G1827228


Basic Information

Item Value
gene id G1827228
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 8842602 ~ 8948639 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2092808
GCCTGATGTCCAAGTTCCTTTACCTTGAACTGTCCCTGGACGTTCCTCAGCTGTTTCTGGGCCTCAGCGGCCTGTCTGTTGGCGTGGCTCAGCTGGATCTCCATCTCATTCaggtctccctccatcttcttcttcaccCTCAGGGCGTCATTCCTGCTCCTGACCTCAGAGTCCAGGGTGCTCTGCATGGAGTCAACCACCCTCTGGCTGTTCCTCTTGATCTGCTCCATCTCCTCATCCTTCTCAGCGATCTTCCTGTCCACCTCttcttcaccCTCAGGGCGTCATTCCTGCTCCTGACCTCAGAGTCCAGGGTGCTCTGCATGGAGTCAACCACCCTCTGGCTGTTCCTCTTGATCTGCTCCATCTCCTCGTCCTTCTCAGCGATCTTCCTGTCCACCTCACCCTTGATCTGGTTCAGCTCCATCTCATTCaggtctccctccatcttcttcttcaccCTCAGGGCATCATTCCTGCTCCTGACCTCAGAGTCCAGGGTGCTCTGCATGGAGTCAACCACCCTCTGGCTGTTCCTCTTGATCTGCTTCATCTCCTCGTCCTTCTCAGCGATCTTCCTGTCCACCTCACCCTTGATCTGGTTCAGCTCCAGCTGCACACGCAGAATCTTGGATTCCTCGTGTTCCCTCAGCCTCCTCCAGAGCGGTCTGGATCTCAGACTTCTCTGTCTCCACGGTCTTCTTGGCCTTCTCCAGCTCATGGATGCTCTTGCCAGTCTCTCCGATCTGCTCAGTCAGGT
>TU2092809
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>TU2092817
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>TU2092810
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>TU2092802
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG:

id description

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2092808 False 760 TUCP 0.56 4 8842602 8947132
TU2092809 False 679 TUCP 0.57 4 8842602 8947132
TU2092801 False 622 TUCP 0.57 4 8843615 8948639
TU2092803 False 429 TUCP 0.56 3 8843615 8947132
TU2092804 False 647 TUCP 0.56 3 8843615 8947132
TU2092811 False 516 TUCP 0.56 3 8843615 8947132
TU2092812 False 557 TUCP 0.56 3 8843615 8947132
TU2092817 False 477 TUCP 0.57 3 8843615 8947132
TU2092819 False 448 lncRNA 0.56 3 8843615 8947132
TU2092820 False 423 TUCP 0.56 4 8843615 8947132
TU2092810 False 279 lncRNA 0.59 2 8844802 8895932
TU2092802 True 390 lncRNA 0.52 2 8895588 8948639

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118943825 polr3a coding downstream 30502 8736063 ~ 8813113 (-)
star2 LOC106577426 coding downstream 166597 8665409 ~ 8677018 (-)
LOC110515815 LOC106594691 coding downstream 523877 8315622 ~ 8319738 (-)
LOC118936473 LOC106594692 coding downstream 529240 8303445 ~ 8314375 (-)
LOC118943919 LOC106560865 coding downstream 540200 8290470 ~ 8303415 (-)
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jakmip3 LOC106577179 coding upstream 100561 9049200 ~ 9133856 (-)
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LOC110531428 glrx3 coding upstream 933404 9882043 ~ 9914708 (-)
G1827224 NA non-coding downstream 26558 8816684 ~ 8817057 (-)
G1827219 NA non-coding downstream 35887 8807447 ~ 8807728 (-)
G1827215 NA non-coding downstream 56105 8786753 ~ 8787510 (-)
G1827210 NA non-coding downstream 81958 8759927 ~ 8761657 (-)
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G1826369 NA other downstream 882791 7959839 ~ 7960824 (-)
G1826079 NA other downstream 1258638 7584564 ~ 7584977 (-)
G1825645 LOC106593297 other downstream 1916271 6926852 ~ 6943944 (-)
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G1827690 NA other upstream 595744 9544383 ~ 9544973 (-)

Expression


Co-expression Network