LOC110501882 (LOC106582411)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110501882
gene name LOC106582411
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 40942404 ~ 40988211 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021579734.2
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XM_021579734.2 False 7716 mRNA 0.46 10 40942404 40988209
XR_002470266.2 False 7655 mRNA 0.46 10 40942404 40988210
XR_002470265.2 False 8731 mRNA 0.45 9 40942404 40988211
XR_002470267.2 False 4680 mRNA 0.53 9 40945385 40988211
TU2071240 True 3137 lncRNA 0.34 3 40942407 40947927

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110501881 LOC106582412 coding downstream 424 40930259 ~ 40941980 (-)
LOC110502149 LOC106586321 coding downstream 13167 40883596 ~ 40929237 (-)
LOC110501879 LOC106586322 coding downstream 60162 40835176 ~ 40882242 (-)
LOC110501878 LOC106582406 coding downstream 128967 40736648 ~ 40813437 (-)
LOC110501875 LOC106582404 coding downstream 257860 40675303 ~ 40684544 (-)
LOC110501883 LOC106582410 coding upstream 4704 40992915 ~ 41051487 (-)
LOC118943638 NA coding upstream 451737 41439948 ~ 41447272 (-)
LOC110501886 rhg15 coding upstream 459688 41447899 ~ 41523764 (-)
LOC110502151 arl4c coding upstream 624351 41612562 ~ 41613136 (-)
LOC110501887 LOC106582419 coding upstream 634610 41622821 ~ 41624796 (-)
G1810361 NA non-coding downstream 53745 40888345 ~ 40888659 (-)
G1810351 NA non-coding downstream 74857 40867332 ~ 40867547 (-)
G1810350 NA non-coding downstream 75179 40867020 ~ 40867225 (-)
G1810337 NA non-coding downstream 92401 40849804 ~ 40850003 (-)
G1810401 NA non-coding upstream 13099 41001310 ~ 41014470 (-)
G1810408 NA non-coding upstream 20549 41008760 ~ 41009125 (-)
G1810480 NA non-coding upstream 135351 41123562 ~ 41123869 (-)
G1810491 NA non-coding upstream 144891 41133102 ~ 41133392 (-)
G1808299 NA other downstream 1997874 38944136 ~ 38944530 (-)
LOC110502145 LOC106586333 other downstream 2330117 38520872 ~ 38726596 (-)
G1807731 NA other downstream 2729217 38208790 ~ 38241273 (-)
G1807750 LOC106582372 other downstream 2747308 38193422 ~ 38195096 (-)
G1811042 NA other upstream 616763 41604974 ~ 41605231 (-)
G1812079 LOC106582433 other upstream 1398611 42386822 ~ 42389273 (-)
LOC110502155 psd12 other upstream 1616492 42603998 ~ 42605768 (-)
G1812404 NA other upstream 1689046 42677257 ~ 42677760 (-)

Expression


Co-expression Network