G1813442


Basic Information

Item Value
gene id G1813442
gene name NA
gene type unknown
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 44108244 ~ 44110867 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2074610
ACTTGGTCCTAAATTAATATAAACTTCAAATAATAACACAATTATTGAGTGTCACTCAATGTTGCTTTAACTCAGTGTCACTCAGTGTTGTTTTTACTCAGCCTTCCAGGTAGCGTGAGGGGACGGTATGAGGGTACTTAACTGTTGGTTACTGGATCATTGGAGGAAAAGAACACCCTGTCAGACATACCAAGCACTGTCTTATGGCTCTGTGATGTTGGGCTGTTGTACACAACTGATATTTGTGGATTTTGTATTGAATGCTAAATAATTGACTAaacctaaaaaaataaaaaaaaacattatttaactaggcaagtcagttaagaataagttcttatttacaatgacagcctgtcgttctgccccttgttcaggggcagaacgacagattgttaccttgccagctcggggattcgatctagtaagcgttcggttactggcccaatgctctaaccacttggcaaACTGCCACCCTTACACTgaatataccaaacattaggaacaccgtccTCGTATTAGGTTGTACCCACCACCCGGTTGCCCTCAGAagactcaattcgtcagggcatggactctacaaggtgtcaaaagcgttccacagggatgctggatttatgttgactccaatgtttcccgcAGTTGTGttaaattggctggatgtcctttgggtggtggacaattctagatacacacgagaaactgatgagcgtgaaaaacccaacagcttTGCGGTTATTGCCACAAACCTGctgcgcctggtacctactaccataccctgttctaaGACACTTCAATGTTtggtcttgtccattcaccctctgaatggaacacatTCTCTATGGATGTCTCTATTGTCTGAAGGCTTATAAATCAtccttaacctgtctcctccccttcatctacactgattgaaaagGATTTAATAAGCAACACCAataagtgatcatagctttcaaccTAGATTGACCTGGTCAGAGCAGGGatccttaatgttttgttcactcagtgtatcgTAATACACTGTGAGCTAGTCTTAAACTCATGTGTTTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACTCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACTCATGTGTTTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACCCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACCCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTACACTGCTGGTGTCACCATGTGGGCCGGGCTTGGTTCCATTGCATGTCCAAGAGGCTAACCCAGGGCTCAGGCGGTGGTGTTCATGCTTTCTGGCTGTtgcactatgtactgtatgtaccctCACCTCACTCTCTCACTGCTACCTACTTTAACATTTCACCCGTTCAGACAACACCCACAACAGACAAGACCGGAGCAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAAACAGTGGGAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCCGGTAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCAGGCAGACATCACTCACAGTGATAATGTAATAATGAAGTAACAACAGTAATAATGTTGTCTTAATGgagtaataacagtaataatgaAGTAATAACCGTAGTAATAACGCAATAAAGTAATAATGACAGTAGCAATAATGAagtaataacagtagtaatatTGAATAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAAGTAATAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATAATGAagtaataacagtagtaataatgaagtaataacagtagtaataaTGAAGTAATAACAGTAGTAATTATGAAataataacagtagtaatatTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTTTTAATGAAGTAATAATGAAGTAATAATAGCAGTAAAACTGTATAAAGACATTATTCTGGGTCACATTAGCACTTTGTGCATTGTGACACTTACTGTTAGCCAGGTCCCAGAATATGCTAGTTGTAAATTCAACAACTTTACTTGCTGCTCTTTCACCTTTTCT
>TU2074604
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>TU2074607
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>TU2074609
TCTTAAACTCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACTCATGTGTTTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACCCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTAAACCCATGTGTCTATAGGCCGGGCTTGTGTGAGCTAGTCTTACACTGCTGGTGTCACCATGTGGGCCGGGCTTGGTTCCATTGCATGTCCAAGAGGCTAACCCAGGGCTCAGGCGGTGGTGTTCATGCTTTCTGGCTGTtgcactatgtactgtatgtaccctCACCTCACTCTCTCACTGCTACCTACTTTAACATTTCACCCGTTCAGACAACACCCACAACAGACAAGACCGGAGCAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAAACAGTGGGAGGCAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCCGGTAGACATCACTCACAGCAGACAAGACAGTGGCAGGCAGACATCACTCACAGTGATAATGTAATAATGAAGTAACAACAGTAATAATGTTGTCTTAATGgagtaataacagtaataatgaAGTAATAACCGTAGTAATAACGCAATAAAGTAATAATGACAGTAGCAATAATGAagtaataacagtagtaatatTGAAGTAATAACATTAGTAATATTGTAATTAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAagtaaTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAAGTAATAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATAATGAAGTAATGACAGTAGTAATATTGTAATGAAGTAATGACAGTAGTAATAATGAagtaataacagtagtaataatgaagtaataacagtagtaataaTGAAGTAATAACAGTAGTAATTATGAAataataacagtagtaatatTGTAATGAagtaataacagtagtaatatTGTTTTAATGAAGTAATAATGAAGTAATAATAGCAGTAAAACTGTATAAAGACATTATTCTGGGTCACATTAGCACTTTGTGCATTGTGACACTTACTGTTAGCCAGGTCCCAGAATATGCTAGTTGTAAATTCAACAACTTTACTTGCTGCTCTTTCACCTTTTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2074610 False 2285 TUCP 0.39 2 44108244 44110867
TU2074604 False 1358 TUCP 0.35 2 44109320 44110867
TU2074607 False 1322 TUCP 0.35 2 44109320 44110867
TU2074609 True 1344 TUCP 0.35 2 44109320 44110867

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502167 LOC106582449 coding upstream 112869 43992238 ~ 43995375 (+)
LOC118943610 LOC106576908 coding upstream 129017 43976015 ~ 43979227 (+)
LOC110501910 LOC106582449 coding upstream 136832 43970398 ~ 43971412 (+)
LOC118943642 LOC106582432 coding upstream 199424 43907659 ~ 43908820 (+)
LOC118943641 LOC106582431 coding upstream 255218 43850609 ~ 43853026 (+)
LOC110502169 LOC106582455 coding downstream 37762 44148629 ~ 44324651 (+)
LOC110501911 LOC106582457 coding downstream 216043 44326910 ~ 44351877 (+)
LOC110501915 LOC106582460 coding downstream 270685 44381552 ~ 44438653 (+)
LOC110502170 LOC106582462 coding downstream 341385 44452252 ~ 44463017 (+)
LOC110501916 LOC106582463 coding downstream 357325 44468192 ~ 44472868 (+)
G1813475 NA non-coding upstream 20807 44078949 ~ 44087437 (+)
G1813439 NA non-coding upstream 92662 44015255 ~ 44015582 (+)
G1813419 NA non-coding upstream 102419 43967883 ~ 44005825 (+)
G1813354 NA non-coding upstream 217933 43841540 ~ 43890311 (+)
G1813332 NA non-coding upstream 372511 43724577 ~ 43735733 (+)
G1813481 NA non-coding downstream 20827 44131694 ~ 44132872 (+)
LOC110502168 LOC106582452 non-coding downstream 29376 44024275 ~ 44145882 (+)
G1813485 NA non-coding downstream 35834 44146701 ~ 44146942 (+)
G1813493 NA non-coding downstream 44396 44155263 ~ 44155647 (+)
G1813544 NA non-coding downstream 112314 44223181 ~ 44224024 (+)
G1812953 NA other upstream 957860 43149762 ~ 43150384 (+)
LOC110502157 LOC106582435 other upstream 1372377 42688215 ~ 42735867 (+)
G1812428 NA other upstream 1384130 42723672 ~ 42724114 (+)
LOC110501889 LOC106582433 other upstream 1718957 42256417 ~ 42389468 (+)
G1810740 NA other upstream 2641895 41464478 ~ 41466349 (+)
G1813588 ino80d other downstream 251794 44362661 ~ 44371923 (+)
G1813665 LOC106582464 other downstream 387590 44498457 ~ 44508051 (+)
LOC110501918 LOC106582467 other downstream 456021 44566863 ~ 44573921 (+)
G1814811 NA other downstream 999680 45110547 ~ 45111229 (+)

Expression


Co-expression Network