LOC110503586 (LOC100380764)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110503586
gene name LOC100380764
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 6148189 ~ 6157661 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


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TCTATCATTGGCCAGTTGACACATGGGTGTGGCTGTGTACAAATTTTGTAGGAAGCATATTGAATGGTTTCATATCAGCGTTTTTATAGACGATATCCGAAACTACCTGTAATAATTGATAGACATGGATTACACCGCAACCCAAAGTGTGTCCAGACAGCGTAAGTTAACGTACGTTGATCAAACTATTGATCCCGAAATGAGGAACACGTCAATGGACGGGACAGACCCCAGTCAGCTGTTTGATGACACCAGTGCAGCGCCGGGGGTGCAGCCCACTGGGTTCCAGGGCCAGGGTGTTGGGACGATGGGCCACCCCGGCCGGACCCTCCTCTCAGACCCTATGTCCAACTTGGCCATGGCTTACGGGAGCAGCCTGGCCAGCCAGGGCAAAGACTTGGTGGACAAAAATCTGGATCGTTTCCTCCCCATCTCTAAGCTGAAATATTACTTTGCCGTGGACACAGTTTACGTGGGCAAGAAACTCGGCCTGCTCGTCTTCCCCTACATGCACCAGAACTGGGAAGTGAGCTACCAACAGGACACCCCAGTGGCTCCACGCTTTGATATCAACGCTCCTGACTTGTACATTCCAGCAATGGGTTTTATCACATACATCCTGGTGGCTGGGTTAGCGCTCGGAACACAGAACAGGTTTACCCCTGAGATCCTGGGCATGCAGGCCAGCTCAGCCCTGGTGTGGCTCATCATGGAGGTGCTGGTTGTCCTCCTCAGTCTCTACCTGGTCACAGTCAACACAGACCTCACCACCATCGATCTTGTGGCCTTCTCCGGATACAAATATGTGGGGATGATTGTAGGGGTCGTGGCAGGGTTACTATTTGGTCGAACGGGATATTACCTAACGCTGCTGTGGTGCTGTATATCCATCTTCGTCTTCATGATCCGCACGTTGAGACTCAAGCTCCTGTCTGAGGCAGCAGCCCAAGGCGTGTTGGTTCACGGGGCCAGGAACCAGCTGAGGATGTACCTGACCATGTCCATCGCAGCCGCCCAGCCCATATTCATGTACTGGTTGACCTATCACCTGGTCAGGTAAGACCACGAGCTGACCAGGAGTGTTTCATCTGACAAGACACTACCTCTCTATGGAAAAATAAGACTGTTCACTGACCATCACTTCTCCCCACCATTCGCTGCAGAGGTGCGGGACACATGCACGGATAAATAAAACCACACACAAATGGCATTGTAGAATTAGCATTGTGCGAAGTCTCACAGTACAAGTGTAACAGTAGTGTTGACCTGtcttttgtattgttttttttaaatgtaattgtcTAAGAAGGATAATTGACTGGCTCGTCATGTTTTGTATACTGTAATTAGTTATGTTTTCTAAGTATTTGTGAACATATGGTTGTATATTAGCAATCCAGCTTTGGGTCCTCAATCGCAAAAGCTTTGACTGAGCCAAGGATGGAAGCACAGTTAAGGCAAATTCATAGCCTACGTAAGTAGGCAACGCAAGAACAAAGTTAGCTCCGTGAAATGGCTGTCCTGCAGAATTGCATTGCAGAATTTGCAGCCCACAATTTGTAATGTGTCACAACTACGCAGGGAAACCATTTAATGTGAATTGTGTTCTTGCGTTACATACTTACATTGACCCAAAGGCTTTAGCATAATTTGCCTGCGCCGTCCAgtgaacacacaaaaaaagcgCTCTTAATGTCCTTAATCACAGGATGATGTATGTAAACAGatttgtggatgtgtgtttgtaaATACGAAAAGTGCTTTTTGTACATGTCTTGGTGCCACGAACTGAAGCCCAAACAAAGACTTTCAATCATGTAACAAAGTCATTAAGTCATCTTAAATTACAGCTGATGCTTTTTTAAACAAGCTTGACAAAATTACATGAGCATATGACACTGTAATTGATTTTCAGGCTTCAAACTGGAAAAGTGGAAACAATATTTAATGGTTTAAGATGTTCAAATACTAGCCTCCATTTCAAATGTAGGCCTAATTACTAGAGATATCACGCTAAAATGGTGTTGCTTGCCATGCCTCAGTTGCTTTTATGAATATTTGATATACAGAGGCGGAATAACATGGATCCTCTAATGCTCTCTTCAACTTGATAAATAAACTGAAACTGGAGTACAAATTTGATATGGCTTTTTTAAATTGAACTGTTATGAAGCTGAATATGTCTCGTCCGGTATCACTAACATACACTCAAACTTTGCTTCCTATTGATACAATTTTTTTCCaacaggaaataagctttaatgGACAATGGCTACATTGTATCTATGTAAGATTAACACCTTAGCCCTTTTCCCTCTCTGCCCCAGGTTAGGATGATATGGTAATCAATAAGGAAAGCCGGTGTGTATGATAAAGCCTGCTTACCTTGACATTAGCAGATGTATGTCAGATATTCCTGTCAATCTTGATCCAACACTGCTGCTCTGTCCCCACTGTCACAATCAGATTAACAGAAGTTGTGGTTTACACCTTGGATTAACATGTGGTTGTCATCCGTTCTTGATCGGATCACTATCTAATCGAGATGTGTTGCGTTACACATGGTAATAAAATGTGTCTTATCCACCGCTGCTTCCACATTTTGCCCAGATGCCATGGTCCCTCCCTGTATGCAAATTAATTCAACCTGTCTTGGACCTCCCATTATGAAACAAGCTGTATAAATTGAAAGGAAATGGCACGTTTTGTTTTATACTCATCATTACAGCCTACTTTTTTTATCCAATGATTTAAGACTGGCCATAATAGCCTACTGTCCCAATTAACCTTGCCCTGTCCACGGCCGTACAAATAAATATTCTGAGAATCTCTCCCATCCCTAAAAAAGTCCCCACGCAAACGAGCTGAGTATCTGGATGTGTGTACAAAATATATTGAACAGTATAAATAGAAATGACACGTAGGCTCTAATGCCCACAGTAAAAACCAAAACAAGTTCAAGTAGGCTACAAAGTGCATCTGAGTGGCGCAAAGCATTATCCAAACAGGTTTGGACAGGGTTGTTCTTTACGCATGGATGTTGTCTTTATATTATTGTAATCTTCTATTGAAAATAACCCCTATATAGGCCTAACAAGCaccacatttttaaaaaaaacgaCAGGCTGGGAGTACAACTGTGGTTTAGTTTCCTCCAAATAATTGATCAGTGATCAATCGCTAACGGAACCTGAATATAACCTATAGCAGAGACGTGGTCAAATTATGAAAATGCTTAGATAAAAGCTGCAATCGATATATTGGACAGTCGCCTTGTTCATGCTTACAGAAAGCTATGTGACTTAtaaataatacaaacaaaaaggATTGGATTGTAATACCAATGtattattttcatatctgatagGCTAATAGCAACTGAAATGGACTTTTCATTCTGGCTAGATTTAAATGTACAGGTGGAAAATTTGGCCTACACATTACACTTTGCCATATACAGTACTTGTCAAGCACTGAGCTTTTCTGCTGCGACCCAAAGATTGTAGTTGTATTATTGTTTTGCATATATTGTATCTGTTAACATTGTGTTATATTTAAACTGTGCTACTTTAGGATTTTACTATTTGTTAATAATTTATGATTGAACATTTATTTACAATTTAGTCTTTGAATGCGAGAAACCAATAAAATCTACTTGCACT

Function


NR:

description
protein YIF1B-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K20362 YIF1; protein transport protein YIF1

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110503306 LOC106612708 coding upstream 227624 6385285 ~ 6456532 (-)
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si:dkey-202l22.3 LOC106612399 other downstream 1853711 4289886 ~ 4294714 (-)
egln2 egln2 other downstream 2072614 4053778 ~ 4075685 (-)
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Expression



Co-expression Network