XLOC_037912



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_037912
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 30517917 ~ 30525279 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00074987
atcatgtgtgcatatgtatggagtatatCATGTATGGTGTATTGTGTCCATATGTGTCTATATGTATAATGTACAGAATGTGTATCATGTGCGTATATGTATAGTATGTTAGGATTCATCAacttatatgtatatgtatagaatatatTGTGTGCATATGGAGTAGGGTGTATggagtatatatatatttataaagtgTATCCTCTCTGTgtgaatgtatcatgtgtattatgtctgcatatgtatggggtgtatatgtatggagtgtattgtgtgtgtatgtatagaacatatcatgtgtgcatatttatggAGTATACGTatggtgtatcatgtgtgcatatgtatagaatgtatcgtg

Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00074987 True 361 lncRNA 0.32 2 30517917 30525279

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_037911 NA coding downstream 14539 30490505 ~ 30503378 (-)
XLOC_037910 NA coding downstream 43439 30458704 ~ 30474478 (-)
XLOC_037909 gja8a coding downstream 85139 30430188 ~ 30432778 (-)
XLOC_037908 piga coding downstream 132639 30374181 ~ 30385278 (-)
XLOC_037907 asb11 coding downstream 146670 30364667 ~ 30371247 (-)
XLOC_037913 chaf1b coding upstream 17860 30543139 ~ 30555725 (-)
XLOC_037914 morc3a coding upstream 33229 30558508 ~ 30576522 (-)
XLOC_037915 BX571809.1 coding upstream 152191 30677470 ~ 30680018 (-)
XLOC_037916 BX571809.2 coding upstream 182560 30707839 ~ 30707954 (-)
XLOC_037917 klf5b coding upstream 275597 30800876 ~ 30808073 (-)
XLOC_037905 BX571713.1 non-coding downstream 221126 30296675 ~ 30296791 (-)
XLOC_037898 BX322575.1 non-coding downstream 409957 30104920 ~ 30107960 (-)
XLOC_037896 CR749776.1 non-coding downstream 709853 29807947 ~ 29808064 (-)
XLOC_037918 NA non-coding upstream 340374 30865653 ~ 30890495 (-)
XLOC_037919 NA non-coding upstream 351364 30876643 ~ 30878216 (-)
XLOC_037923 BX469902.1 non-coding upstream 662459 31187738 ~ 31187859 (-)

Expression



Co-expression Network