pgm2l1 (pgm2l1)


Basic Information

Item Value
gene id pgm2l1
gene name pgm2l1
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 282138 ~ 307799 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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Function

symbol description
pgm2l1 Predicted to enable intramolecular transferase activity, phosphotransferases and metal ion binding activity. Predicted to act upstream of or within glucose metabolic process. Orthologous to human PGM2L1 (phosphoglucomutase 2 like 1).

NR:

description
glucose 1,6-bisphosphate synthase-like isoform X1

GO:

id name namespace
GO:0016052 carbohydrate catabolic process biological_process
GO:0005829 cytosol cellular_component
GO:0004614 phosphoglucomutase activity molecular_function

KEGG:

id description
K11809 PGM2L1; glucose-1,6-bisphosphate synthase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021581861.1 False 3684 mRNA 0.42 14 282138 307799
XM_036961586.1 False 4036 mRNA 0.41 13 282151 307799
XM_021581860.2 False 4203 mRNA 0.42 14 282152 307799
XM_036961587.1 True 3867 mRNA 0.42 14 282152 307799

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110503488 LOC106580673 coding upstream 427 281041 ~ 281711 (+)
LOC110503517 LOC106612445 coding downstream 6591 314390 ~ 331175 (+)
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taf15 LOC106612447 coding downstream 83242 391041 ~ 406349 (+)
LOC110503519 LOC104924156 coding downstream 124646 432445 ~ 460397 (+)
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G1889354 NA non-coding upstream 11083 270847 ~ 271055 (+)
G1889336 NA non-coding upstream 26633 254758 ~ 255505 (+)
G1889301 spcs2 non-coding upstream 28773 194375 ~ 253365 (+)
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G1889383 NA non-coding downstream 81911 389710 ~ 389932 (+)
G1889438 LOC106580682 non-coding downstream 244508 552307 ~ 568281 (+)
G1889475 NA non-coding downstream 249336 557135 ~ 559580 (+)
G1890009 NA non-coding downstream 520196 827995 ~ 828200 (+)
G1890160 sik2 non-coding downstream 812820 1120619 ~ 1124351 (+)
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G1892702 NA other downstream 2962397 3270196 ~ 3302590 (+)

Expression

pgm2l1(pgm2l1) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 10.
End of interactive chart.

pgm2l1(pgm2l1) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
pgm2l1(pgm2l1) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

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