704726 NA other upstream 70991 7365547 ~ 7366140 (-)

Expression


Co-expression Network