G1886178


Basic Information

Item Value
gene id G1886178
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048587.1
NCBI id CM023241.2
chromosome length 62880378
location 59354623 ~ 59357296 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2157596
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>TU2157613
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU2157597 False 2336 lncRNA 0.44 2 59354623 59356984
TU2157601 False 2160 lncRNA 0.43 3 59354623 59356984
TU2157603 False 2250 lncRNA 0.43 4 59354623 59356984
TU2157604 False 2299 lncRNA 0.44 3 59354623 59356984
TU2157605 False 1371 lncRNA 0.42 3 59354623 59357296
TU2157606 False 2233 lncRNA 0.43 3 59354623 59356984
TU2157609 False 2283 lncRNA 0.44 3 59354623 59356984
TU2157610 False 2289 lncRNA 0.44 3 59354623 59356984
TU2157613 True 2197 lncRNA 0.43 4 59354623 59356984

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC118943835 NA coding upstream 488692 58864615 ~ 58865931 (+)
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LOC110503012 LOC106611138 coding upstream 1814255 57499694 ~ 57540368 (+)
LOC118943836 NA coding downstream 223803 59581099 ~ 59581875 (+)
LOC110503016 LOC106611257 coding downstream 346098 59703394 ~ 59816421 (+)
LOC110503015 LOC106589751 coding downstream 489815 59847111 ~ 59866775 (+)
LOC110503042 kcnk1 coding downstream 604919 59962215 ~ 59972534 (+)
slc35f3b slc35f3 coding downstream 655409 60012705 ~ 60174129 (+)
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G1886557 NA other downstream 366968 59724264 ~ 59736661 (+)
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G1886561 NA other downstream 426690 59783986 ~ 59787989 (+)

Expression

G1886178 Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 30.
End of interactive chart.

G1886178 Expression in each Bioproject

Bar chart with 20 bars.
G1886178 Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 200.
End of interactive chart.

Co-expression Network