G1820075


Basic Information

Item Value
gene id G1820075
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048586.1
NCBI id CM023240.2
chromosome length 52474311
location 51066827 ~ 51070429 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2082911
CCTATATTATGGTCCCCAGTATTACTACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTAAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTGTTACCACTGTCCCTGGTGTTGACCTCTATCATGGTACCCAGTATTACTACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTATATCATGGTCCCCAGTATTACCACTATCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTATATTATGGTCCCCAGTATTACTACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTACCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTACCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTCTATTATGGTACCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGTTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTTGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACTACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTCCACTGTCCCTTGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCTATATTATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGCTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATTATGGTCTCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCTCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCT
>TU2082912
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>TU2082913
CCTATATTATGGTCCCCAGTATTACTACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCATATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATTATGGTCTCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCCCCAGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCTCTATCATGGTCTCCTGTATTACCACTGTCCCTGGTGTTAACCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2082911 False 2039 lncRNA 0.48 2 51066827 51070429
TU2082912 False 3559 lncRNA 0.48 2 51066827 51070429
TU2082913 True 475 lncRNA 0.48 2 51066827 51070429

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118943624 NA coding downstream 3778 51061656 ~ 51063049 (-)
LOC118943622 NA coding downstream 9315 51054964 ~ 51057512 (-)
sumo-1 sumo-1 coding downstream 13867 51041718 ~ 51052960 (-)
LOC118943621 NA coding downstream 27209 51037464 ~ 51041332 (-)
als2a NA coding downstream 106092 50872455 ~ 50960735 (-)
fam117bb LOC107593013 coding upstream 38887 51109316 ~ 51189736 (-)
bmpr2b bmpr2 coding upstream 127174 51196922 ~ 51376938 (-)
tspearb tspear coding upstream 325452 51395881 ~ 51450125 (-)
ube2g2 ube2g2 coding upstream 398368 51468797 ~ 51501268 (-)
LOC110501977 LOC106562996 coding upstream 431424 51501853 ~ 51504398 (-)
G1820033 NA non-coding downstream 98962 50967404 ~ 50967865 (-)
G1820019 NA non-coding downstream 144183 50919568 ~ 50922644 (-)
G1820011 NA non-coding downstream 175187 50891279 ~ 50891640 (-)
G1820008 NA non-coding downstream 184583 50881406 ~ 50882244 (-)
G1820077 NA non-coding upstream 19385 51089814 ~ 51090146 (-)
G1820059 NA non-coding upstream 121380 51191809 ~ 51195296 (-)
G1820122 NA non-coding upstream 146002 51216431 ~ 51217195 (-)
G1820129 NA non-coding upstream 179468 51249897 ~ 51250315 (-)
G1820053 LOC106582548 other downstream 40646 51023438 ~ 51026181 (-)
G1820012 NA other downstream 169674 50896572 ~ 50897153 (-)
cd28 LOC100136275 other downstream 569836 50495067 ~ 50496991 (-)
si:ch211-67e16.4 LOC106582542 other downstream 603065 50460094 ~ 50465680 (-)
G1819250 NA other downstream 761789 50301801 ~ 50305038 (-)
carf LOC106582551 other upstream 12560 51059254 ~ 51085922 (-)
G1820212 NA other upstream 355974 51426403 ~ 51427042 (-)
myo10l3 LOC106582557 other upstream 464543 51510785 ~ 51699385 (-)
G1820680 cssa21h3orf70 other upstream 888651 51959080 ~ 51959638 (-)

Expression


Co-expression Network