LOC118943644


Basic Information

Item Value
gene id LOC118943644
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 48962212 ~ 48964633 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036959601.1
ttttttttttacaatatagtccattttgactttgcagctggcctatctaaggggGATTTCCTCAGTTACACCTGCTGGACAAGACTCATGAAAATAAAGGTCAAGCTGCTCACTATTTATGAATTCGCCCGACCTTTACAAGGGTGCGTATTGAATCCTCCAGGGTTCACGGGTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGTACAGGGGTTGGTGCTTGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGTACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGTACAGGGGTTGGTGCTTGTTACACACAGGGGTTGGTgctggttacatacagtacaggggtTGGTGCTTGTTACACACAGGGGTTGGTgctggttacatacagtacaggggtTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGTACAGGGGTTGGTGCTTGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGTACAGGGGTTGGTGCTTGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGGGGTTGGTGCTGGTTCCATACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGGGGTTGGTgctggttacatacagtacaggggttggtgctggttacatacagtacaggggTTGGTgctggttacatacagtacaggggtTGGTGCTGGTTACACACAGTACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGTACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGTACAGGGGTTGGTgctggttacatacagtacaggggttggtgctggttacatacagtacaggggttggtgctggttacatacagtacaggggttggtgctggttacatacaggggttggtgctggttacatacagtacaggggtTGGTGCTGGTTACATATAGTACAGGGGTTGGTgctggttacatacagtacaggggtTGGTGCTGGTTACACACAGTACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACAGTACAGGGGTTGGTGCTGGTTACACACCCGGGTTagcgtttttgttgttgtcatgaaACAAAAGGCAGGCAGCTCTGCAGAACGGTTACTAGGTGGCACAGCCACATTTTCATAATATCAGATTATTAAACCTAACTCTActccttaacccttaaccctaaccacactgatGACCACAACACAGCCCTATAGGGGTTGGTGCTGGCCCTTCAGACAAGAGGATGACGCTTTTAATTAAAGCTGTGATCAAGAGTAATGAAGTGGAAACAGAACACTAAAGCCTGTTTTCACCAGCATTAGATGTCAGTAGGACTGCCTGTAAATTATAGAGGCCTCAGTCTGCCCAGCCTCCTCTAAAGTCAGTAGATCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTGAAGTCAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCCAGCCCCCTCTGAAGTCTGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCCAGCCCCCTCTGAAGTCTGTAGAGCTAATGGCAGACTGCCTAGCCCCCTCTGAAATCAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCCAGCCTCCTCTGAAGTCAGTAGATCTAACGGTAGACAGCCCAGCCCCCTCTGAAGTCAGTAGATCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTGAAGTCTGTAGAGCTAATGGCAGACTGCCCAGCCCCCTCTGAAGTCAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTAAAGTGAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTAAAGTGAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCCAGCCTCCTCTGAAGTCAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTATAATCAGTAGAGCTAACGGTAGACAGCCTAGCCTCCTCTGAAGTCAGTAGATCTAATGGTAGACAGCCCAGCCTCCTCTGTCTACTCTGCCCTCCACTGATAAAATAGGCCTagctctttcccctcctcttcctcctcctcctcctcctcagtccgTCACCCTAGCCTGATAGTATACCTCCTCAAGGTGAATGACAGGAATTATGGTGGACTGTTTCAAAGGTCAGCGAGCTAGGGGTTACGCAATTAGAAAACCCTGTTATCATCACTCACCCAACCGGGTGGGTT

Function

NR:

description
PREDICTED: keratinocyte proline-rich protein-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036959601.1 True 2371 mRNA 0.51 2 48962212 48964633

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502188 LOC106582504 coding downstream 316291 48505445 ~ 48645921 (-)
LOC110501956 itgav coding downstream 742170 48139761 ~ 48220042 (-)
LOC110501953 ihh coding downstream 897759 48057851 ~ 48064453 (-)
tmem198a LOC106582514 coding downstream 990081 47897057 ~ 47972131 (-)
ptprna LOC106582506 coding downstream 1127958 47733219 ~ 47834254 (-)
LOC118943599 NA coding upstream 505469 49470102 ~ 49480960 (-)
prkag3b LOC106592041 coding upstream 1158255 50122888 ~ 50243945 (-)
si:ch211-67e16.4 LOC106582542 coding upstream 1495461 50460094 ~ 50465680 (-)
si:ch211-67e16.3 LOC106582540 coding upstream 1507114 50471747 ~ 50484670 (-)
cd28 LOC100136275 coding upstream 1530434 50495067 ~ 50496991 (-)
G1818270 NA non-coding downstream 2099 48959913 ~ 48960113 (-)
G1818259 NA non-coding downstream 10041 48951804 ~ 48952171 (-)
G1818255 NA non-coding downstream 27195 48934141 ~ 48935017 (-)
G1818252 NA non-coding downstream 30515 48926194 ~ 48931697 (-)
G1818232 NA non-coding downstream 67296 48894477 ~ 48894916 (-)
G1818292 NA non-coding upstream 21638 48986271 ~ 48987447 (-)
G1818322 NA non-coding upstream 52436 49017069 ~ 49018937 (-)
G1818325 NA non-coding upstream 55310 49019943 ~ 49020178 (-)
G1818326 NA non-coding upstream 55753 49020386 ~ 49021206 (-)
G1818369 NA non-coding upstream 81949 49046582 ~ 49102422 (-)
G1818059 NA other downstream 334366 48627364 ~ 48627846 (-)
G1817968 NA other downstream 492177 48469598 ~ 48470035 (-)
G1817836 NA other downstream 502172 48459026 ~ 48460040 (-)
G1817668 NA other downstream 670716 48268787 ~ 48291496 (-)
G1818393 NA other upstream 160881 49125514 ~ 49126117 (-)
G1818417 NA other upstream 201118 49165751 ~ 49166367 (-)
G1818802 NA other upstream 752999 49717632 ~ 49719378 (-)
G1819189 NA other upstream 1244841 50137937 ~ 50219233 (-)
G1819250 NA other upstream 1337168 50301801 ~ 50305038 (-)

Expression


Co-expression Network