G1880528


Basic Information

Item Value
gene id G1880528
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 53839525 ~ 53840896 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2151208
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>TU2151209
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>TU2151210
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>TU2151211
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>TU2151212
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>TU2151216
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>TU2151217
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2151208 False 1019 lncRNA 0.41 3 53839525 53840676
TU2151209 False 883 lncRNA 0.40 2 53839525 53840676
TU2151210 False 1103 lncRNA 0.39 2 53839525 53840896
TU2151211 False 1019 lncRNA 0.41 2 53839525 53840676
TU2151212 False 951 lncRNA 0.41 3 53839525 53840676
TU2151216 False 951 lncRNA 0.41 2 53839525 53840676
TU2151217 True 1084 lncRNA 0.41 2 53839525 53840676

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
pdcd2 pdcd2 coding downstream 55443 53779267 ~ 53784082 (-)
LOC110502966 phf10 coding downstream 104905 53716988 ~ 53734620 (-)
LOC110502964 LOC106610676 coding downstream 268044 53565101 ~ 53571481 (-)
LOC110502963 LOC106610657 coding downstream 277491 53517983 ~ 53562034 (-)
LOC110502962 LOC106610650 coding downstream 324933 53506093 ~ 53514592 (-)
ccsapb LOC106610728 coding upstream 7731 53848627 ~ 53851652 (-)
LOC100135949 actc1 coding upstream 11023 53851919 ~ 53855036 (-)
LOC110502973 abcb10 coding upstream 17823 53858719 ~ 53864562 (-)
LOC110503036 LOC106610742 coding upstream 198122 54039018 ~ 54073953 (-)
LOC110503071 NA coding upstream 372361 54213257 ~ 54217097 (-)
G1880514 NA non-coding downstream 25099 53814206 ~ 53814426 (-)
G1880506 NA non-coding downstream 34678 53802248 ~ 53804847 (-)
G1880501 NA non-coding downstream 43669 53795570 ~ 53795856 (-)
G1880500 NA non-coding downstream 44093 53795220 ~ 53795432 (-)
G1880499 NA non-coding downstream 45372 53793588 ~ 53794153 (-)
G1880536 NA non-coding upstream 3395 53844291 ~ 53845770 (-)
G1880538 NA non-coding upstream 5052 53845948 ~ 53846930 (-)
G1880549 NA non-coding upstream 39509 53880405 ~ 53880688 (-)
G1880556 NA non-coding upstream 47943 53888839 ~ 53889186 (-)
G1880557 NA non-coding upstream 50462 53891358 ~ 53891626 (-)
G1879406 NA other downstream 675174 53163242 ~ 53164351 (-)
G1878770 NA other downstream 1196016 52643088 ~ 52643509 (-)
LOC110502957 LOC106610540 other downstream 1523747 52271405 ~ 52315778 (-)
G1878324 NA other downstream 1631898 52207428 ~ 52207627 (-)
G1878101 NA other downstream 1801775 52036596 ~ 52037750 (-)
G1880780 NA other upstream 403886 54244782 ~ 54246686 (-)
G1881414 NA other upstream 1161870 55002766 ~ 55003624 (-)
G1883219 NA other upstream 2765110 56606006 ~ 56610640 (-)
G1883244 NA other upstream 2803111 56644007 ~ 56709888 (-)

Expression


Co-expression Network