G1790551


Basic Information

Item Value
gene id G1790551
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 23604635 ~ 23615203 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2049466
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>TU2049467
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>TU2049468
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2049466 False 2201 lncRNA 0.38 2 23604635 23615203
TU2049467 False 1608 lncRNA 0.38 2 23604635 23609391
TU2049468 True 2197 lncRNA 0.38 2 23604635 23615203

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502013 tfg coding upstream 414272 23164465 ~ 23190363 (+)
LOC110502028 LOC106586704 coding upstream 443623 23160350 ~ 23161012 (+)
LOC110502004 LOC106582005 coding upstream 457131 23123886 ~ 23147504 (+)
LOC110502117 NA coding upstream 548892 23053038 ~ 23055743 (+)
LOC110501603 NA coding upstream 554431 23044616 ~ 23050204 (+)
LOC110502031 NA coding downstream 17960 23633163 ~ 23635182 (+)
LOC110502002 LOC100195685 coding downstream 84417 23699620 ~ 23713577 (+)
LOC110502012 LOC106582145 coding downstream 176441 23791644 ~ 23799947 (+)
LOC110502020 LOC106582143 coding downstream 225695 23840898 ~ 23868839 (+)
LOC110502009 LOC106582142 coding downstream 266030 23881233 ~ 23901983 (+)
G1790549 NA non-coding upstream 3816 23600528 ~ 23600819 (+)
G1790546 NA non-coding upstream 9012 23595382 ~ 23595623 (+)
G1790542 NA non-coding upstream 16970 23587444 ~ 23587665 (+)
G1790511 NA non-coding upstream 68643 23534515 ~ 23535992 (+)
G1790462 NA non-coding upstream 128556 23474857 ~ 23476079 (+)
G1790566 NA non-coding downstream 11540 23626743 ~ 23627099 (+)
G1790576 NA non-coding downstream 39812 23655015 ~ 23655248 (+)
G1790578 NA non-coding downstream 46669 23661872 ~ 23662074 (+)
G1790427 NA non-coding downstream 125359 23740562 ~ 23743194 (+)
G1790676 NA non-coding downstream 230462 23845665 ~ 23847029 (+)
G1790442 LOC106582152 other upstream 172252 23416093 ~ 23432383 (+)
G1788815 LOC100136012 other upstream 1605012 21998473 ~ 21999623 (+)
G1788811 LOC106581691 other upstream 1608542 21995364 ~ 21996093 (+)
G1787719 NA other upstream 2468158 21134265 ~ 21136477 (+)
G1786330 NA other upstream 3320064 20283181 ~ 20284571 (+)
G1790805 NA other downstream 503359 24118562 ~ 24119475 (+)
LOC110501605 LOC106582130 other downstream 778865 24394068 ~ 24423067 (+)
G1792040 NA other downstream 1227739 24842942 ~ 24843285 (+)
LOC110501609 fam155a other downstream 1233763 24848514 ~ 25013655 (+)
G1792649 NA other downstream 1679343 25294546 ~ 25296557 (+)

Expression


Co-expression Network