G1821711



Basic Information


Item Value
gene id G1821711
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 1302815 ~ 1305489 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>TU2085117
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2085126 False 1488 lncRNA 0.46 3 1302815 1304390
TU2085128 False 1270 lncRNA 0.45 2 1302815 1304390
TU2085129 False 2424 lncRNA 0.42 3 1302815 1305489
TU2085130 False 2210 lncRNA 0.41 2 1302815 1305287
TU2085132 False 1533 lncRNA 0.47 2 1302815 1304390
TU2085135 True 2385 lncRNA 0.43 2 1302815 1305287

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110515109 LOC106611092 coding upstream 212018 1517507 ~ 1557129 (-)
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G1821681 NA non-coding downstream 72776 1229396 ~ 1230039 (-)
G1821595 NA non-coding downstream 183354 1119018 ~ 1119461 (-)
G1821594 NA non-coding downstream 184075 1117118 ~ 1118740 (-)
G1821593 NA non-coding downstream 185880 1116578 ~ 1116935 (-)
G1821714 NA non-coding upstream 4513 1310002 ~ 1310480 (-)
G1821715 NA non-coding upstream 5553 1311042 ~ 1311273 (-)
G1821716 NA non-coding upstream 7040 1312529 ~ 1312753 (-)
G1821717 NA non-coding upstream 8451 1313940 ~ 1314170 (-)
G1821719 NA non-coding upstream 13794 1319283 ~ 1319571 (-)
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Expression



Co-expression Network