G1815303


Basic Information

Item Value
gene id G1815303
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 45182192 ~ 45233653 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2076753
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>TU2076755
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>TU2076757
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>TU2076745
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>TU2076748
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>TU2076754
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>TU2076758
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>TU2076759
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>TU2076756
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>TU2076762
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>TU2076747
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>TU2076749
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>TU2076763
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2076747 False 1670 lncRNA 0.36 5 45196925 45233653
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TU2076750 False 592 lncRNA 0.36 2 45207932 45216874
TU2076764 False 493 lncRNA 0.36 3 45207932 45230257
TU2076763 True 555 lncRNA 0.38 2 45223632 45231205

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110501927 hoxd9ab coding downstream 236905 44943212 ~ 44945287 (-)
LOC110502174 LOC106572616 coding upstream 130837 45343530 ~ 45365813 (-)
LOC118943595 LOC106582449 coding upstream 186232 45419885 ~ 45432246 (-)
LOC110501936 LOC106572616 coding upstream 223573 45457226 ~ 45458628 (-)
LOC118943614 gdf3 coding upstream 286194 45519847 ~ 45520832 (-)
LOC110501935 gdf3 coding upstream 299444 45533097 ~ 45543990 (-)
G1815256 NA non-coding downstream 9977 45165049 ~ 45172215 (-)
G1815262 NA non-coding downstream 59753 45122212 ~ 45122439 (-)
G1815260 NA non-coding downstream 61483 45118988 ~ 45120709 (-)
G1815259 NA non-coding downstream 62877 45118506 ~ 45119315 (-)
G1815253 yo84 non-coding downstream 66796 45115087 ~ 45115396 (-)
G1815325 NA non-coding upstream 9144 45242797 ~ 45243013 (-)
G1815396 NA non-coding upstream 141840 45375493 ~ 45414973 (-)
G1815400 NA non-coding upstream 156044 45389697 ~ 45449161 (-)
G1815402 NA non-coding upstream 158643 45392296 ~ 45433726 (-)
G1814480 NA other downstream 508304 44673447 ~ 44673888 (-)
LOC110502171 LOC106582464 other downstream 628772 44473683 ~ 44553607 (-)
G1812404 NA other downstream 2504432 42677257 ~ 42677760 (-)
LOC110502155 psd12 other downstream 2577172 42603998 ~ 42605768 (-)
G1812079 LOC106582433 other downstream 2792919 42386822 ~ 42389273 (-)
G1815615 LOC106582489 other upstream 605097 45838750 ~ 45840982 (-)
G1816841 NA other upstream 1991898 47225551 ~ 47226646 (-)
G1816929 NA other upstream 2167469 47400985 ~ 47402047 (-)
G1817287 LOC106582526 other upstream 2237641 47471294 ~ 47473384 (-)
LOC110501953 ihh other upstream 2828396 48057851 ~ 48064453 (-)

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