XLOC_037898 (BX322575.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037898
gene name BX322575.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 30104920 ~ 30107960 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00074401
ATTACCGAGCCCCATTCAAGCACTGCAGCAGAGAGCGTTGTCATGGAAACGGAGCAACGACACGACACCTGACCGTCAACAGCACTTCTCTCATGCGGCAGTTTTCACtaatttcagAAGTGACAAAATTACCCCTACAACAGAAGAGAAGAGCCAAGATGAAGGGAGCTAATCACTGAGCTGGAGGAAACACAGATTTTGGATCGTCCTCCACTCACTCTACCACTTTGTTTTTCCTTGCCAGACTTCATTCAAGGATAAGAAAGAAGCCTGCTACAAGAGAAACAGCGGAAGGGAGCCTCCAAGACATTTTTATTAGGATCTGCTAATCATGAGGGGGCAGACAAAAGAACctgcattttccttcagcttaatatcaggggtcgccacagcgtaaggAACTGGATAttactttggcatatgttttacacagcggatggccttccagctgcaacccagcacagtgaaacacccatacactctcgtatTCACAGACACTTCTACACTATATTcaaatttacctatagcacaagtgtttggactgtggtggaaacccacaccaaaacagggagaacatgcaaactccacacagaaacgccagcagacccaaccgggactcataccagcaacctttttgctgtgaggtgacagtctgAGCCACTGGGCTGCCCCAGTGTAGTTATTAATAACCTGCAGATGTTTTACTGTttgattttgtaataataatgcacatttagatttattgtaatatgtattttaaaatttattcacaatgtaatttatttttatgttatttataataacGTTAAATGTCATAAGAaagttataatttaatataatattataataaataattataataatgttaaaatataaataatacaaatttatttataatgtttttaagtttatttttttaatgagaagTCTCAAAGTCTTCAAAGTTGTCTTTATTATAGAAAACTCATTGTTGAATGGCtaccactttacaataaggttgtatgtattagttaatgtatttactaacatattaaacaatacatttattacagtattcatCTTTGCTAATGTTGGTAAATGGTAAaagttgttaattgtttattcatgttaactcgcaatgtattaactaatgttaacaagcatgactgcttttattaatgcattagtaaatgctgtacatAAATTATGCTGTACAGGTATTGTTCATATTAGTTCATATTTAAACCATTAACATTACTTATAACATTACttataaaactactgtaaaatgtaactgttgtatgtatgttgttatattatatttgtatgtattttatatgtatttatttattttgttatatttgttaacGTATGTGATTTCGAAACATTTGATTATAATCtaagtgtttaatgtatgttcgttatgcagtattataaataaatgttataatgatTAAGTATTTTGTACTTGATTTCATTATTGGACATATTTATATCGAATACAATTGTAAAGGCtaatataatattcaaaaatGACATGTGGACCGACCGTGGGCCGCCAGCGGACACTTATTTAAAACCAGCGGTCCGATGGCGGACCACCGTCGGAAAAGCGGCGGCAGC
>TCONS_00074402
AAACGGAGCAACGACACGACACCTGACCGTCAACAGCACTTCTCTCATGCGGCAGTTTTCACtaatttcagtgctCTGTGGTTTCAGAAGTGACAAAATTACCCCTACAACAGAAGAGAAGAGCCAAGATGAAGGGAGCTAATCACTGAGCTGGAGGAAACACAGATTTTGGATCGTCCTCCACTCACTCTACCACTTTGTTTTTCCTTGCCAGACTTCATTCAAGGATAAGAAAGAAGCCTGCTACAAGAGAAACAGCGGAAGGGAGCCTCCAAGACATTTTTATTAGGATCTGCTAATCATGAGGGGGCAGACAAAAGAACctgcattttccttcagcttaatatcaggggtcgccacagcgtaaggAACTGGATAttactttggcatatgttttacacagcggatggccttccagctgcaacccagcacagtgaaacacccatacactctcgtatTCACAGACACTTCTACACTATATTcaaatttacctatagcacaagtgtttggactgtggtggaaacccacaccaaaacagggagaacatgcaaactccacacagaaacgccagcagacccaaccgggactcataccagcaacctttttgctgtgaggtgacagtctgAGCCACTGGGCTGCCCCAGTGTAGTTATTAATAACCTGCAGATGTTTTACTGTttgattttgtaataataatgcacatttagatttattgtaatatgtattttaaaatttattcacaatgtaatttatttttatgttatttataataacGTTAAATGTCATAAGAaagttataatttaatataatattataataaataattataataatgttaaaatataaataatacaaatttatttataatgtttttaagtttatttttttaatgagaagTCTCAAAGTCTTCAAAGTTGTCTTTATTATAGAAAACTCATTGTTGAATGGCtaccactttacaataaggttgtatgtattagttaatgtatttactaacatattaaacaatacatttattacagtattcatCTTTGCTAATGTTGGTAAATG
>TCONS_00074403
GCAGAGAGCGTTGTCATGGAAACGGAGCAACGACACGACACCTGACCGTCAACAGCACTTCTCTCATGCGGCAGTTTTCACtaatttcagAAGTGACAAAATTACCCCTACAACAGAAGAGAAGAGCCAAGATGAAGGGAGCTAATCACTGAGCTGGAGGAAACACAGATTTTGGATCGTCCTCCACTCACTCTACCACTTTGTTTTTCCTTGCCAGACTTCATTCAAGAAGCCTGCTACAAGAGAAACAGCGGAAGGGAGCCTCCAAGACATTTTTATTAGGATCTGCTAATCATGAGGGGGCAGACAAAAGAACctgcattttccttcagcttaatatcaggggtcgccacagcgtaaggAACTGGATAttactttggcatatgttttacacagcggatggccttccagctgc

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095595

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00074401 False 1602 processed_transcript 0.34 4 30104920 30107960
TCONS_00074402 False 1050 processed_transcript 0.36 4 30105442 30107914
TCONS_00074403 True 415 processed_transcript 0.47 4 30106070 30107933

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037897 dcbld2 coding downstream 50742 30013667 ~ 30054178 (-)
XLOC_037895 il1rapl1a coding downstream 119530 29716380 ~ 29985390 (-)
XLOC_037896 CR749776.1 coding downstream 296856 29807947 ~ 29808064 (-)
XLOC_037894 NA coding downstream 397663 29682197 ~ 29707257 (-)
XLOC_037893 NA coding downstream 442295 29652041 ~ 29662625 (-)
XLOC_037899 abi3bpa coding upstream 24538 30132498 ~ 30165621 (-)
XLOC_037900 impg2a coding upstream 80804 30188764 ~ 30190513 (-)
XLOC_037901 SENP7 coding upstream 109868 30217828 ~ 30248034 (-)
XLOC_037902 si:dkey-100n23.5 coding upstream 140611 30248571 ~ 30259512 (-)
XLOC_037903 mid1ip1a coding upstream 155228 30263188 ~ 30264415 (-)
XLOC_037889 NA non-coding downstream 594945 29506420 ~ 29509975 (-)
XLOC_037885 NA non-coding downstream 1011561 29075291 ~ 29093359 (-)
XLOC_037905 BX571713.1 non-coding upstream 188715 30296675 ~ 30296791 (-)
XLOC_037910 NA non-coding upstream 350744 30458704 ~ 30474478 (-)
XLOC_037911 NA non-coding upstream 382545 30490505 ~ 30503378 (-)
XLOC_037912 NA non-coding upstream 409957 30517917 ~ 30525279 (-)
XLOC_037915 BX571809.1 non-coding upstream 569510 30677470 ~ 30680018 (-)

Expression


Co-expression Network