G1717720


Basic Information

Item Value
gene id G1717720
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 23133232 ~ 23134409 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1967964
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>TU1967968
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>TU1967976
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>TU1967979
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>TU1967980
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Function

NR:

description
unnamed protein product, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1967964 False 1118 lncRNA 0.39 2 23133232 23134409
TU1967968 False 1122 lncRNA 0.39 2 23133232 23134409
TU1967972 False 1128 lncRNA 0.39 2 23133232 23134409
TU1967976 False 1132 lncRNA 0.38 2 23133232 23134409
TU1967979 False 1126 lncRNA 0.39 2 23133232 23134409
TU1967980 True 1134 lncRNA 0.38 2 23133232 23134409

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
amdhd1 amdhd1 coding upstream 28226 23100978 ~ 23105006 (+)
ruxf LOC105021811 coding upstream 32409 23098972 ~ 23100823 (+)
LOC110500039 LOC100194705 coding upstream 92407 23033725 ~ 23040825 (+)
LOC110500038 LOC106609436 coding upstream 100812 23014617 ~ 23032420 (+)
LOC110501029 LOC106609386 coding upstream 212873 22914831 ~ 22920359 (+)
klhl42 LOC106609448 coding downstream 22674 23157083 ~ 23160673 (+)
LOC110500046 LOC106609461 coding downstream 29696 23164105 ~ 23189656 (+)
ascl1a LOC106576285 coding downstream 84535 23218944 ~ 23220765 (+)
LOC110500049 LOC106576281 coding downstream 161374 23295783 ~ 23313876 (+)
th2 LOC106609447 coding downstream 179926 23314335 ~ 23327014 (+)
G1717689 NA non-coding upstream 1526 23121884 ~ 23131706 (+)
G1717688 NA non-coding upstream 24796 23108190 ~ 23108436 (+)
G1717655 NA non-coding upstream 148332 22983213 ~ 22984900 (+)
G1717652 nduac non-coding upstream 151766 22980144 ~ 22981466 (+)
G1717653 NA non-coding upstream 153637 22979500 ~ 22979595 (+)
G1717725 LOC106609435 non-coding downstream 12348 23146757 ~ 23147769 (+)
G1717730 LOC106576289 non-coding downstream 27197 23161606 ~ 23162406 (+)
G1717680 NA non-coding downstream 45136 23179545 ~ 23184074 (+)
G1717749 NA non-coding downstream 63629 23198038 ~ 23209398 (+)
G1717520 NA other upstream 253309 22820752 ~ 22879923 (+)
G1717517 NA other upstream 281825 22849892 ~ 22851407 (+)
G1717516 NA other upstream 348787 22718919 ~ 22784445 (+)
G1717785 NA other downstream 121717 23256126 ~ 23256812 (+)
G1719225 NA other downstream 938996 24073405 ~ 24074448 (+)
G1719268 NA other downstream 1001355 24135764 ~ 24136323 (+)
adm2a LOC106609361 other downstream 1143422 24277797 ~ 24294858 (+)
LOC110500097 LOC106576231 other downstream 1182229 24315919 ~ 24321712 (+)

Expression


Co-expression Network