G1825645 (LOC106593297)


Basic Information

Item Value
gene id G1825645
gene name LOC106593297
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 6926852 ~ 6943944 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2090589
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>TU2090601
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>TU2090603
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>TU2090596
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>TU2090599
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>TU2090600
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>TU2090602
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>TU2090605
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Function

NR:

description
ornithine aminotransferase, mitochondrial-like, partial

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2090589 False 366 TUCP 0.56 2 6926852 6927344
TU2090601 False 1734 lncRNA 0.37 2 6942176 6943944
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TU2090599 False 958 lncRNA 0.39 2 6942619 6943611
TU2090600 False 955 lncRNA 0.39 2 6942619 6943611
TU2090602 False 967 lncRNA 0.39 2 6942619 6943611
TU2090605 True 970 lncRNA 0.39 2 6942619 6943611
Loading

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110518105 LOC106592890 coding downstream 40987 6885354 ~ 6901189 (-)
LOC110510773 LOC106613841 coding downstream 128453 6746373 ~ 6813723 (-)
LOC110515214 bccip coding downstream 565641 6367021 ~ 6376535 (-)
LOC110514830 dock1 coding downstream 943030 5460328 ~ 5999146 (-)
LOC118943880 gpr26 coding upstream 453215 7397159 ~ 7409361 (-)
LOC110531557 fbx37 coding upstream 1030975 7974919 ~ 7979808 (-)
LOC110531799 LOC106577395 coding upstream 1137810 8081754 ~ 8089912 (-)
cj104 cj104 coding upstream 1155364 8099308 ~ 8104167 (-)
LOC110515025 LOC106577347 coding upstream 1339203 8276732 ~ 8289116 (-)
G1825683 NA non-coding downstream 32650 6909111 ~ 6909526 (-)
G1825650 NA non-coding downstream 42166 6899442 ~ 6900010 (-)
G1825653 NA non-coding downstream 45671 6895737 ~ 6896505 (-)
G1825679 NA non-coding downstream 49332 6891762 ~ 6892844 (-)
G1825676 NA non-coding downstream 53909 6886188 ~ 6888267 (-)
G1825651 NA non-coding upstream 1460 6945404 ~ 6945910 (-)
G1825690 NA non-coding upstream 3663 6947607 ~ 6947819 (-)
G1825694 NA non-coding upstream 22734 6966678 ~ 6966956 (-)
G1825698 NA non-coding upstream 46629 6990573 ~ 6991100 (-)
G1825654 NA non-coding upstream 55925 6999869 ~ 7000068 (-)
G1825645 LOC106593297 other downstream 14832 6926852 ~ 6943944 (-)
G1825658 NA other downstream 116358 6823168 ~ 6825818 (-)
G1825582 NA other downstream 282225 6658118 ~ 6659951 (-)
G1825493 LOC106593079 other downstream 588155 6352088 ~ 6354021 (-)
G1825145 NA other downstream 918214 6021536 ~ 6023962 (-)
G1826079 NA other upstream 640620 7584564 ~ 7584977 (-)
G1826369 NA other upstream 1015895 7959839 ~ 7960824 (-)
G1826594 NA other upstream 1199239 8143183 ~ 8147004 (-)
G1827228 NA other upstream 1898658 8842602 ~ 8948639 (-)
LOC110532987 LOC106596646 other upstream 1906989 8838876 ~ 8945963 (-)
LOC118943912 NA coding downstream 1421375 5503698 ~ 5505477 (-)

Expression

G1825645(LOC106593297) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 8.
End of interactive chart.

G1825645(LOC106593297) Expression in each Bioproject

Bar chart with 19 bars.
G1825645(LOC106593297) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 1000.
End of interactive chart.

Co-expression Network