LOC118943921 (LOC106600605)


Basic Information

Item Value
gene id LOC118943921
gene name LOC106600605
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 3553536 ~ 3601859 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>TU2087616
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Function

NR:

description
PREDICTED: N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2087617 False 2003 lncRNA 0.39 2 3553536 3555568
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TU2087614 True 4864 lncRNA 0.43 5 3555639 3561047

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110514665 LOC106577322 coding downstream 35972 3325040 ~ 3520011 (-)
LOC118943858 NA coding downstream 131133 3424368 ~ 3425279 (-)
LOC118943857 LOC106563104 coding downstream 230959 3281355 ~ 3325024 (-)
trnav-uac-97 NA coding downstream 316023 3239888 ~ 3239960 (-)
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LOC118943842 LOC106577176 coding upstream 189180 3791031 ~ 3820702 (-)
LOC118936586 pex13 coding upstream 219430 3821289 ~ 3830217 (-)
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G1823141 NA other downstream 1049540 2505567 ~ 2506443 (-)
G1822333 NA other downstream 1305766 2200585 ~ 2250217 (-)
G1823691 NA other upstream 242634 3844493 ~ 3846920 (-)
G1823705 NA other upstream 301862 3903721 ~ 3906049 (-)
G1823710 NA other upstream 332034 3933893 ~ 3936043 (-)
G1824125 NA other upstream 1059732 4661591 ~ 4662234 (-)
G1823558 NA non-coding upstream 17149 3578196 ~ 3579077 (-)
G1823560 NA non-coding upstream 19901 3580948 ~ 3613716 (-)
G1823565 NA non-coding upstream 33582 3594629 ~ 3598267 (-)

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