LOC110502271 (LOC106604578)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110502271
gene name LOC106604578
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 12511375 ~ 12529518 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021580177.2
AATTGTGTCACGTTTCCACAGCAATTGAAATCTAATCAGAAGTAGACTTGTTATTGCTTGTTGGGCATTGTATTCCCACTTTCACAAATGTTTAGTTGACAGATGGTGTGTGGAACTGTATATGATGGAAAGTGTGGTGAACATGTCAATTGATTACAAGaGTGCCTTGGAGGTGTACAAGGAGATGCTGTTGCTCTACCTGGAGGAAGGCAGGCGGCTTGTGAACACCAACTGTGAGGCGTTGGAACCATGGCAGATCATTGGAGCCACTCTCATATCTACCTTAGGAGCAGTCTGGGTCAAAGGCTTCCTGTTTCAGCAAGAAACCCTGACATCCCGAATCAAGAAGCAGTGCTTTCGACTCATCAGaaaaataccctttgttggcgcGGCAATCCAGACCCAGCTGAACAAGGCCCTGGATGACATGTCTGTCAGTCTTTGCACACTGAAGGAGGGCATGAACTACACCAAACAGCTGCCTGAACAAGGGCTAACCCAAGCTGAAGTTCTAGACAGGATCAGCGAGTACGAAACACTGAatgaagtGGATTGGGAGAATGGACGAGTGTCCGGTGCAGTGTACTGGGGAGATCAGACACTTACCAAACTTTTGGTGAAGGTGTATGGAGACTTTGCATGGAGCAACCCACTTCACCCAGACATCTTTCCTGGTGTGAGGAAGATGGAGGCAGAGGTTGTAAGAATGACGTGTACCCTCTTCAACGGTGGGCCCAACACTTGTGGCACAGTCACCTCTGGAGGAACTGAAAGCATATTGATGGCATGCAAGGCGTACAGAGACATGGCCTATGAGCGCGGTGTGAAACATCCTGAAATCATAGCACCAGTCAGTGTCCATGCCGCCTTTGACAAAGCAGCAAACTACTTTGGAATGAAGCTTGTTCACATCCCCCTGGACAAAAATACATTGAAAGTGGATGTTAAGGCGATGAGGAGAGCTATCAGCAAGAACACAGCCATGCTTGTATGTTCCGCACCCCAGTTCCCGCATGGAATCATTGATCCTATTGAGGAAGTAGGAAAGCTGGCTTTAAAGTACAACATCCCTTTGCATGTGGATGCTTGTTTGGGAGGGTTTCTCATCGTGTTCATGGCCAAAGCCAATTACCCACTGGCTCCCTTTGACTTCAGGGTAAAGGGTGTGACCAGTATATCTGCAGACACACACAAGTATGGCTACGCCCCTAAAGGTTCATCAGTGATCCTGTATAGTGACAAGAAGTACAGGCACTACCAGTACTTTGTGGCTCCAGACTGGCAAGGGGGCATCTATGCGTCCCCATCAGTGGCAGGATCTCGGCCAGGCGGTATCATCGCAGCGTGCTGGGCTACCATGATGCACATGGGAGAGGATGGCTACATAAAGGCCACCAAGAAGATAATTGATACTGCACGTACCATCAAGACAGAAATCCGTAAGATAAATGGGGTGTTTGTGTTTGGAGACCCTGAAGTGTCCGTGGTGGCAATAGGCTCTGACGTCTTCGACATTTTTCGTTTATCCAACGCACTGACTTCAAAGGGTTGGAATCTCAACATGCTACAGTATCCATCCAGCATCCATATctgttgtactgtactgcacaCACATGAAGGTGTGGCCAAACAGTTAATCAGTGACATCAAAGAGCAGGTGGCTGTCATTTTGAAAAACCCCAATGAGAAGACCACTGGAATGGGAGCAATCTATGGCATGGCCCAGTCCATCCCTGACAGATCCATGGTGACCGAGATCTCCCGAGGCTTCTTGGACTGCCTCTACAGCACAGAGGAGCCCAAGTCGTCTCAGCCTCAGAAGACCCATATGAATGGCAACGGCAAGGCCCACTGAGTCAGGAGTAGGCTGGCTGTGGCCTGGACAcacacctgggtcatgttcattagggaacATAATGGTAAGCGTTgtgaaacgttttgcaacggaaaatgaAAAGGAGCGTTTACTGGATAAGCTCAAGTAGTCCCTCCATGATTCAGTCCATTTTCTTCAGGTCGGTGACTAATGAACACGGCCCTGGTTACCAGCCTGCCTCACCTCTGGTCCACCCGCTACATCACTCAACATTTGCCTTATCCTGCCCACCTTTTATCTACCTACTCACCTTTTTTCAGATATGTTCTGAAGCACAAGCCATTGTTTTTAGCTATCGTGAGGAGAATTCTTCAAATATGTAGAAAGTGAAAGCACCTATTGTACAAAAATATATAGAATAGTTGCTCAAACCATTGAGGGGTTTTGGTCTGTTTGTATTAATTGTCCCCCACGATGAAATCAGGGATGGGACTATTGATCTGTCTCCGTACATTCATACGTTAGTCACACGcgatatctcagacagcactggcCCGATTTTGACAAAACTTATGTGAATGAAGCATCTGCCGTGATAAAAAAAACACTCAATGCTACTCTTCTGACACCAAATGAGCGATCTGCATGAAACTTAACATGTGGCATCTATGAACTAAGATCTCTCAGCGGAATATTTTCCAGACTAGTACCTAAAACAACATGCCCACTATTGAGTCTAGCTAACCCTCGCAATATTTTGATGGAACTTGGGGGAATTATCTGTCTTTTAGAAAAGTTTGTGGTCATACGCACATCCTTAACAACGTAGGGGCTGGGCTAATAAAGAATATGTGTAAAGAACAGGAAAGCCTGCACACTGTTAAAGCTCCCAATTCGCAGCTTTATTCACAATGTTTCGATCCAAAACAGATCTTCATCCAGTCAAACAGACTGAGTGCTCACATcccaaaatatacacatttcacctCACATGACGCATGGTGGGTGTGGAATTAATTCAATTCACTTTTGCGCATAGTCAATCATATAATTAATCCCAGAGGTACTCATGGTCATAAAGGATTAAATGCATACAAATGAAAACATGGGCAACAGTAAAACGATTTGTAAACTGTTGTAATACCCAACCATATGACCATTACATGCAGGTCGTGCAGTGGCTGTAGATATAATTACAATtacctattttttttaaaactactTGCCTACCTCCTAATAATTTGATATCAATGAGATGGGCACATGTAGTAGTTACAGAAAATCAAATGAGAgctaccttttgcagcaattacagctgcaagtctcttggggtgtctattagcttggcacatctagctacTGGGTTTTTTGCCCATTCTGCAAGGCATAACccttttcatttcacttcaacaattttgactttttgtatatgtccattatatgtaattcaaataaaaaaatccacttaaattacaggttgtaatgcaacaaaatgggaaaaatgtcaagggAGATGAACACTTTTACAAGGCACTGTATTGGCTGATAGCTTACACCCTTATGAGCCCCCCTATCTCTGTGTAACAGGGAATTCCTGTTCCGCCGGCTCCCTATAGGTCTGTGCTAAAGCCAACTCCCTCTTTATCAAAATGTCTTGCCCTAGAGATCTAGCATTTACAGAATTACTCATTGGCCCAAGAGAGGCACTACAGTAATCGACTGTATGTACATTAGTCACATGCGATATCTCAGACAACTGCACTGCATCATTTGTGGAGGATGACATGTTCATTGTTGCCTTgtttaacacctgatttacttaacaaaaagcacatctcaataggtggttcAGGTAAATCATGATATCGCTAAAGGGGGACTTTCCTATTTTTCTCTATTGCGCCTCTACTTTTCCTCAAGCAAGGGAGAggctgacttttttttttttttaccctttagtgtgtgtactttGGGATATCGCTTTAACAGTAAACAAAAATCGCCAGAGGACATCTTTCATACTCAATGTTCCAGGTACAACAGTGTTTGTCAGTCTCTGATTCATCTACAACAAATAATGGTTTTAACTGAAAAGCACTAATGTCCTAGTGAAATAAATACTTACCCAGTGAACAGGAGGGAGCAATGCTCTCTGCATGTATTTGTAAGGACAACATACTTGAATCTAAGACTTGAGCCCATTTTGAATTTAACATTACCTACCTAGGCTTGTACTATATTGCATATATACATGTATGACTAATTGTGGTCAGTTTGTGGCTATTTGCATCTTTCAGTAATAATTTAGACTGCAAGAAACCCTGGCTGCTGTAACACATGACCTAGTATACTGTACACCGCCACTATGTTATTAAGAATCTGAGACTGCAATCCACTGATCAACATATTCATTACCCCCTCTATTCTTTGAGACAATGGTTTAGCCCTTAATTGAATGGTTTAGACCTGAAATGATCTCAAAGAACAGAATACATACTGAAATATCTTTAGAAGTTGTAAAGTCTCCATCTCAGTTATGTGTTCTTGTAGCTAATTAATTGATTTGGCTTCTAATTTTATCTACCTCAGTTTCTGTTCAATGCAATTGTGTTGCTTGTTCAGTCATTATAGGTCTAAAGAATACCGGAAAAGCCTGCCTCAGTTTTTTTCATATGTAACATTTAAATGTATGGCATTTGATAAACTGCAGTGTTCTTAAAAAAAGCAATAATGGTATAAAACTGTttgcaaaaaaataataaatactgGATGTACACTTGGTATGCCCCCAAAACACACTTCAAATGATCTTTACATCAAAATGTTCCATGTGCTTTCACATTTGTGTTTGCAGTCAAACTTAAGTGAATATCCACTTTTCTTTCCATGTCTGtagctaggtttctatccaaTTGACAACAGATTCATACgaatatttaaaaaattaacaAAGAAAATACTGCATGCTCACTTTCCCACCAGTGATGTTTCCACCAAACAGACCTGTTGCGGATAAAACTCATTGCGTGATAACGTAGGgcacaaaacattttatttttcgcTGAAGTTTATGTACCGACCCCCAAACAAATctgaagttcaatgtgtttccatcgcaaTCTTCAACTCTACTgacagttttgtcacaaactgttgcGTTAATTAGCAAATGTGCCGGCTCTGGTCTTGACACAAGtgcgggtaggctagtctacacgaTATTATGCATATGAATGTTTTATTTGTCAAGCATCGATTATCATGTTACCAGACTATGACCATCGATATTTAATGGAAAGGAGCATCATgctcaccgtgcactttcaccacgcTGTGCTCaccatttatttaatctgtaatTTAATAAACGGTATGGTTTTccaagtcgtagtgggaggaccacacactaTCATCGAGTGACTCAaattacttcgatatgatggttattatatttcTATTTGgcgcataaaggcgtttccaccgccatttctctcatcatacattttacagacaaaaaGATCACACCATGCCGAACAAACAAATGATCTGTCgtatttataaaattgtaccgacACTTCCATTTCTTTTGAATACTTTTACTTTACTCACAAAACTGTGGAGGGAAATGTGGTTTGTGTCGTAGATGTTTAACCTTCTGGAGTCATAAAAAGGGAAATAATCTGACAATGTTATAATGATGCGATGGCTTTTAAATCATACAATTTTACTTTTAGCCCAGTCCTGTTGTATAATTCTTAAGCATTGTCTGTGTGACCACTGTTTTTATTCTTATTAATCACTGTGATTTTTCTTATCTGCAACGATTGTGTTTTGGGGTAAATACTAATTTGTGGGTCAATCCTGGTCCTTGAAGGCTTTGATTGGTTTTCTAGCTCAAAATCAATACTTGATTATATAGCAACTATGAAAACCAATAAGACAGGGTGGCCCTCAGACGAGTTGAGGACACTAGCTGGATTACctgaaaatgtacagtaaatataGTAGTTAGTGGAACCATACAGTACCACTGAACAAAAGGGTAAAAGATCTGACAATGTGTAGTTTCTATTTTTTAGGTGGAGCCATCAATGGAGAAATAACCACTAATATGTTGACATTTTTAATAGCCAGGAGTATATTAAATTGCAAAAGAAACAAAGGTAATTTAATGTAAATTGTGATAGTACCTGAATTGCTGCTTAGTGCTTACCCCACCATAGTCTAAATTGTACAGTGTAAATCTTAACAAAGCACCTTGCCCTCAAGGAGGTAGGGTTAAGATCATGCCTTCTGTTATTGTCTAAGGGCATAATCTTCACAGCAATAAATCACATTCACCTGTATGCCTTCAGAGGCCAGATTAATGAGGGCTGTTGGGTAATACCAATGTATAGAATCTCAAAATGTAGATTCTATTTATGTATCGATCAGCCTTATGGATTTGGCTTCGCAACATCAAGTTCAGTAAGGTCCAGTTAatttatactgtacatgtaaaatgTTAATTTTAATATCATGAAATGTTTTTGAAAATCTAAAAATATAGTAGCATGAATTTGTAGCTATTTGTATTATTGAGTAGTTTCTTGCTACCCTTCATTATTCCAGAGAAAACCCCGTTGGAAAGCATTTGTTGGCCATGGTTACACTCCTTTCAGCACAACAATTGATTCCAAAATACTTTCAGCACACAGGAAGCTGAGCACCATAACAATTTCAATAAACCTACAACA
>XM_021580178.2
TCGCTTCCTGAATTTAGGTTACGATTGTCTGTGATATAGTGCCATGTAAATCAGATCCTCGATCACAAAGCACGCTATACAAAGATATTGGAGTGACTTTCGCTACCACTAAAAAGTGAAGACAACCATTTGCTGAAGGCTTGCCTTGACACTAACTATGGACTATTTGaGTGCCTTGGAGGTGTACAAGGAGATGCTGTTGCTCTACCTGGAGGAAGGCAGGCGGCTTGTGAACACCAACTGTGAGGCGTTGGAACCATGGCAGATCATTGGAGCCACTCTCATATCTACCTTAGGAGCAGTCTGGGTCAAAGGCTTCCTGTTTCAGCAAGAAACCCTGACATCCCGAATCAAGAAGCAGTGCTTTCGACTCATCAGaaaaataccctttgttggcgcGGCAATCCAGACCCAGCTGAACAAGGCCCTGGATGACATGTCTGTCAGTCTTTGCACACTGAAGGAGGGCATGAACTACACCAAACAGCTGCCTGAACAAGGGCTAACCCAAGCTGAAGTTCTAGACAGGATCAGCGAGTACGAAACACTGAatgaagtGGATTGGGAGAATGGACGAGTGTCCGGTGCAGTGTACTGGGGAGATCAGACACTTACCAAACTTTTGGTGAAGGTGTATGGAGACTTTGCATGGAGCAACCCACTTCACCCAGACATCTTTCCTGGTGTGAGGAAGATGGAGGCAGAGGTTGTAAGAATGACGTGTACCCTCTTCAACGGTGGGCCCAACACTTGTGGCACAGTCACCTCTGGAGGAACTGAAAGCATATTGATGGCATGCAAGGCGTACAGAGACATGGCCTATGAGCGCGGTGTGAAACATCCTGAAATCATAGCACCAGTCAGTGTCCATGCCGCCTTTGACAAAGCAGCAAACTACTTTGGAATGAAGCTTGTTCACATCCCCCTGGACAAAAATACATTGAAAGTGGATGTTAAGGCGATGAGGAGAGCTATCAGCAAGAACACAGCCATGCTTGTATGTTCCGCACCCCAGTTCCCGCATGGAATCATTGATCCTATTGAGGAAGTAGGAAAGCTGGCTTTAAAGTACAACATCCCTTTGCATGTGGATGCTTGTTTGGGAGGGTTTCTCATCGTGTTCATGGCCAAAGCCAATTACCCACTGGCTCCCTTTGACTTCAGGGTAAAGGGTGTGACCAGTATATCTGCAGACACACACAAGTATGGCTACGCCCCTAAAGGTTCATCAGTGATCCTGTATAGTGACAAGAAGTACAGGCACTACCAGTACTTTGTGGCTCCAGACTGGCAAGGGGGCATCTATGCGTCCCCATCAGTGGCAGGATCTCGGCCAGGCGGTATCATCGCAGCGTGCTGGGCTACCATGATGCACATGGGAGAGGATGGCTACATAAAGGCCACCAAGAAGATAATTGATACTGCACGTACCATCAAGACAGAAATCCGTAAGATAAATGGGGTGTTTGTGTTTGGAGACCCTGAAGTGTCCGTGGTGGCAATAGGCTCTGACGTCTTCGACATTTTTCGTTTATCCAACGCACTGACTTCAAAGGGTTGGAATCTCAACATGCTACAGTATCCATCCAGCATCCATATctgttgtactgtactgcacaCACATGAAGGTGTGGCCAAACAGTTAATCAGTGACATCAAAGAGCAGGTGGCTGTCATTTTGAAAAACCCCAATGAGAAGACCACTGGAATGGGAGCAATCTATGGCATGGCCCAGTCCATCCCTGACAGATCCATGGTGACCGAGATCTCCCGAGGCTTCTTGGACTGCCTCTACAGCACAGAGGAGCCCAAGTCGTCTCAGCCTCAGAAGACCCATATGAATGGCAACGGCAAGGCCCACTGAGTCAGGAGTAGGCTGGCTGTGGCCTGGACAcacacctgggtcatgttcattagggaacATAATGGTAAGCGTTgtgaaacgttttgcaacggaaaatgaAAAGGAGCGTTTACTGGATAAGCTCAAGTAGTCCCTCCATGATTCAGTCCATTTTCTTCAGGTCGGTGACTAATGAACACGGCCCTGGTTACCAGCCTGCCTCACCTCTGGTCCACCCGCTACATCACTCAACATTTGCCTTATCCTGCCCACCTTTTATCTACCTACTCACCTTTTTTCAGATATGTTCTGAAGCACAAGCCATTGTTTTTAGCTATCGTGAGGAGAATTCTTCAAATATGTAGAAAGTGAAAGCACCTATTGTACAAAAATATATAGAATAGTTGCTCAAACCATTGAGGGGTTTTGGTCTGTTTGTATTAATTGTCCCCCACGATGAAATCAGGGATGGGACTATTGATCTGTCTCCGTACATTCATACGTTAGTCACACGcgatatctcagacagcactggcCCGATTTTGACAAAACTTATGTGAATGAAGCATCTGCCGTGATAAAAAAAACACTCAATGCTACTCTTCTGACACCAAATGAGCGATCTGCATGAAACTTAACATGTGGCATCTATGAACTAAGATCTCTCAGCGGAATATTTTCCAGACTAGTACCTAAAACAACATGCCCACTATTGAGTCTAGCTAACCCTCGCAATATTTTGATGGAACTTGGGGGAATTATCTGTCTTTTAGAAAAGTTTGTGGTCATACGCACATCCTTAACAACGTAGGGGCTGGGCTAATAAAGAATATGTGTAAAGAACAGGAAAGCCTGCACACTGTTAAAGCTCCCAATTCGCAGCTTTATTCACAATGTTTCGATCCAAAACAGATCTTCATCCAGTCAAACAGACTGAGTGCTCACATcccaaaatatacacatttcacctCACATGACGCATGGTGGGTGTGGAATTAATTCAATTCACTTTTGCGCATAGTCAATCATATAATTAATCCCAGAGGTACTCATGGTCATAAAGGATTAAATGCATACAAATGAAAACATGGGCAACAGTAAAACGATTTGTAAACTGTTGTAATACCCAACCATATGACCATTACATGCAGGTCGTGCAGTGGCTGTAGATATAATTACAATtacctattttttttaaaactactTGCCTACCTCCTAATAATTTGATATCAATGAGATGGGCACATGTAGTAGTTACAGAAAATCAAATGAGAgctaccttttgcagcaattacagctgcaagtctcttggggtgtctattagcttggcacatctagctacTGGGTTTTTTGCCCATTCTGCAAGGCATAACccttttcatttcacttcaacaattttgactttttgtatatgtccattatatgtaattcaaataaaaaaatccacttaaattacaggttgtaatgcaacaaaatgggaaaaatgtcaagggAGATGAACACTTTTACAAGGCACTGTATTGGCTGATAGCTTACACCCTTATGAGCCCCCCTATCTCTGTGTAACAGGGAATTCCTGTTCCGCCGGCTCCCTATAGGTCTGTGCTAAAGCCAACTCCCTCTTTATCAAAATGTCTTGCCCTAGAGATCTAGCATTTACAGAATTACTCATTGGCCCAAGAGAGGCACTACAGTAATCGACTGTATGTACATTAGTCACATGCGATATCTCAGACAACTGCACTGCATCATTTGTGGAGGATGACATGTTCATTGTTGCCTTgtttaacacctgatttacttaacaaaaagcacatctcaataggtggttcAGGTAAATCATGATATCGCTAAAGGGGGACTTTCCTATTTTTCTCTATTGCGCCTCTACTTTTCCTCAAGCAAGGGAGAggctgacttttttttttttttaccctttagtgtgtgtactttGGGATATCGCTTTAACAGTAAACAAAAATCGCCAGAGGACATCTTTCATACTCAATGTTCCAGGTACAACAGTGTTTGTCAGTCTCTGATTCATCTACAACAAATAATGGTTTTAACTGAAAAGCACTAATGTCCTAGTGAAATAAATACTTACCCAGTGAACAGGAGGGAGCAATGCTCTCTGCATGTATTTGTAAGGACAACATACTTGAATCTAAGACTTGAGCCCATTTTGAATTTAACATTACCTACCTAGGCTTGTACTATATTGCATATATACATGTATGACTAATTGTGGTCAGTTTGTGGCTATTTGCATCTTTCAGTAATAATTTAGACTGCAAGAAACCCTGGCTGCTGTAACACATGACCTAGTATACTGTACACCGCCACTATGTTATTAAGAATCTGAGACTGCAATCCACTGATCAACATATTCATTACCCCCTCTATTCTTTGAGACAATGGTTTAGCCCTTAATTGAATGGTTTAGACCTGAAATGATCTCAAAGAACAGAATACATACTGAAATATCTTTAGAAGTTGTAAAGTCTCCATCTCAGTTATGTGTTCTTGTAGCTAATTAATTGATTTGGCTTCTAATTTTATCTACCTCAGTTTCTGTTCAATGCAATTGTGTTGCTTGTTCAGTCATTATAGGTCTAAAGAATACCGGAAAAGCCTGCCTCAGTTTTTTTCATATGTAACATTTAAATGTATGGCATTTGATAAACTGCAGTGTTCTTAAAAAAAGCAATAATGGTATAAAACTGTttgcaaaaaaataataaatactgGATGTACACTTGGTATGCCCCCAAAACACACTTCAAATGATCTTTACATCAAAATGTTCCATGTGCTTTCACATTTGTGTTTGCAGTCAAACTTAAGTGAATATCCACTTTTCTTTCCATGTCTGtagctaggtttctatccaaTTGACAACAGATTCATACgaatatttaaaaaattaacaAAGAAAATACTGCATGCTCACTTTCCCACCAGTGATGTTTCCACCAAACAGACCTGTTGCGGATAAAACTCATTGCGTGATAACGTAGGgcacaaaacattttatttttcgcTGAAGTTTATGTACCGACCCCCAAACAAATctgaagttcaatgtgtttccatcgcaaTCTTCAACTCTACTgacagttttgtcacaaactgttgcGTTAATTAGCAAATGTGCCGGCTCTGGTCTTGACACAAGtgcgggtaggctagtctacacgaTATTATGCATATGAATGTTTTATTTGTCAAGCATCGATTATCATGTTACCAGACTATGACCATCGATATTTAATGGAAAGGAGCATCATgctcaccgtgcactttcaccacgcTGTGCTCaccatttatttaatctgtaatTTAATAAACGGTATGGTTTTccaagtcgtagtgggaggaccacacactaTCATCGAGTGACTCAaattacttcgatatgatggttattatatttcTATTTGgcgcataaaggcgtttccaccgccatttctctcatcatacattttacagacaaaaaGATCACACCATGCCGAACAAACAAATGATCTGTCgtatttataaaattgtaccgacACTTCCATTTCTTTTGAATACTTTTACTTTACTCACAAAACTGTGGAGGGAAATGTGGTTTGTGTCGTAGATGTTTAACCTTCTGGAGTCATAAAAAGGGAAATAATCTGACAATGTTATAATGATGCGATGGCTTTTAAATCATACAATTTTACTTTTAGCCCAGTCCTGTTGTATAATTCTTAAGCATTGTCTGTGTGACCACTGTTTTTATTCTTATTAATCACTGTGATTTTTCTTATCTGCAACGATTGTGTTTTGGGGTAAATACTAATTTGTGGGTCAATCCTGGTCCTTGAAGGCTTTGATTGGTTTTCTAGCTCAAAATCAATACTTGATTATATAGCAACTATGAAAACCAATAAGACAGGGTGGCCCTCAGACGAGTTGAGGACACTAGCTGGATTACctgaaaatgtacagtaaatataGTAGTTAGTGGAACCATACAGTACCACTGAACAAAAGGGTAAAAGATCTGACAATGTGTAGTTTCTATTTTTTAGGTGGAGCCATCAATGGAGAAATAACCACTAATATGTTGACATTTTTAATAGCCAGGAGTATATTAAATTGCAAAAGAAACAAAGGTAATTTAATGTAAATTGTGATAGTACCTGAATTGCTGCTTAGTGCTTACCCCACCATAGTCTAAATTGTACAGTGTAAATCTTAACAAAGCACCTTGCCCTCAAGGAGGTAGGGTTAAGATCATGCCTTCTGTTATTGTCTAAGGGCATAATCTTCACAGCAATAAATCACATTCACCTGTATGCCTTCAGAGGCCAGATTAATGAGGGCTGTTGGGTAATACCAATGTATAGAATCTCAAAATGTAGATTCTATTTATGTATCGATCAGCCTTATGGATTTGGCTTCGCAACATCAAGTTCAGTAAGGTCCAGTTAatttatactgtacatgtaaaatgTTAATTTTAATATCATGAAATGTTTTTGAAAATCTAAAAATATAGTAGCATGAATTTGTAGCTATTTGTATTATTGAGTAGTTTCTTGCTACCCTTCATTATTCCAGAGAAAACCCCGTTGGAAAGCATTTGTTGGCCATGGTTACACTCCTTTCAGCACAACAATTGATTCCAAAATACTTTCAGCACACAGGAAGCTGAGCACCATAACAATTTCAATAAACCTACAACA

Function

NR:

description
sphingosine-1-phosphate lyase 1-like isoform X2

GO: NA

KEGG:

id description
K01634 SGPL1, DPL1; sphinganine-1-phosphate aldolase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021580177.2 False 6552 mRNA 0.41 14 12511375 12525187
XM_021580178.2 True 6561 mRNA 0.41 14 12511375 12529518

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502270 LOC106604566 coding downstream 68173 12413909 ~ 12443202 (-)
LOC110502269 LOC106604550 coding downstream 99565 12392924 ~ 12411810 (-)
LOC110502227 LOC106604178 coding downstream 168253 12285630 ~ 12343122 (-)
LOC110503075 LOC105010677 coding downstream 257128 12219657 ~ 12254247 (-)
LOC110502229 NA coding downstream 305713 12181538 ~ 12205662 (-)
LOC110502273 LOC106604587 coding upstream 30887 12560405 ~ 12576330 (-)
LOC110502275 LOC106604599 coding upstream 55792 12580816 ~ 12651383 (-)
pik3ap1 LOC106604619 coding upstream 124358 12653876 ~ 12687538 (-)
LOC110502279 emx2 coding upstream 514838 13044356 ~ 13049486 (-)
LOC110502281 eif3a coding upstream 538317 13067835 ~ 13084070 (-)
G1830906 NA non-coding downstream 30026 12481049 ~ 12481349 (-)
G1830891 NA non-coding downstream 38029 12473089 ~ 12473346 (-)
G1830880 NA non-coding downstream 45413 12465744 ~ 12465962 (-)
G1830868 NA non-coding downstream 50220 12451877 ~ 12461155 (-)
G1830844 NA non-coding downstream 103450 12407618 ~ 12407925 (-)
G1831083 NA non-coding upstream 9059 12538577 ~ 12538811 (-)
G1831088 NA non-coding upstream 16193 12545711 ~ 12546205 (-)
G1831092 NA non-coding upstream 21399 12550917 ~ 12551156 (-)
G1831093 NA non-coding upstream 22863 12552381 ~ 12552599 (-)
G1831095 NA non-coding upstream 23863 12553381 ~ 12553730 (-)
LOC110502234 LOC106604225 other downstream 557742 11907827 ~ 11953940 (-)
LOC118943913 drgx other downstream 708244 11798161 ~ 11807866 (-)
G1829918 NA other downstream 777449 11733430 ~ 11733926 (-)
G1829417 LOC106604325 other downstream 1307379 11203067 ~ 11203996 (-)
G1833570 NA other upstream 1990831 14520349 ~ 14520929 (-)
G1834810 NA other upstream 2636691 15166209 ~ 15166919 (-)
G1834927 NA other upstream 2969236 15498754 ~ 15500261 (-)
tmem254 cj057 other upstream 3136685 15666203 ~ 15671223 (-)

Expression


Co-expression Network