G1751699 (LOC106608599)



Basic Information


Item Value
gene id G1751699
gene name LOC106608599
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 52962449 ~ 52972383 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU2005665
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>TU2005666
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>TU2005667
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>TU2005669
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>TU2005670
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>TU2005671
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Function


NR:

description
cystatin-B-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2005671 False 1818 TUCP 0.40 4 52962449 52972383
TU2005668 True 1827 TUCP 0.40 3 52969792 52972383

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110500695 LOC106608687 coding upstream 1407619 51509283 ~ 51554830 (+)
LOC110500694 LOC106608686 coding upstream 1455304 51501598 ~ 51507145 (+)
LOC110500691 LOC106608684 coding upstream 1476561 51457228 ~ 51485888 (+)
LOC110500885 LOC106608683 coding upstream 1549202 51370721 ~ 51413247 (+)
LOC110500687 LOC106608680 coding upstream 1600915 51350884 ~ 51361534 (+)
LOC110500702 LOC106608597 coding downstream 16979 52989362 ~ 52996635 (+)
LOC110500711 LOC106608589 coding downstream 133174 53105557 ~ 53139436 (+)
si:dkey-28a3.2 LOC106608587 coding downstream 176436 53148819 ~ 53159292 (+)
LOC110500717 LOC106608585 coding downstream 191728 53164111 ~ 53214983 (+)
LOC110500719 LOC106608586 coding downstream 242846 53215229 ~ 53245179 (+)
G1751687 NA non-coding upstream 72149 52889765 ~ 52890300 (+)
G1751646 NA non-coding upstream 156935 52805257 ~ 52805514 (+)
G1751645 NA non-coding upstream 159998 52802224 ~ 52802451 (+)
G1751642 NA non-coding upstream 161097 52801136 ~ 52801352 (+)
G1751638 NA non-coding upstream 167171 52795049 ~ 52795278 (+)
G1751700 NA non-coding downstream 1955 52974338 ~ 52975041 (+)
G1751727 NA non-coding downstream 3535 52975918 ~ 52976149 (+)
G1751729 NA non-coding downstream 5386 52977769 ~ 52977970 (+)
G1751738 NA non-coding downstream 28291 53000674 ~ 53001197 (+)
G1751739 NA non-coding downstream 34753 53007136 ~ 53007397 (+)
G1750050 NA other upstream 765442 52191200 ~ 52197007 (+)
G1750030 LOC106608688 other upstream 867344 52094709 ~ 52095105 (+)
G1750012 NA other upstream 883447 52071600 ~ 52079002 (+)
G1749650 NA other upstream 1511974 51418969 ~ 51450475 (+)
G1749651 NA other upstream 1599069 51362686 ~ 51363380 (+)
LOC110500722 NA other downstream 279366 53251413 ~ 53256660 (+)
LOC110500735 ablim2 other downstream 1234315 54206483 ~ 54342581 (+)
G1753100 NA other downstream 2029196 55001579 ~ 55011678 (+)
LOC110500754 LOC106591080 other downstream 2618222 55590450 ~ 55592100 (+)
G1755158 NA other downstream 3414024 56386407 ~ 56387622 (+)

Expression



Co-expression Network