XLOC_037311 (BX664716.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037311
gene name BX664716.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 36794384 ~ 36797834 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00073420
CAACGGCTATCCTAATTTGAAATCCACCTGTCGCCTTTTTCTCcagtgaattcatcctcgcacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaagccacagcaattgatgttgaaaaagtgatgctaccaatctctcctctcttgattattcaaggtaatgttgatgtcttcctcattttgaaatgtcaagttgttcacagatttgttgtgaggagtttcatgtacaacctctttttcttcttccagtag
>TCONS_00073421
cacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaagccacagcaattgatgttgaaaaagtgatgctaccaatctctcctctcttgattattcaagctcagattgtgatagacctggaatgtgacaccagatactcttaagtcaagaaccaaataaagcacagatgtggagggatctgcaactaaactaactggaggaaaggaacctttagtgtgggtgaacatactaccttgatgtccagcaaaggctgcacaagagctcatttgatggcacatattctgtcctgtctacatctctgacgacctggaagtgcttcgacattagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtcccttttccacaacatcatttgaccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaatactttttgatgcatttattgttgactggttttaatgatcaattgttcattagtgttctgttgctttgttatat
>TCONS_00073422
cacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaagctcagattgtgatagacctggaatgtgacaccagatactcttaagtcaagaaccaaataaagcacagatgtggagggatctgcaactaaactaactggaggaaaggaacctttagtgtgggtgaacatactaccttgatgtccagcaaaggctgcacaagagctcatttgatggcacatattctgtcctgtctacatctctgacgacctggaagtgcttcgacattagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtcccttttccacaacatcatttgaccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaatactttttgatgcatttattgttgactggttttaatgatcaattgttcattagtgttctgttgctttgttatattgaataattgctactgtttcagtagggtttacacaataaacttttattgtgaa
>TCONS_00073423
cacaacactgagatgaaggcaaagtcaccatgaaaagttaaacgtttaacgttaaggtaagctctggtcttcatgtggtcattatgactaagttatcattatggttaaatttgtaaactgtaagttagttattcaCTAAACTCACTAATGAAACAAgtctaactgttttattaaattgagctgataataaaattcagtttatgtcttttaagctaacgttaatattaacataattcatattaattgtctatttctcactggttaatgagcttattgtataacgttagtgtgtcattaattgtacattttatttttggtgttcaggtgtagggaatgatttgtatacaaatttatttgaaccccatacagatttgtatggttgtaccatagatttagattattaaatgttaagtattattttactcttattatatttatcttttttgcagccacagcaattgatgttgaaaaagtgatgctaccaatctctcctctcttgattattcaagctcagattgtgatagacctggaatgtgacaccagatactcttaagtcaagaaccaaataaagcacagatgtggagggatctgcaactaaactaactggaggaaaggaacctttagtgtgggtgaacatactaccttgatgtccagcaaaggctgcacaagagctcatttgatggcacatattctgtcctgtctacatctctgacgacctggaagtgcttcgacattagatcatcagaagtgctgctgccctttttcactgtcccttttccacaacatcatttgaccttcatcatttcctgtcttgtagcagtattttcacctgtttttaaaattgtaatactttttgatgcatttattgttgactggttttaatgatcaattgttcattagtgttctgttgctttgttatattgaataattgctactgtttcagtagggtttacacaataaacttttattgtgaagttaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000093486

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00073420 False 271 processed_transcript 0.39 3 36794384 36795322
TCONS_00073421 False 528 processed_transcript 0.39 5 36794719 36797775
TCONS_00073422 False 521 processed_transcript 0.38 4 36794719 36797828
TCONS_00073423 True 980 processed_transcript 0.33 4 36794719 36797834

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037310 NA coding upstream 18870 36770664 ~ 36775514 (+)
XLOC_037309 lrp1bb coding upstream 99386 36314867 ~ 36694998 (+)
XLOC_037308 NA coding upstream 616963 36124753 ~ 36177421 (+)
XLOC_037307 NA coding upstream 691712 35987844 ~ 36102672 (+)
XLOC_037306 atp1a1b coding upstream 872183 35901554 ~ 35922201 (+)
XLOC_037312 NA coding downstream 130221 36928055 ~ 36932532 (+)
XLOC_037313 si:dkey-3d4.3 coding downstream 148506 36946340 ~ 36956667 (+)
XLOC_037314 inhbb coding downstream 169460 36967294 ~ 36974879 (+)
XLOC_037315 NA coding downstream 193329 36991163 ~ 36991851 (+)
XLOC_037316 gli2a coding downstream 344002 37141836 ~ 37297485 (+)
XLOC_037302 CU074387.1 non-coding upstream 1365068 35429202 ~ 35429316 (+)
XLOC_037301 NA non-coding upstream 1626450 35160644 ~ 35167934 (+)
XLOC_037317 BX548071.1 non-coding downstream 383606 37181440 ~ 37181557 (+)
XLOC_037320 BX322793.1 non-coding downstream 614036 37411870 ~ 37411986 (+)
XLOC_037321 NA non-coding downstream 677313 37475147 ~ 37492914 (+)

Expression


Co-expression Network