G1817460



Basic Information


Item Value
gene id G1817460
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 47870020 ~ 47877837 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU2079427
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>TU2079430
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>TU2079432
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>TU2079433
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>TU2079435
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Function


NR:

description
uncharacterized protein LOC110517325 isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2079427 False 324 lncRNA 0.52 2 47870020 47871184
TU2079430 False 3087 lncRNA 0.41 2 47871378 47877719
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TU2079433 False 2881 lncRNA 0.40 2 47871378 47877837
TU2079435 True 3304 lncRNA 0.41 3 47871378 47877837

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
ptprna LOC106582506 coding downstream 35766 47733219 ~ 47834254 (-)
LOC110501961 LOC106582505 coding downstream 234380 47628880 ~ 47635640 (-)
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LOC110501994 hnmt coding downstream 766192 47086871 ~ 47103828 (-)
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LOC110501953 ihh coding upstream 180014 48057851 ~ 48064453 (-)
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LOC118943644 NA coding upstream 1084375 48962212 ~ 48964633 (-)
G1817451 NA non-coding downstream 17379 47852361 ~ 47852641 (-)
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G1817406 NA non-coding downstream 139812 47729357 ~ 47730208 (-)
G1817380 NA non-coding downstream 157931 47683477 ~ 47712089 (-)
G1817479 NA non-coding upstream 43699 47921536 ~ 47922173 (-)
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G1817541 NA non-coding upstream 153556 48031393 ~ 48034662 (-)
G1817543 bin1 non-coding upstream 162193 48040030 ~ 48080797 (-)
G1817287 LOC106582526 other downstream 396636 47471294 ~ 47473384 (-)
G1816929 NA other downstream 467973 47400985 ~ 47402047 (-)
G1816841 NA other downstream 643374 47225551 ~ 47226646 (-)
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G1814480 NA other downstream 3196132 44673447 ~ 44673888 (-)
G1817668 NA other upstream 390950 48268787 ~ 48291496 (-)
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G1818059 NA other upstream 749527 48627364 ~ 48627846 (-)

Expression



Co-expression Network