LOC110501685 (LOC106582064)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110501685
gene name LOC106582064
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 27741372 ~ 27770708 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_021579417.2
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>XM_036959033.1
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>TU2055049
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>TU2055050
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Function

NR:

description
M-phase phosphoprotein 8-like isoform X1

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021579416.2 False 1833 mRNA 0.39 3 27741375 27744078
XM_021579417.2 False 495 mRNA 0.51 4 27741375 27770698
XM_036959033.1 False 4136 mRNA 0.44 3 27745675 27770708
TU2055049 False 1357 TUCP 0.40 3 27741372 27743599
TU2055050 True 1132 TUCP 0.40 4 27741372 27743599

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502082 LOC106582065 coding downstream 745 27706931 ~ 27740630 (-)
LOC110502081 ift88 coding downstream 78761 27649234 ~ 27662614 (-)
il17d il-17d coding downstream 92667 27647730 ~ 27648708 (-)
LOC110501675 LOC106582077 coding downstream 196793 27539464 ~ 27544582 (-)
LOC110501672 NA coding downstream 223746 27501691 ~ 27517629 (-)
LOC110501686 LOC106582063 coding upstream 5863 27776571 ~ 27817123 (-)
acbp acbp coding upstream 63799 27834422 ~ 27838573 (-)
LOC110501689 LOC106582060 coding upstream 132874 27903582 ~ 27912919 (-)
LOC110501691 LOC106582059 coding upstream 238713 28009421 ~ 28019116 (-)
LOC110502083 LOC101162407 coding upstream 288185 28058893 ~ 28062683 (-)
G1795708 LOC106582078 non-coding downstream 52803 27683080 ~ 27688572 (-)
G1795707 NA non-coding downstream 58937 27682175 ~ 27682438 (-)
G1795703 NA non-coding downstream 65997 27675136 ~ 27675378 (-)
G1795689 NA non-coding downstream 96348 27644823 ~ 27645027 (-)
G1795660 NA non-coding downstream 130975 27610003 ~ 27610400 (-)
G1795771 NA non-coding upstream 93935 27864643 ~ 27865088 (-)
G1795777 LOC106582058 non-coding upstream 160331 27931039 ~ 27935284 (-)
G1795871 NA non-coding upstream 253030 28023738 ~ 28023937 (-)
G1795885 LOC106582057 non-coding upstream 273543 28044251 ~ 28044507 (-)
G1794978 NA other downstream 455280 27268662 ~ 27286095 (-)
LOC110501627 LOC106582113 other downstream 2029756 25709599 ~ 25744218 (-)
G1792433 NA other downstream 2755107 24985959 ~ 24986268 (-)
G1792345 NA other downstream 2883490 24856824 ~ 24857885 (-)
G1792342 LOC106582127 other downstream 2891623 24848591 ~ 24849752 (-)
G1795850 NA other upstream 209956 27980664 ~ 27981379 (-)
G1796204 NA other upstream 563516 28334224 ~ 28334621 (-)
G1796239 NA other upstream 664207 28434915 ~ 28451815 (-)
G1796401 NA other upstream 855430 28626138 ~ 28626891 (-)

Expression


Co-expression Network