XLOC_037431


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037431
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 48869896 ~ 48877349 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00075212
CATTTTTGTTCATCTTAACCAATATAGTTGATGAAAGAATAGTTAGATATAGACGTAAATGTGGGTAAAAGCTGTAGTTTGAATGATAGTGGCAAAGTATATATGCATTTAATGAGTATTTTGAGCTGTTTAAATACCCTAAAAACAGCCTTTTGTGATTTTTATGAATATCCtacttgacatgttttttttaccCATAGATGAAACAAAATCAGGCAGAAAGCGTTGGTCTGTcgtgtttatttaaaatacatggcAACATAATTCATTAGTACCGCTGATAATCAGTTTTCCAGCAAAGGCAGAGAATACAGTTGTCTTTTTTTCTTAATTCTTCACCTTTTGACATCAAATGTAAACCACATAACACAGCAACCTGTCTGCAGTGCAAATAAGACGACGGCTAAAATTAGCTGTAGCGCTTGTCCAGATTAAACAGACAGCAGCATTGACCTCCTCCACACTGAAAGAAACAACAACCCAAAGCATTAAAATGAACTCAGCTGAATGATCATTGCGTTTAAAAAATGGGtagtaacaaaaataaaagcagtgtAAGGTGGTGTTTAATATTCAAAGTGCATGTTCACCGAGTGCTGCTCTCAAACAGTGTGATAATATATTTCATAATCTCATAATGTTTCTGAAGCATTTACTGAAGTACAGTAATGAAATCAAACCTTGATTATGATTGGAAACAGACTGGGATTCAATCAGGAGTGATTATCGAATATAATATACCTGCTGAATGAATATCACATCGAATAAATACTTTCCTGGAAATAAAGATGCAGAcactttgcttaaaacaagctgaatccttttttgttttgttttttcaaaatattaaattaaaataagtctCCGTTTCAATTTCGAACAATAGATCTGATAATCAAATCTGATAATCTGTTATCAAAAGTCTGGGCTCAGTAAAATGAGATGAATAGTGGAGAGAGGGGACAGTTGCAACACTTCTTGCCTTTCCTTCAGTTTCTCAAAgacaggtttttttttgtttgtttgtttgtttgttttgttgtggaaACTCCAAATTTTAATATGTTAAACTCACATCTATTGGACACCCATCCACATTGCTATAACATGTGTACATGCTGTATGATAATATTTGCAGAATTTAAACTTGAACAGACAAAGTCAAACGATGCAACTGACCCCGAGCAGGAGGACCGTTccaacatttattcaaatgtaataataaaaaaattaaaacatcaggtgggattttatttttattttttggtaaacaGACTAATTGTAAATTGGTTATGTAACCATTTAACCTACTGCACCCAGCCTGCTCTGAGCTGAGATTGAGccagcaaccttccgcatgggagtcagttgctctaacgagaaggctaaagaccatggtgtctagtgtctgttgctagagcacatttagaggtcagaggagtgaggtttacctgcatagcacttcactagctggcctccatgacactcaccccctaaacctcactctcatcccggacgagcccccacatgtaacccactggTCTACTGCACCCAGTCCGGTCTGAGCTGTGatcgaaccggcgattctttgcatgggagttgggtaatctaacaaggaggctaaatatTATAGTCTCAATTATCTGTcgttagagcacctttagaggtcagaggagtgaggtttagctGCATAGCATTTTGCTAGCTGTCCTCTATTACACTCACCCCTAAACGTCACTCCCATCCTGGACAAGCCCACACATGTAACCCATCGGTCGTACTGCTCCCAGCCTGGTCTGAGTTGGGATCAAAccggcaagtttatttatttatttacttattttgcatGGGATTCAGATGCTTTATTAAGGAGGCTAAAGAGCCTGGCCTCttgcatctgtcgctagagcaccttttaatgtcagaggagtgaggtttacccgcATAGCACTTTgttagctggcctccgttacacactcaccccctaaacctcactcttatcccggacgagcccccactttgaacttttttaaaattaattatttaaagcatTCATTCTCTCAAATTAAATTACTTTGCAACTGtgatcaaatttaaaatagtagattgttaaaatgacaaactttaaaatgaattttCTAATTGGGGACAAAACTGTCAACCATTATTAAACCATCTATGCTAGAGAGATACAATAGCTTTAACATCTTATATCTATACCTATCTAAAGCTAAGAAAGCAATGATTTAAATTCATACTAATTAATAATGTTTCACAAAAACAGATTAGACCGTATGAGAAATCCTCAAAAGGAGTTTGATACTGAAAGAATGGTCACATTTCTCTCAGATTGAAGGATGGTCTAACTGAGAATATGTAGTATGAATATTATCACTAGCCTTATCCTGATTGGATGAATAAGTCTTTGTGCAACTGCTCCATATTGCAATGGTCCCCACTGTCcactactttttttttcccccaaggaTGCATTAACTGAACATTTTAATTCATCATATAATCCCGAAAataattaacattcattcattttcttttcagcgtagtccctttattaatctgggatcaccacagaagaatgaaccgccaacttatccagcatatgttttacgcaatggatacccttccagctgcaacccatcactgggaaacaccaatacacgctcattcacacatatacacaatggccaattaagtttattcaattgacctatagtgcatgtgtttggactgtggaggaaacaggagcacccggaggaatcccacgccaacacggggagaacatgcagactccacagaaatggcaactgatccAGCAGGGGCTCGAATCGGCGACCTttatgctgtgaggtgacagtgataaccactgagccaccatgtcacccactgtaaatacagtatttttaccAAATAAACGTAGCCTTGATGAacatcttttaaaacaaaaatcttaCTAAGCCCAAACTTTAAAACAGTTCAGAAAATAAGTTTTAAGAAGGAATATGAGTGATCTGTGATGCATACCTTTATATTGGTTCATTTGGACATTGACTTGGGTGATTCTtccatttttaaaacactgtttgttATTCGTATTTCATGGAGACGTTGGTGCTCGTGACGGAACCGGTGCTCAACTGCTGGATTTCTCAATCTCTGTACTGATTTCTGCTTGAGAGCTGAATTATAATCTCAAATAACCATAGTGCATCATTGTGCTTAAACCATTTGAAGTCACTGGGCAACTGGACATACAGTGAAACACAATCACAGCATCATACAGCATTACCAGTTTAGACCATAGATATGAATATGCACAAGCCACATTTGAGCACTCCAGACACATCAATGTGTTGTTTTGATGAAAACAGATGTCAATACTCAGAcgatgaaacaaaaaaaatctaaaaatgttacTAATACATTCGGTGGGTCTGAAATCTCATAGTTCTCTACtatatacactgtgaaaaatagCTGTAAATTAGCAGCTTTCCttcccccccctgtttatttctgcttttgaattgcattatgggactttaatCTTTCTTACAACTTTTTTTAGCcttaaaaaggtaaaaaagtgacttacaaacatttttaatagtttaaagtgatgtattgtctgggttggtgttgtgtaTTATGGTACAAATAtcttcaaaaaatatattatttttacttatttctctctatatattattttgttaacattatattatttcacacTACTAAAACGTCAatatttgttagtttgttaaacTTGATGTTGAAAATTGAACTCTACAAAGACGACAGAGTAAAGATTACtttctcataatgcaattcacaaccgtaaataaaccgAAAACGtgtgaaacacaaaacaaagaaactgttaattatcaatgcactcactggccacattattaggtacagcttaatagtaccaggttggacccccttttgccttcagaacagtcttaataggcccaaagtgtggcaagaaaatatatattgcaccgccaccaccaccagcctgattaatagatacaaggcaggatggatccgtgcttttatgttgttgcttTTATGATGTTGTTGGAAATTGAGAATCCTCAGACCAGGCAtcgtttttccaattttctattgtccaattttggtgagccagtGCGAATTgcagcttcagtttcctgttcttagctgacaggagtggcacccggtgtggtcttctactgctgtagcccatctgcctcaatgttGGACGTGTTgagtgtttagagatgctcttctgcagacctcggttgtaacgagtggttattttgagttgcctttctatcagctggaaccagtctggccattctcttctgacctctggcatcaacaaggcatttgcgcccacagaactgccgctcactggatactttctctttttcggaccatgcATTAACGAACAGTTGGACATGTGCctaataaagtatttttacagtgtaggacagTATGTGAGTCGAATAGTATAACcaaatttatagtaaaaaaaaaaaaacgcaaatgaGGAGTTCCCGTATGATTTATTACTTCTGACGTGCGCATCCAATAAAGACTTTACTATCCATTGAGGCTGAGGGAGAAAATTTATTATCTcctattaatattcatatttatatttgttttattaaaacaagcttaaattgaaatatgtagactaatggatgtcttcagtggaacactgtttccttactccCGATAgggagaaagtgagagagaaagtaaagaggccgaatcgtggaggctcgttctttatcctcgcgctgcagatggtctgtttaattgttttctctctagtgaagtgttcagtttttccacttacaaagtctgccatgtaaatagcaaatgcgctatggcgtgaAGCAacagactcttaaagggaatgtgagaagAGACTTacattggtttattctcaaaacacctataactcactaagaaaataagcacaaccc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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00075212 True 6983 lncRNA 0.38 2 48869896 48877349

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037430 NA coding upstream 11493 48845578 ~ 48858403 (+)
XLOC_037429 spc25 coding upstream 34402 48819280 ~ 48835494 (+)
XLOC_037428 NA coding upstream 52777 48693432 ~ 48817119 (+)
XLOC_037427 BX927361.2 coding upstream 182011 48682775 ~ 48687885 (+)
XLOC_037426 lrp2a coding upstream 197642 48415043 ~ 48672254 (+)
XLOC_037432 stk39 coding downstream 66122 48943471 ~ 49052004 (+)
XLOC_037433 CSRNP3 coding downstream 781765 49659114 ~ 49745424 (+)
XLOC_037434 NA coding downstream 871987 49749336 ~ 49754453 (+)
XLOC_037435 CABZ01075129.1 coding downstream 907971 49785320 ~ 49785437 (+)
XLOC_037436 NA coding downstream 992103 49869452 ~ 49885824 (+)
XLOC_037425 NA non-coding upstream 488324 48380855 ~ 48381572 (+)
XLOC_037417 NA non-coding upstream 1546932 46854545 ~ 47322964 (+)
XLOC_037437 NA non-coding downstream 1022155 49899504 ~ 49903932 (+)
XLOC_037440 CU062479.1 non-coding downstream 1211651 50089000 ~ 50090257 (+)

Expression


Co-expression Network