XLOC_037801


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037801
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 22618456 ~ 22626761 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00075343
CACAGAGCTTCAGTCTCTCAGTTTATTCAATAAAACTCTTGTGTCCATTAACATGGCAGCCAACAGCTTACAAGAAACAGAGTAACAGAGTCTAAGTGGGTCTTTCAAGGGCAAAAGAAATCACCCTTTAACCCCATCTCAGTCAGCAGGACTCCTGTCCTTGAACCTTGTTGCCTACCACACATATGGACTGCTACAAACCACACTAACCCTAAGGCAGGAATAAGACAGTGAGTTAACGCACATGTAGAACATCACATTCAGGGTTGATATGGGCTCTACTGCATCAGTGCCACTCAATACTGTTCATCTGTCCCAGCTAAGAATAGAGCTACACTGAGATAAGCCATACGGTCTCTAAGAGACACGTAGGATGAGCAGAGAGAGAAAGCATCTGTTTGTGTCTCAAAGTTAAAGGGCATAGTGATGCCAACACCATAAGTTTACATCAAATTTGAGTCCTGGATTCTGGTTTACTGTTCTTCAAAACCTTTTTTGATTTGGTCTCAAGATTCCAGGGTTGAGCAAAATTCAGAACTGAAGACTTGACTATATTAAGTTAGAATCTTCTTCATGGATTTGTATTGTAATGAATGCAGTATTATAAATATAACGATATCGATATAAATATCAACAAGaggaaaaatctatttatttttgacCTTTACACCTTTAAACAGAATAGAGCAAAATAGAATGAATCCATCCATACACCTGCTTTCATTCAATTTATGAGCtgaaaaagaacaaaacagaattcatccattcattcgttCTTGTTAAAGTCCTGACTAACGAACAGAATATAATTTATCCCCCtacttattttttaagttattatGAGTAACAGAATCTGGGCTTGATATTACACCCGCCGAATTGCCAAATGCAGGAAGATTTCACCTGTGGTGTGTTATAGACACCCCCAGTAGCTACTTTGGCTGatggaaaataatgtttaaattgccAGTGCTGCTTTGTCACTAAAGATTAGAATTTTAGTTTAAGACCATTTGTCAGTATgagtgcaaatgtgatcttagattTAAGAAGCAGCCCGACTGATAAGTGTTCACATGAGCAAAAAAAgacaggtgaataccgaatgagaagATGATTAGGCGAACGGTGAGACACAGGCAATCCTCGCTCACTGAGGCAGTGTCGTTATATTTTGCCtgtttgacacattatttaaaatttgtggcatggaaataattagtttgatgtggccagagaaaaaaaatggttaaTCCTTAGGGTTGAGCCTTGAaaattcatgtgaaataaaactaatcgCAATGTGACCCCACAACCCATTTGcacatgctcattgagcaaggtcacgacacacacaaaaaaagtagattaatgaggaggcatgtggacataacacaaaatttaaatcaagtaattttagcgaGCCAAAGTTAAATTTAtgcatacaaaatatattttcctaatGATAAAATTGTTGCTTgtaaaaatggtgagtggctagtaacattggaaaaataCTAGCCACAATGGTTGGTtatcaaaaaagttaatatcaagcCCataatagaatagaatagagaaTAGAATAGTTTCAGTTCATCCTGCTTTCATTCAGTTTATGAGCTGAAACAGAACAGaattcatccatccaatcatttgctccttttaAAGTCATGAGTTAATAGAACAGGATAGAATTCATCCTTCCGTCCATCTGTTATCTTTTAAGTATTGACTTAGTAGAGCAGAATATAATTGACCAACCTACTCCATTTTAAGTTATgattaatagaatagaatataatcAGTCCATCAAATACTTTCCAACTCATAAGTCAGAATATAATATCATACAATAGacacacagtggctcagtggttagcactgtcgcctcacagcaagaacgtcagtCTTTCGAGCccagactgggtcagttggcatttctctgtggagtttgcatgttctccccatgttcctgCAGGTTTCCACTGGGCGCTCAGTCCTAAGACATGTGCTacacagtaggtgaattgggtaagctaaattgtcagtagtgtgtgtgtgtgaatgtgaaagtgtgtggttgtttcccagtactgggttgcagctggaagggcatccactgtgtaaaacatatgctggatactttggcggttcgttccgctgcattttgaccccttatgaataaagggactaaagcgaaggaaaatgaacgaatagaGAAGGTCTCCATCCATTCACTCGTGTTCAACCCATGAGCTGGCACTGAACAGAATGTTTCTCCATTTAACTTGACTTCTGATCACGTCAAACAGAATGACAGCAAAAGGAATGCACCGAATAATGACAGCTCAGCACAAATACTAAGTGCAATTCAGAATCTAGTTTGCTACCTTAAATTAATTTCtactaatacaaataaatgtaaggGCATTGTCAGTTCAATTCTGAATAGAGCACAACCCTGCAAGAGGCAGCACGGTTTTGACAGATAAAATCCGATCATTATAGTGAGAAAAGAGACATTGATGGGCAGATTGAGCAATCACAGTTTTCGAACAGCTaaaaataacagataaaagtCAGCCAGTCCAAAAACGAAGACATATGTGGTGTCAGAGACATTATGGAGCTCATTTGTGAGGTGCAGGTCTTTGCTCTGCCACCTCTCCTCACTCTGAAAGCTGAGAGCAAGTAGGCCAGTGTGATGACACAACAAAAATGAGTTATTGCAACACAGCAAAACAGATGTTAACCTCTCATTTTGTTCGGTGGATTATTTTCAGTGACATGTATTGCAAAAGTCTTTGCTCCAGGCAAAACGCTATTTTGTATTGGTAAGTTAAGGCTATCAGTTATTCACAGAAATGACACAGAAGGACCATTTAGAAATGACATTTCCCCGTAGGTGACATTCCTCAGTTTGATCAGCATCAAAACCTCCgtctacaaaatacaaaacagaacATCCACAATGAACATGCTACTAAATGGTCAAGGAAAAGTACAGTGGATAGATATAGATACGAGGGGCTTGGAAAGAGTCCCAAAAATATAATCATGTGAAACTAATGAGGTTGCAACAATCAGCGTGGTCTCTCTCTCTTCAGGCAGGCGTCTTTGTCTTCTTTGTTTCAACAGGCATGCGGTGGTTAAACTTTAgagaaaatataaacaatatcTATATATACATGACTGTTTAAAATCATTCTAAACTGTAAAATGAAAAGTAGATTTGTAAACATGCACTCGTAACCAAACCGCCAGACCGTCACGCAGGATAAACCATCTGTCCAACGACCACAGAAACAATGGGGCTCTATTAGCCAAATCCACCAGTAACTTCTATGATAAACGGAGCGACTGGAGGTGAACGTTTGTTCTGTGGTCATGTGGAGagattagcattatttttttcttcaggacaCTGGCGTAGCTTCTGCGGTTCTTTAAAGGGAACATTAACCTGCCGACCCCGTTAAGAGCTCGGTTTCTAAAGCCCAAACCTGAACTTTAAAACATTCTGCATTGGTGAAATTATATACAGTTCCAACACAGACCTTTGCACACTGAGAAAGCATCTGATGATCACTGCATGTTGATCTATATCAGGCACATCTGCCTGATGGCTACAGTCAATCATGTGATCCATTAGGTATCACTTCTAATCTCTGATACTATATTAAGTTACACCTTTAaacacattcatatatatatgcacacaaggCTCTTGGATTATACAAATACTGATACATGGTGGGCATCTTTAAGTTAAATATTCTTCATGAGTCCTCTCAGAAGGGCTAGAAAAACGAAGGGCCTCCCGTTCTATGCATTCATCTGTGCCGCATTCACACCAGTTTGACCGTCGACCTGAAATTGCGAGCTGATGTTTTCATGCTGCAATTAGGAATAGTGTTTCACTCCCTGAAATAGGACGTTAAATTTAGGCTCTGTCCATGCAGCAGTAAATCAAACCCCACTGCAGTAGCTTGTTGTGACAGTTGAGGACCAGAGGATTCAGTGTTAATGCCAGTGCTGGATCAAGTTCAGCCTGTCTCTGAATGGAGATGCTGTAAAGCTACAGAGGAAAGACTTTCCGTTTTCTCAGAAATATGTGGCACGATTATTCAAGTACAGTTTGTTGACATTAGTCAATGCATTTGCATTCATAAATTAACGAcgttttacagcatttattaatccagGTCAATCATGTTAAAGTCTACATATATTTACAGACTTTGGAATGTATAATTGgacattataaattataaaatatttcgaATACACATAAACAAACAGTAAACAATGGTATTGAAACAATGGTATTGGCTTAAATCATGTAGTTAAGTTTATAAATTACATAAACATACATTAATAAAtggtgtatatatctatatatattttccaaattgatcatcttgatacattttaatGTTAACAAATCAATAATTGCCATAGACTTTTATCATTATCTCTAaatttgttaataatttaattaatacttcaaaaaaacagataaaatttaAACCAGATAAAATCTTTCTTTAAACAGCCTTGGTTTGCTGATCTTAGCTTGATTAAAGCCTGTTCACAACAAGCTGAATGTTTAGTGAGAAAATTTAGTGTGATAATCATTTGAAAAACTGGCCATTCTGGCTCCCGTTCTGTTGCAGCTGCGTTTACACACAACTTTTACACACAACAGGCGTTGTAACCACCAGGTTGATCTTTTGTCCATTGGTTATCACAATTTTCCAATTGCTTAGAATAATGTCAGGAACAAAACTTAATCAAAGACATGAGCACATTTTGATACAGTGCACCTTGAAGTTAATGCAGTTTTGCAAGCAAACAAAACGAGTGGTAAAAAGACGACAAGTCGTCTGTGTTGTCTCTTTATGCCAGATTTTAAGCAAAAATCTGCAATGTAAAGAAAACAGCTGAGCAAACTAGCCTGTTCAGTCTGAAACTACATGTATGGATAACTTTCTATA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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00075343 True 8103 lncRNA 0.38 2 22618456 22626761

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037800 crygm3 coding downstream 256775 22354281 ~ 22361681 (-)
XLOC_037799 crygm2f coding downstream 266176 22344595 ~ 22352280 (-)
XLOC_037798 crygm2d1 coding downstream 278874 22338578 ~ 22339582 (-)
XLOC_037797 crygm2d2 coding downstream 299945 22317479 ~ 22318511 (-)
XLOC_037796 crygm2d10 coding downstream 307537 22309838 ~ 22310919 (-)
XLOC_037802 neb coding upstream 178377 22805138 ~ 22892838 (-)
XLOC_037803 arl5a coding upstream 276104 22902865 ~ 22918413 (-)
XLOC_037804 si:dkey-91i10.2 coding upstream 314201 22940962 ~ 22963897 (-)
XLOC_037805 rnd3b coding upstream 399563 23026324 ~ 23033818 (-)
XLOC_037806 lypd6 coding upstream 444388 23071149 ~ 23118350 (-)
XLOC_037770 NA non-coding downstream 800719 21816200 ~ 21817737 (-)
XLOC_037767 CR392366.1 non-coding downstream 1185795 21432545 ~ 21432661 (-)
XLOC_037761 NA non-coding downstream 1412902 21194606 ~ 21205554 (-)
XLOC_037757 NA non-coding downstream 1813335 20802497 ~ 20805121 (-)
XLOC_037756 NA non-coding downstream 1831803 20784043 ~ 20786653 (-)
XLOC_037813 CR392363.2 non-coding upstream 756653 23383414 ~ 23388075 (-)
XLOC_037814 NA non-coding upstream 1064497 23691258 ~ 23694572 (-)
XLOC_037815 NA non-coding upstream 1070303 23697064 ~ 23700635 (-)
XLOC_037823 NA non-coding upstream 1281322 23908083 ~ 23909865 (-)
XLOC_037824 CR545476.2 non-coding upstream 1285130 23911891 ~ 23912005 (-)

Expression


Co-expression Network