XLOC_037551


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037551
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 1177901 ~ 1181454 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00075256
GACTCATTTTTATTGGTTTGATGTTGTGTATCTGTGTCATTTATTCAGACGAAGAGACTGTGATCGTGTGCAACAGTATTTTTGATAGCTATTAAAAAGAGTCAGTGGCCGTCGAAGGACTTCAAATCATGACCCTTATGCACACTTAGTCTGATCACGCTAGTCTAAATAATAGTTAAACAACGGATCTCAGTCATGAAAGCCCAGGAGAATTAAATTTTGTTTACTGCTACATCCACGAACCGGCTGCATCGAATGGAAGTTCATAAAACTGTGGTCGTTGAtgcactttaatttgtaaaacgAATAAATTGTGACTTTGAATTAGTTTAAAGGGGTTCTCTTATCCATGCACTTTGAAATGTTTATGCTTTATAATGCCTACCGATGTTGTAATCAAAGTAAAGCGATGTTCGCACAAAGAATGATCAATATAATAATTATAGCGGTAACTATATTTGGTCCTCACCAGCAGACCATAACGatctattttttcttgtttattctttttttttctattgatgtGCTTCATTTCTAGTGAAACTGACCAGTGAATCCCGCTCGTGTAATTGGTTTAATCAAACAGTGAATGTTGCGATCGCAGTCAGCAAATAGCTATACTTTTAATTTTATACATCAATTTACATAAATTGCGTAGCTTCCATGTCAATATTTTTATTCCCTTCCATGCTAttaaccttattctgcaatgcggaAGTGCACTCGTTTTTACGATTTACCTATGGGAGAAATAACTAGGAATATTAGAAGGCAGAAATGGTTGACGACTTGATGCCAATACATTAAGTGTGTatatgactatacataaaaatagaatataataataaaagttgaacatcaagcagcataacgagctgttttaaCGTCTAACAATCAATGGAAGTGAGGCAAAATAGATTCCGATGGCTGCGCCTGCTCATACGGGAAGAGTAAGGTTCACTAAACCAATTGTTTACTAGATGGTCATTGTCTTTAAATGATCTTTAAAAGATCTTTTAACATCAGACAAAGATGCTCCACGAAGTCGCAACCTGTAGCCCTTTATATTGCGATGGTTTCTGACtgtctatttttttaaaacaatatcttacggcaattcgtaactttttaatttaatgggtaattcgtctgaatttgtacaatctcattcatacaaattAGTACGATTTGTTCATCAGACCATAAcaatcaatttatttttgtttttttgttttattttttattttcattgatgTGCTTTGGTTCTAGTgaatctgaccagtgaatcccgCTCGTGTAAATGATCTAATTAAACAGTGAATGCTGCAATCGCAGTCAGTGCATAGCTATACTTAATACCTGAGGTACTTTTAATTTTATACATCAATTTGCATAAATTGCATAGCTTCCGTGTCAATATTGATAATTCCCTCCAGTGCTATTAACCTTATTTTGCAATGCGCAAGTgcgttttttttacaattgttttaaaaCTGCGTAACCTAAGGGAAAAATGACTAGTAATAATACGGCAGAAAATTGTCTAACGATTTACTTTACGAAGTGAAGTAGACTAGAAGCCGAATAGATTCCGATGGCTGCGCCTGCTCATACGTGAAGAATAATGTCAATAACCAATTGTTTATTAGATAgtcattatctttaaataatcttTGAAAAGATCATCAAATACAGATGCTCCACTAAGTCTGAGCCTTTTATATTTCAGTGTTTTCAGACTGAAAGTTTTTTGTAAACGCTATCTCATggtaattcataactttttttagtttagatgtcaatttgtatgatctcattcgtacaaattagtgcgatttgcttatcccccattgacggttgggtttagacgTGGGGTGCCACGCctacttttaaaaatcgtacaactgaactcgaattatataaataataataatacatttttataacatgcTTTTCTTAGACCCGAAGCGCttacaaaacagtaaaaaacaacaaagcacatTAAAACAGTAAGGAATACAGTAAACAACAAAATttgaacgaattagccactaaactagcaaaacgtaaaatagatATGTTGAGATTAAGCTGGATAAATGTGgaagtttgattaataaatgctacgCCAGTATTAGCTCATGTTAGTACATTAACTTATGGATGTTTTATCGATATCTtaacggcaattcgtaactttgatttactggcttattcgtatgaatttgtaggATCTCATTCGTACTAATTATtttgatttgcttatcccccattGACgattaggtttaggggtggggtttgtaaaatgtaaaatggttATGTTTCCTCGTGGGATCAGgccgtttttttctttttaccatGTATTAGCTGGGGAAAAAAATCGTTCTGAAAGTAATCCCAACATTATCGTTTTTCTGCATCGTTATCGTTATAATAGTGATCTGAACTCTGCTAGTTGATGTTTTTATCGTTAACTTTATAGTTATCGTACTTTGTGTAAACGTGTCTTAAATTGAGGTGCAAGCTAAAAAGgctctgccctcttttgaaaagggGGCGGAgaacagcagctcatttgcatttaaagagaaacCTTAAAAgcagtatatatttttacatcatccCAGTGGTGAACGtattctcaaaaataaataatcgtCAACATTAACAGAacactttcatttttttaataaataaaagacttTCTGCTGGGGTTTCGTGATTGAGATCTGGATCATGTCTACAGGCCATTACTTCAGGTTTTGAAGCATTCTCAATGAAGTGAAAGTCATTTTTGTGGTCATCACCTTTAAAGCTGCTGCACGTTCTCCTCTTCTCCTGATATTTCCGAACAGGAGCCGTCGTTGGTTACTTCTCCCACCGTTGTTCATCAGCTGAAATGTTGTGTGCGGTCCATGTTTTTTTTGTACTGTGTTACTACTGTGTGCTGTGTGAAGGCCAGGCAGTCCGCTGCACAGAGaaaagaaccccccccccccctgacaGAAGCGCTTGCACTGCGTTCAGATGGCTGACTGATTCCTGTACTCACTGAATGTACTGTAGAACTGTTTTTACAACTCATAGGATAATCTAGTCACCTTTTGTTATCGGTCTTTAATTTGTCTAAGGTATTTTTTTGTATacaaagtttacatttttatgtatatttttctcGTGTAAAAATATGATGTAATATGTGTATAAACATCGTATGTAATATCTGTATATAGAGTGAGAAattttgatcttgttttttttttttttttggatgtaaGAATTAAAATTGTGTGAATTTGCTCGCTCGCTGTGGGTTTAGTCACTGGTTTAGCCGATCCTGAAAACGTTCAGAGGTGAACTTTAGCACAGATTTATTGTAGCGTATCTCTTGCATAACAATCAGGGGCATCAGAAGAGCTGTAATCATAACCACTGCAGATAAAGCAAAACTGAATGAATCATCTAATGAGTTTCTGTAGAGTAATTTAACCATTCAAAGctctttaaaatgcttttattttaaaacactttcattgtgcATGTTATACAGGGTT

Function

GO:

id name namespace
GO:0090085 regulation of protein deubiquitination biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00075256 True 3554 lncRNA 0.35 1 1177901 1181454

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037550 NA coding downstream 149251 1027015 ~ 1028650 (-)
XLOC_037549 CABZ01066922.1 coding downstream 174346 1003441 ~ 1003555 (-)
XLOC_037548 sctr coding downstream 227897 925969 ~ 950004 (-)
XLOC_037547 C9H2orf76 coding downstream 273674 900392 ~ 904227 (-)
XLOC_037546 NA coding downstream 288334 880748 ~ 889567 (-)
XLOC_037552 ino80da coding upstream 6351 1187805 ~ 1200187 (-)
XLOC_037553 gpr1 coding upstream 54324 1235778 ~ 1236848 (-)
XLOC_037554 NA coding upstream 121483 1302937 ~ 1305423 (-)
XLOC_037555 FP102120.4 coding upstream 197922 1379376 ~ 1379490 (-)
XLOC_037556 osbpl6 coding upstream 210081 1391535 ~ 1459985 (-)
XLOC_037542 NA non-coding downstream 404245 772863 ~ 773656 (-)
XLOC_037541 NA non-coding downstream 419485 757593 ~ 758416 (-)
XLOC_037558 NA non-coding upstream 282315 1463769 ~ 1780381 (-)
XLOC_037561 CU104777.1 non-coding upstream 461151 1642605 ~ 1649744 (-)
XLOC_037563 CR848724.1 non-coding upstream 567465 1748919 ~ 1749036 (-)

Expression


Co-expression Network