G1761942


Basic Information

Item Value
gene id G1761942
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048585.1
NCBI id CM023239.2
chromosome length 64935962
location 64547230 ~ 64553749 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2018426
GGATAAAACAACACTACCactggtagagagagactggttataacactaccactggtagagactggtaataacactaccactggtagagactTGTAATGGTtataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTAATAACAACACTACCACTGGTAGTGACGGGTtacaacactaccactggtagagactggtagtggttataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTTATAACCACTCTGTACTCTGGTTAATTGCGAAATTCCCTAAACGTTCCCAAACTGTTTCCTGCTTGGAAGATTCATAATGGGGATACAATAAGCTGGAAATCCAGGAGTCCTTCAACTTGGATCTCTGGAAAACACTCTATGGCTGGTTTGTATTTATGTTAATGAAGGCATTTCTGCTTTTCGATAAGATACCCAGAAGCATTACTAACTTGTGTTCTCcttctggtctcctctACTTCCTTCTAGTCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctaatcctctgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctaatcctcttctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGGACGACCCTCTTTCTTCATGCCGCCGAGACAAACTTTACACCTCACCTAACTCATGCCTCTCTTTATTGTCAc
>TU2018427
CACTACCACCGGTAGAGACTGGTtataacactaccactggtagagactggttataacactaccactggtagagactggttataacactaccactggtagagactggtaatggttataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTTATACCACTACCACTGGTAGAGACTGGTAAAGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTTATAACTACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTTATAACAACACTACCACGGGTAGAGACTGGTTATAACACCACCACTGGTAGAGACTGagactggttataacactaccactggtagAGGCGGTTAATGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTTAAGGTTATAACAACACTACCACTGATAGAGACTTGTTATAACAATACCACTGGTAAAGACCTGTtataacactaccactggtagAGACTGGTAACGGTTACAACACTACCACTGGAAGAGACTGGTAATGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTtataacactaccactggtagAGACTGGTTATAACAACACTACCACAGGTAGAGACTGGTAATGCTTATTACACTACCactggtagtgactggttataacAACACTACCACCGGTAGAGACTGCTAATGGTTATAACTACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTTATAACACCACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAAAGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGCTATAATACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTaataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTTATAACACTACCACTGGTGGAGACTGGTAAAGGTTATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTAATAACACTACCACTGTTAGAGACTGGTAATGGTTACAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGCtataacactaccactggtagagactggtaatggtaataacactaccactggtagagactggtaatggttataacactaccactggtagagactggtaatggttataacactaccactggtagagactggtaaaggttataacaacactaccactggtagagactggtaatggtaataacactaccactggtagagactggtaatggttataacactaccactggtagAGACTGGTTTAAACACTACCACTGGTAGAGACTGGTAATGGTAATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGTAATGGTtataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTAATAACAACACTACAACTGGTAGTGACGGGTtataacactaccactggtagagactggttataacactaccactggtagagactggtaatggtaataacaacactacaactggtagagactggttataacactaccactggtagagactggttataacactaccactggtagAGACTGATTATAACACTACCACTGGAAGAGACTGGTAATGGTAATAACAACACTACCACTGGTAGAGACTGTAATGGTtataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTAATAACAACACTACCACTGGTAGTGACGGGTtacaacactaccactggtagagactggtagtggttataacactaccactggtagAGACTGGTAATGGTTATAACCACTCTGTACTCTGGTTAATTGCGAAATTCCCTAAACGTTCCCAAACTGTTTCCTGCTTGGAAGATTCATAATGGGGATACAATAAGCTGGAAATCCAGGAGTCCTTCAACTTGGATCTCTGGAAAACACTCTATGGCTGGTTTGTATTTATGTTAATGAAGGCATTTCTGCTTTTCGATAAGATACCCAGAAGCATTACTAACTTGTGTTCTCcttctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctattcctctgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtcctcttctggtctcctctccttccttctattcctctgcTGGTCTCCTCTccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctaatcctctgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGCTggactcctctccttccttctaatcctcttctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGGACGACCCTCTTTCTTCATGCCGCCGAGACAAACTTTACACCTCACCTAACTCATGCCTCTCTTTATTGTCAc
>TU2018428
cacacacacacacacacacactgtcacacacacacacacactgtcacacacacacacacacacatcttaccTTTGGTAATAACGTGGGCTAGAAAGCCGTGAGGTCGGGGACATCTCAGTCTGCTGACCCAGGAACAGCAAGAAGAACAGTCCAACATCGTCATcctcaccACTTGTGTTCTCcttctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctattcctctgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggactcctctccttccttctaatcctcttctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTgctggtctcctctccttccttctagtCCTCTGGACGACCCTCTTTCTTCATGCCGCCGAGACAAACTTTACACCTCACCTAACTCATGCCTCTCTTTATTGTCAc

Function

NR:

description
sodium/hydrogen exchanger 9B2-like

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2018426 False 932 lncRNA 0.47 5 64547230 64552183
TU2018427 False 2557 lncRNA 0.44 6 64547230 64551725
TU2018428 True 507 lncRNA 0.51 3 64547230 64553749

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118942817 LOC106608410 coding downstream 13860 64525897 ~ 64533370 (-)
cnga1b cnga1 coding downstream 29192 64483522 ~ 64518038 (-)
nfxl1 nfxl1 coding downstream 66243 64384916 ~ 64480987 (-)
LOC118942981 NA coding downstream 159422 64386561 ~ 64387808 (-)
corin corin coding downstream 165789 64237532 ~ 64381441 (-)
LOC110509409 LOC106593257 coding upstream 38007 64590607 ~ 64647805 (-)
LOC118942818 LOC106608414 coding upstream 160073 64663711 ~ 64723784 (-)
LOC118942984 LOC106592811 coding upstream 222817 64776566 ~ 64790358 (-)
LOC118942819 LOC106595717 coding upstream 369740 64923489 ~ 64930766 (-)
G1761930 NA non-coding downstream 30907 64502028 ~ 64516323 (-)
G1761796 NA non-coding downstream 83574 64462005 ~ 64463656 (-)
G1761830 NA non-coding downstream 116875 64426974 ~ 64430355 (-)
G1761822 NA non-coding downstream 140893 64405871 ~ 64406337 (-)
G1761818 NA non-coding downstream 147066 64399506 ~ 64400164 (-)
G1761944 NA non-coding upstream 223 64553972 ~ 64554520 (-)
G1761957 NA non-coding upstream 24408 64578157 ~ 64579408 (-)
G1761958 NA non-coding upstream 26748 64580497 ~ 64581193 (-)
G1761963 NA non-coding upstream 59317 64613066 ~ 64613827 (-)
G1761826 NA other downstream 129178 64417310 ~ 64418052 (-)
LOC110517683 LOC106592125 other downstream 323742 64205352 ~ 64223639 (-)
LOC110498011 LOC106608403 other downstream 714836 63823210 ~ 63832447 (-)
LOC118942979 NA other downstream 917383 63542492 ~ 63629859 (-)
camta2 camta2 other downstream 985177 63434675 ~ 63562110 (-)
G1762080 NA other upstream 194755 64748504 ~ 64749274 (-)
G1762085 NA other upstream 199958 64753707 ~ 64754499 (-)
G1762162 NA other upstream 302759 64856508 ~ 64857185 (-)

Expression


Co-expression Network