XLOC_003676 (CABZ01087025.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003676
gene name CABZ01087025.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 41192329 ~ 41201272 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00007140
TACTACAGTAGCTGATATTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGTATTCTGCTCTGCTGTTGTTGAAGAAACCGGAGATGGAGAGGTACCGGTTGTGTATAGTGTTTCCATTGTAGAAGATTTCGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCTTCTGTTGTGAAGGATGTTGATTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGAAGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACCGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTCGTTTCCATTGTAGAAGATTCTGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTGGGGGAACTATCAGAATTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATATTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACCGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATAGTGTTTCCATTGTAGAAGATTCAGATGTGGTTGTAGTCTCAGTGGACTCTTCTGTTTTGAAGGGTGTTGATTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGATTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTTTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGAAGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGAATTCTGCTCTTCTGTTGTTGAAGTTACTGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTTGTTGCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTTGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATGTTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACAGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTTTATTGTAGTTTCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTATGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGCTTGTTCTACAGTAGCTGATGTTATTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGTAGTCTGCTTTTCTGATGTGGAAGTTCCTTGAGATGTAGAGGTACCTGTTGCGTATAGTGTAGTTTCCAGTGTTGGACCAGTTTTCTTTGTAGATGTTTCAAATGAGGTCACAGGGAACTCGTCTGTTGTAAGTGATGTAGATTCTGTTTTTGTGGTACAAATAGTAGGGCTGTTTTTTGTCTGTTGGCTTGTGGTTTTTTCAGCAGTAGCTGAAGATATTTCAGTTGTAAACTCAGAACATTGATCTGTTGTGAATAAAGTAGTTTTAGTCGTAGTATACcaaattatttataacatttaattataGAGCTGTGAACAACTGCACATTTAACATACCATGGATTAATAATTGCATGAGTTTTACCAAGATAACATCAGTCTTTGTACTAGATTGATGCTACTGTATAACAGCTACTATCAatcattttaagttttaaaatgtgCTATTATTTTAGATGATTACAAAGATTGTTTTATATTGAAGACATTGGGTACATTATGAACTGTACTTGTATTACTGGAAGATGTGAATTGAATTGTTCAATCGTTCATATATTACACAATTCCACTTAAAGAATAGCCAGTTTCTATTGTAGTTTCAGTGTCTTTGTTTATCTTAAGCCATTATCATTTTTGGTTGTCACATTCATCTTTTAACTCCAACATACATTTTAGATTGATTAAAATGTGGAGATAATCATTAAAATTCTGTAGAAACTTACCTGTGTTTGCTCCAATGCAGATGAAATGCAGCAGCAGAAGTAAGGCAATAAAGTGCAGTATTTTCCATAAATACATGTTTAGAAAGTTCCTGTAAGATGGTTGTTTTTGtttgaaatgaaaatgatttaGCCAATTGCAAATGCACCAGCCATCAGTGTGTCTCCTCTGTTAAATTTCAACATCAACCAGCAACAAGATGTGTGCATGCTCCCTGCAAACAATAAATGTCATAAGGTATGGCCTCTTTTGCATTAAAAACCATGTTCACACCTTAAGTAAACCACAGTACGCTGATTGGAAGTTTATGTGGTTTTGAAAGGTCAGAACAGTTATATGACCTTGTCTTCTTGTTACACCCTTCCCAAGAAATGAGAAAAACATATACTTTcactttttcatttgtttgtctttTTCAAAATAGTATTTGCTCTCAGTTGTGATATGTACATTTAAGACAATAAGATCTGTTTAACCAGACATTAGGAAAGATTGTGTACACACATTACAATAAACCACCAAAGTTTTACAGTAAGTTCAGTGCCAATTTCAGTTTCAttcactgcattttatttagaaaatctGTGCTTGTACTGTTATCTAACTAATTTTTGCTAATTATAAATGATTTAAGGTACTGAATACAGCATAGTTAaacaacatacaaacaaaaaaagccaaTTACCTGAAAGTTAAACATAGTTAGATCCAATAAAGTTGTTTCTCAACAATATAATCCAGGTGATTAGAATCTCTGAAAGCAGTGATTTCTTGTTTACTTATATTTgaagtatatttttgttttgttttgtagccTAATAGACGATGGACTGGAAAATCACTCTATAATATTTCACTCTATCATGTTACAACCCTTCAGGAACTAATAGGTTGAACAGTTAATCCTGCAAACGTAACCGCTTGTTTGAACCAGTCAGAATACAGGAAATAAACTGATATGTTTCAGAAGTTGCTGTGTGGTTGCTATGTTATCTATAGACATTGATGGGTCACTCCTTCAATGTAGGTCTGTGTGTTATCGTATGCCAAAAGTCGTAAATCAGCACCACTCTTCAACAAGTCATAGGATTTTGGGTAGCACTCATGTCCATCACTTGAACAATGCAGTTCCTGAAACATAATACTTAATATTGTAATACTTGGTAACGTTGGTTTCTTTTGTTCTTATGACGTTCTATAAAAAGCAGTGCTCACTTTGTTTTAATGAATTTCGCATGGCAACCACAGGAAAACAATGGCATTAAATATGCTCTTGGCATTAAATATGTTCTTGACCTATGGTCACGTTCTCCACACCTGTTTgctatttcaaaatgtttttgagTCATAG
>TCONS_00007141
CTGATATTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGTATTCTGCTCCTCTGTTGTTGAAGTTACCGGAGATGCAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTCGTTTCCATTGTAGAAGATTCTGATGTTATTGTAGTCCCAGTGGACTCTTCTGTTGTAAAGGGTGTTGATTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGATTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTTTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGAAGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGAATTCTGCTCTTCTGTTGTTGTAGTTACAGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTTTATTGTAGTTTCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTTTGTTGGCTTGTGGTTGGTACTACAGTAGCTGATATTGTTTCGGTTGTAAACTCAGTCATAAATAATGTTTTCTGCTCCTCTGTTGTTGAAGTTACTGGAGATGCAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTCGTTGCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGGTTGTAGTCCCAGTGAACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTGGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATATTGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACCGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTCGTTTCCATCGTAGAAGATTCTGATTTGATTGTTGTCCCAGTGGATTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTTGGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAATAGCTGATATTGTTTTGGTTGTAAACTCAGTCATAGATAATGTATTCTGCTCCTCTGTTGTTGAAGTTACTGGAGATGCAGAGCTACCTGTTGTGTATAATGTTTCCATTGTAGAAGATTCAGATGTGGTTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGGTATTGTGGGGGAACTAACAGGATTGGTTTGTATCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATATTGTTTCGGTTGTAAACTCAGTCATAGATAATGTAGTCTGCTCTTCTGTTTTTGAAGTTACTAGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATACTGTAGTTTTCATTGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTTGTCCTAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGAAGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACCGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTCGTTTCCATTGTAGAAGATTCTGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTGGGGGAACTATCAGAATTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATATTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACCGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATAGTGTTTCCATTGTAGAAGATTCAGATGTGGTTGTAGTCTCAGTGGACTCTTCTGTTTTGAAGGGTGTTGATTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGATTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTTTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGAAGTTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGAATTCTGCTCTTCTGTTGTTGAAGTTACTGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTATATTGTTGTTGCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTTGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGGTATTGTGGGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGTTAGTTCTACAGTAGCTGATGTTGTTTCAGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATgtattctgctcttctgttgtTGAAGTTACAGGAGATGGAGAGGTACCTGTTGTGTTTATTGTAGTTTCCATCGTAGAAGATTCCGATGTGATTGTAGTCCCAGTGGACTCttctgttgtgaagggtgttgaTTCTGTTATTGTATGGGAACTATCAGGACTGGTTTGTGTCTGTTGGCTTGTGGCTTGTTCTACAGTAGCTGATGTTATTTCTGTTGTAAACTCAGTCATAGATGATGTAGTCTGCTTTTCTGATGTGGAAGTTCCTTGAGATGTAGAGGTACCTGTTGCGTATAGTGTAGTTTCCAGTGTTGGACCAGTTTTCTTTGTAGATGTTTCAAATGAGGTCACAGGGAACTCGTCTGTTGTAAGTGATGTAGATTCTGTTTTTGTGGTACAAATAGTAGGGCTGTTTTTTGTCTGTTGGCTTGTGGTTTTTTCAGCAGTAGCTGAAGATATTTCAGTTGTAAACTCAGAACATTGATCTGTTGTGAATAAAGTAGTTTTAGTCGTAGTATACcaaattatttataacatttaattataGAGCTGTGAACAACTGCACATTTAACATACCATGGATTAATAATTGCATGAGTTTTACCAAGATAACATCAGTCTTTGTACTAGATTGATGCTACTGTATAACAGCTACTATCAatcattttaagttttaaaatgtgCTATTATTTTAGATGATTACAAAGATTGTTTTATATTGAAGACATTGGGTACATTATGAACTGTACTTGTATTACTGGAAGATGTGAATTGAATTGTTCAATCGTTCATATATTACACAATTCCACTTAAAGAATAGCCAGTTTCTATTGTAGTTTCAGTGTCTTTGTTTATCTTAAGCCATTATCATTTTTGGTTGTCACATTCATCTTTTAACTCCAACATACATTTTAGATTGATTAAAATGTGGAGATAATCATTAAAATTCTGTAGAAACTTACCTGTGTTTGCTCCAATGCAGATGAAATGCAGCAGCAGAAGTAAGGCAATAAAGTGCAGTATTTTCCATAAATACATGTTTAGAAAGTTCCTGTAAGATGGTTGTTTTTGtttgaaatgaaaatgatttaGCCAATTGCAAATGCACCAGCCATCAGTGTGTCTCCTCTGTTAAATTTCAACATCAACCAGCAACAAGATGTGTGCATGCTCCCTGCAAACAATAAATGTCATAAGGTATGGCCTCTTTTGCATTAAAAACCATGTTCACACCTTAAGTAAACCACAGTACGCTGATTGGAAGTTTATGTGGTTTTGAAAGGTCAGAACAGTTATATGACCTTGTCTTCTTGTTACACCCTTCCCAAGAAATGAGAAAAACATATACTTTcactttttcatttgtttgtctttTTCAAAATAGTATTTGCTCTCAGTTGTGATATGTACATTTAAGACAATAAGATCTGTTTAACCAGACATTAGGAAAGATTGTGTACACACATTACAATAAACCACCAAAGTTTTACAGTAAGTTCAGTGCCAATTTCAGTTTCAttcactgcattttatttagaaaatctGTGCTTGTACTGTTATCTAACTAATTTTTGCTAATTATAAATGATTTAAGGTACTGAATACAGCATAGTTAaacaacatacaaacaaaaaaagccaaTTACCTGAAAGTTAAACATAGTTAGATCCAATAAAGTTGTTTCTCAACAATATAATCCAGGTGATTAGAATCTCTGAAAGCAGTGATTTCTTGTTTACTTATATTTgaagtatatttttgttttgttttgtagccTAATAGACGATGGACTGGAAAATCACTCTATAATATTTCACTCTATCATGTTACAACCCTTCAGGAACTAATAGGTTGAACAGTTAATCCTGCAAACGTAACCGCTTGTTTGAACCAGTCAGAATACAGGAAATAAACTGATATGTTTCAGAAGTTGCTGTGTGGTTGCTATGTTATCTATAGACATTGATGGGTCACTCCTTCAATGTAGGTCTGTGTGTTATCGTATGCCAAAAGTCGTAAATCAGCACCACTCTTCAACAAGTCATAGGATTTTGGGTAGCACTCATGTCCATCACTTGAACAATGCAGTTCCTGAAACATAATACTTAATATTGTAATACTTGGTAACGTTGGTTTCTTTTGTTCTTATGACGTTCTATAAAAAGCAGTGCTCACTTTGTTTTAATGAATTTCGCATGGCAACCACAGGAAAACAATGGCATTAAATATGCTCTTGGCATTAAATATGTTCTTGACCTATGGTCACGTTCTCCACACCTGTTTgctatttcaaaatgtttttgagTCATAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117437

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00007140 False 3274 lncRNA 0.36 2 41192329 41201272
TCONS_00007141 True 4445 lncRNA 0.37 2 41195394 41201272

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_003675 camta1 coding upstream 34375 41110669 ~ 41157954 (+)
XLOC_003674 phf13 coding upstream 86697 41089574 ~ 41105632 (+)
XLOC_003673 svbp coding upstream 124540 41064822 ~ 41067789 (+)
XLOC_003671 NA coding upstream 236206 40891681 ~ 40956123 (+)
XLOC_003672 CABZ01044764.1 coding upstream 292440 40897326 ~ 40899889 (+)
XLOC_003677 CABZ01087025.1 coding downstream 22213 41223485 ~ 41235090 (+)
XLOC_003678 pax7a coding downstream 41372 41242644 ~ 41372948 (+)
XLOC_003679 park7 coding downstream 258136 41459408 ~ 41475995 (+)
XLOC_003680 BX571706.1 coding downstream 263835 41465107 ~ 41465236 (+)
XLOC_003681 kcnab2a coding downstream 339590 41540862 ~ 41699904 (+)
XLOC_003369 CR854846.2 misc upstream 25069247 16122786 ~ 16123082 (+)
XLOC_003318 CR450764.6 misc upstream 28480333 12711700 ~ 12711996 (+)
XLOC_003317 CR450764.16 misc upstream 28498066 12693967 ~ 12694263 (+)
XLOC_003316 CR450764.11 misc upstream 28506730 12685304 ~ 12685599 (+)
XLOC_003315 CR450764.18 misc upstream 28512301 12679732 ~ 12680028 (+)
XLOC_003670 CABZ01044767.1 non-coding upstream 303035 40889180 ~ 40889294 (+)
XLOC_003669 NA non-coding upstream 326787 40864955 ~ 40865542 (+)
XLOC_003662 NA non-coding upstream 758249 40220055 ~ 40434080 (+)
XLOC_003684 NA non-coding downstream 731828 41933100 ~ 41934619 (+)
XLOC_003687 NA non-coding downstream 812731 42014003 ~ 42018127 (+)
XLOC_003688 NA non-coding downstream 834515 42035787 ~ 42036989 (+)

Expression


Co-expression Network