G1838521


Basic Information

Item Value
gene id G1838521
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 18618299 ~ 18619145 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2105280
tgatgatgatgatgatgatgttgttattagtgcatgatgatgatgctgttatTAGTGCTTGATGATGATTATGCTTATATTTgtgcatgatgatgatggtgttattagtgcatgatgatgatgctgttattattgcatgatgatgatgatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgctgctgctgttattaatgcatgatgatgatgatgatgatgatgatgttgttattagtgcatgatgatgatgctgttatTTGTGCTTGATGATGATTATGCTTATATTTgtgcatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgatgctgttatTAGTGCTTGATGATGATTATGCTTATATTTGTGCATGATGATGATTATGCTGTTATTAgtgcatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgatgatgatgttattAGTGCATGATAATGCTGTTATTAGTGCATGATGATGATGTTATTAGTGCATGCTGATGATGATGCTGTTATTagtgcatgatgatgatgCTGTTATTAgtgcatgatgatgatgctgttattagtgcatgatgatgatgatgatgatgattatgttattagtgcatgatgatgatttttatttaatttaattatttttttcacctttatttaaccaggtatgtagtgtgtaggtggcagggaagtcaggcgcaggag

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2105280 True 789 lncRNA 0.34 2 18618299 18619145

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110502386 opn4m1a1 coding downstream 16769 18527366 ~ 18601530 (-)
LOC110503086 LOC106606152 coding downstream 115336 18434552 ~ 18502963 (-)
LOC110502384 LOC106606127 coding downstream 184159 18373928 ~ 18434140 (-)
LOC110502380 syu coding downstream 290970 18310906 ~ 18327329 (-)
LOC110502378 NA coding downstream 362449 18242698 ~ 18255850 (-)
LOC110502387 LOC106606172 coding upstream 5164 18624309 ~ 18738296 (-)
myoz1a LOC106606220 coding upstream 121151 18740296 ~ 18760542 (-)
LOC110502390 LOC106606232 coding upstream 158613 18777758 ~ 18787759 (-)
LOC110502393 LOC106606239 coding upstream 204439 18823584 ~ 18828968 (-)
LOC110502394 LOC106606249 coding upstream 230244 18849389 ~ 18854222 (-)
G1838416 NA non-coding downstream 134510 18466496 ~ 18483789 (-)
G1838322 NA non-coding downstream 400888 18213772 ~ 18217411 (-)
G1838299 LOC106606050 non-coding downstream 428376 18189566 ~ 18189923 (-)
G1838628 NA non-coding upstream 184932 18804077 ~ 18805565 (-)
G1838709 NA non-coding upstream 322142 18941287 ~ 18941544 (-)
G1838711 LOC100380853 non-coding upstream 323136 18942281 ~ 18943024 (-)
G1838716 NA non-coding upstream 327598 18946743 ~ 18946960 (-)
G1838720 NA non-coding upstream 329608 18948753 ~ 18948980 (-)
LOC110502361 LOC106605890 other downstream 887787 17725263 ~ 17781515 (-)
G1837980 NA other downstream 899095 17709772 ~ 17719204 (-)
LOC110502353 LOC106605805 other downstream 1192979 17420323 ~ 17425430 (-)
G1835092 NA other downstream 2870564 15745638 ~ 15747735 (-)
tmem254 cj057 other downstream 2947119 15666203 ~ 15671223 (-)
si:dkey-51a16.9 LOC106576688 other upstream 492897 19111958 ~ 19145332 (-)
LOC110502408 LOC106606370 other upstream 666251 19261070 ~ 19385465 (-)
G1841694 NA other upstream 2324162 20943307 ~ 20943615 (-)
G1841959 NA other upstream 2726369 21345514 ~ 21371799 (-)

Expression


Co-expression Network