XLOC_037020 (CR513782.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037020
gene name CR513782.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 15567364 ~ 15571007 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00072875
AGCGCTGCGGAGACTGAACTTCGAAACCGAAACCCCCTTTGCGAGATTCGCCGCATCTATACCTGATTTGCGTTCAAAAATGCCTGCTTAATTATTTCACAGTAGGAGCAAACATGCCTTAAGAAAAGGAGTACGTTTGAAACTTTAGTAACCATAAAAGGACGCCAGGTGGATGCCTTTCTACTCCAGGAAGCTGCAGCCTGTGGCCTGAAGGAGGAAGAGGACGCGGTCAGTTTGAAATAGCTGTTGTGATGGAGCTGGACCTGTAGACAAGGGAACTAACAcatttgagaaaaaataaaatccaaaataaGAGattGGTGTGTGTGGTGAGGGTAAAGAAGTCCACAGCAGCATCTTGGAAATGCTGtaatgcaggggtgcccaaactcagttctggacggctggtgtcctgcacagtttagaaTCAACTTCAACTAAACTCTGCAAGACAGCAGCAGTTCTGGACTGAGTTTAGCCACTCCTGTTCTCCTGTAGTGAACTGAACGAGACCCTGCATCAGTCCACATGCCCTTGTGTCCTCATCTGGACCAGATGTTGCTGTGGTCTCTTCATCATCCGTATCTCGGGCATGGACTGCCATGCATCACCGCCCTGTTTCAGTCTGACTGCAGCAATGAGGGATGTGATGATGGCGAAGTCCCTCTGATCATCTGCAGAACTGGCCCAGCTGTGTGAAGATACAGCAAAACATGGGCTTCTGTCTGTAATACATCACTGTTAGAATAAAGCTTGGTTTCATGTGTTGTTGACTTGTATTTATTTGTCATGATTACTCATATTCattcttttaataatataattatgtttctgtttgttttcaataaataatgataatagtttCAA
>TCONS_00075077
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000092021

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00072875 False 867 processed_transcript 0.44 3 15567364 15571007
TCONS_00075077 True 3432 lncRNA 0.33 1 15567576 15571007

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037018 NA coding upstream 36674 15517533 ~ 15530690 (+)
XLOC_037019 NA coding upstream 37907 15527611 ~ 15529457 (+)
XLOC_037017 BX511082.1 coding upstream 1270232 14291932 ~ 14297132 (+)
XLOC_037016 NA coding upstream 1369861 14152168 ~ 14197503 (+)
XLOC_037015 AL929266.1 coding upstream 1420211 14143073 ~ 14147153 (+)
XLOC_037021 znfl1b coding downstream 266391 15837398 ~ 15841997 (+)
XLOC_037022 si:dkey-14o1.20 coding downstream 319551 15890558 ~ 15894501 (+)
XLOC_037023 NA coding downstream 330519 15901526 ~ 15906907 (+)
XLOC_037024 BX469925.2 coding downstream 336026 15907033 ~ 15907820 (+)
XLOC_037025 BX323875.1 coding downstream 411337 15982344 ~ 15985797 (+)
XLOC_037014 NA non-coding upstream 1450364 14112475 ~ 14117000 (+)
XLOC_037028 NA non-coding downstream 1204980 16775987 ~ 16776615 (+)
XLOC_037030 NA non-coding downstream 1655237 17226244 ~ 17227294 (+)

Expression


Co-expression Network