LOC110503586 (LOC100380764)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110503586
gene name LOC100380764
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048588.1
NCBI id CM023242.2
chromosome length 45930806
location 6148189 ~ 6157661 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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CTATCATTGGCCAGTTGACACATGGGTGTGGCTGTGTACAAATTTTGTAGGAAGCATATTGAATGGTTTCATATCAGCGTTTTTATAGACGATATCCGAAACTACCTGTAATAATTGATAGACATGGATTACACCGCAACCCAAAGTGTGTCCAGACAGCATCCCGAAATGAGGAACACGTCAATGGACGGGACAGACCCCAGTCAGCTGTTTGATGACACCAGTGCAGCGCCGGGGGTGCAGCCCACTGGGTTCCAGGGCCAGGGTGTTGGGACGATGGGCCACCCCGGCCGGACCCTCCTCTCAGACCCTATGTCCAACTTGGCCATGGCTTACGGGAGCAGCCTGGCCAGCCAGGGCAAAGACTTGGTGGACAAAAATCTGGATCGTTTCCTCCCCATCTCTAAGCTGAAATATTACTTTGCCGTGGACACAGTTTACGTGGGCAAGAAACTCGGCCTGCTCGTCTTCCCCTACATGCACCAGAACTGGGAAGTGAGCTACCAACAGGACACCCCAGTGGCTCCACGCTTTGATATCAACGCTCCTGACTTGTACATTCCAGCAATGGGTTTTATCACATACATCCTGGTGGCTGGGTTAGCGCTCGGAACACAGAACAGGTTTACCCCTGAGATCCTGGGCATGCAGGCCAGCTCAGCCCTGGTGTGGCTCATCATGGAGGTGCTGGTTGTCCTCCTCAGTCTCTACCTGGTCACAGTCAACACAGACCTCACCACCATCGATCTTGTGGCCTTCTCCGGATACAAATATGTGGGGATGATTGTAGGGGTCGTGGCAGGGTTACTATTTGGTCGAACGGGATATTACCTAACGCTGCTGTGGTGCTGTATATCCATCTTCGTCTTCATGATCCGCACGTTGAGACTCAAGCTCCTGTCTGAGGCAGCAGCCCAAGGCGTGTTGGTTCACGGGGCCAGGAACCAGCTGAGGATGTACCTGACCATGTCCATCGCAGCCGCCCAGCCCATATTCATGTACTGGTTGACCTATCACCTGGTCAGGTAAGACCACGAGCTGACCAGGAGTGTTTCATCTGACAAGACACTACCTCTCTATGGAAAAATAAGACTGTTCACTGACCATCACTTCTCCCCACCATTCGCTGCAGAGGTGCGGGACACATGCACGGATAAATAAAACCACACACAAATGGCATTGTAGAATTAGCATTGTGCGAAGTCTCACAGTACAAGTGTAACAGTAGTGTTGACCTGtcttttgtattgttttttttaaatgtaattgtcTAAGAAGGATAATTGACTGGCTCGTCATGTTTTGTATACTGTAATTAGTTATGTTTTCTAAGTATTTGTGAACATATGGTTGTATATTAGCAATCCAGCTTTGGGTCCTCAATCGCAAAAGCTTTGACTGAGCCAAGGATGGAAGCACAGTTAAGGCAAATTCATAGCCTACGTAAGTAGGCAACGCAAGAACAAAGTTAGCTCCGTGAAATGGCTGTCCTGCAGAATTGCATTGCAGAATTTGCAGCCCACAATTTGTAATGTGTCACAACTACGCAGGGAAACCATTTAATGTGAATTGTGTTCTTGCGTTACATACTTACATTGACCCAAAGGCTTTAGCATAATTTGCCTGCGCCGTCCAgtgaacacacaaaaaaagcgCTCTTAATGTCCTTAATCACAGGATGATGTATGTAAACAGatttgtggatgtgtgtttgtaaATACGAAAAGTGCTTTTTGTACATGTCTTGGTGCCACGAACTGAAGCCCAAACAAAGACTTTCAATCATGTAACAAAGTCATTAAGTCATCTTAAATTACAGCTGATGCTTTTTTAAACAAGCTTGACAAAATTACATGAGCATATGACACTGTAATTGATTTTCAGGCTTCAAACTGGAAAAGTGGAAACAATATTTAATGGTTTAAGATGTTCAAATACTAGCCTCCATTTCAAATGTAGGCCTAATTACTAGAGATATCACGCTAAAATGGTGTTGCTTGCCATGCCTCAGTTGCTTTTATGAATATTTGATATACAGAGGCGGAATAACATGGATCCTCTAATGCTCTCTTCAACTTGATAAATAAACTGAAACTGGAGTACAAATTTGATATGGCTTTTTTAAATTGAACTGTTATGAAGCTGAATATGTCTCGTCCGGTATCACTAACATACACTCAAACTTTGCTTCCTATTGATACAATTTTTTTCCaacaggaaataagctttaatgGACAATGGCTACATTGTATCTATGTAAGATTAACACCTTAGCCCTTTTCCCTCTCTGCCCCAGGTTAGGATGATATGGTAATCAATAAGGAAAGCCGGTGTGTATGATAAAGCCTGCTTACCTTGACATTAGCAGATGTATGTCAGATATTCCTGTCAATCTTGATCCAACACTGCTGCTCTGTCCCCACTGTCACAATCAGATTAACAGAAGTTGTGGTTTACACCTTGGATTAACATGTGGTTGTCATCCGTTCTTGATCGGATCACTATCTAATCGAGATGTGTTGCGTTACACATGGTAATAAAATGTGTCTTATCCACCGCTGCTTCCACATTTTGCCCAGATGCCATGGTCCCTCCCTGTATGCAAATTAATTCAACCTGTCTTGGACCTCCCATTATGAAACAAGCTGTATAAATTGAAAGGAAATGGCACGTTTTGTTTTATACTCATCATTACAGCCTACTTTTTTTATCCAATGATTTAAGACTGGCCATAATAGCCTACTGTCCCAATTAACCTTGCCCTGTCCACGGCCGTACAAATAAATATTCTGAGAATCTCTCCCATCCCTAAAAAAGTCCCCACGCAAACGAGCTGAGTATCTGGATGTGTGTACAAAATATATTGAACAGTATAAATAGAAATGACACGTAGGCTCTAATGCCCACAGTAAAAACCAAAACAAGTTCAAGTAGGCTACAAAGTGCATCTGAGTGGCGCAAAGCATTATCCAAACAGGTTTGGACAGGGTTGTTCTTTACGCATGGATGTTGTCTTTATATTATTGTAATCTTCTATTGAAAATAACCCCTATATAGGCCTAACAAGCaccacatttttaaaaaaaacgaCAGGCTGGGAGTACAACTGTGGTTTAGTTTCCTCCAAATAATTGATCAGTGATCAATCGCTAACGGAACCTGAATATAACCTATAGCAGAGACGTGGTCAAATTATGAAAATGCTTAGATAAAAGCTGCAATCGATATATTGGACAGTCGCCTTGTTCATGCTTACAGAAAGCTATGTGACTTAtaaataatacaaacaaaaaggATTGGATTGTAATACCAATGtattattttcatatctgatagGCTAATAGCAACTGAAATGGACTTTTCATTCTGGCTAGATTTAAATGTACAGGTGGAAAATTTGGCCTACACATTACACTTTGCCATATACAGTACTTGTCAAGCACTGAGCTTTTCTGCTGCGACCCAAAGATTGTAGTTGTATTATTGTTTTGCATATATTGTATCTGTTAACATTGTGTTATATTTAAACTGTGCTACTTTAGGATTTTACTATTTGTTAATAATTTATGATTGAACATTTATTTACAATTTAGTCTTTGAATGCGAGAAACCAATAAAATCTACTTGCACT
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TCTATCATTGGCCAGTTGACACATGGGTGTGGCTGTGTACAAATTTTGTAGGAAGCATATTGAATGGTTTCATATCAGCGTTTTTATAGACGATATCCGAAACTACCTGTAATAATTGATAGACATGGATTACACCGCAACCCAAAGTGTGTCCAGACAGCGTAAGTTAACGTACGTTGATCAAACTATTGATCCCGAAATGAGGAACACGTCAATGGACGGGACAGACCCCAGTCAGCTGTTTGATGACACCAGTGCAGCGCCGGGGGTGCAGCCCACTGGGTTCCAGGGCCAGGGTGTTGGGACGATGGGCCACCCCGGCCGGACCCTCCTCTCAGACCCTATGTCCAACTTGGCCATGGCTTACGGGAGCAGCCTGGCCAGCCAGGGCAAAGACTTGGTGGACAAAAATCTGGATCGTTTCCTCCCCATCTCTAAGCTGAAATATTACTTTGCCGTGGACACAGTTTACGTGGGCAAGAAACTCGGCCTGCTCGTCTTCCCCTACATGCACCAGAACTGGGAAGTGAGCTACCAACAGGACACCCCAGTGGCTCCACGCTTTGATATCAACGCTCCTGACTTGTACATTCCAGCAATGGGTTTTATCACATACATCCTGGTGGCTGGGTTAGCGCTCGGAACACAGAACAGGTTTACCCCTGAGATCCTGGGCATGCAGGCCAGCTCAGCCCTGGTGTGGCTCATCATGGAGGTGCTGGTTGTCCTCCTCAGTCTCTACCTGGTCACAGTCAACACAGACCTCACCACCATCGATCTTGTGGCCTTCTCCGGATACAAATATGTGGGGATGATTGTAGGGGTCGTGGCAGGGTTACTATTTGGTCGAACGGGATATTACCTAACGCTGCTGTGGTGCTGTATATCCATCTTCGTCTTCATGATCCGCACGTTGAGACTCAAGCTCCTGTCTGAGGCAGCAGCCCAAGGCGTGTTGGTTCACGGGGCCAGGAACCAGCTGAGGATGTACCTGACCATGTCCATCGCAGCCGCCCAGCCCATATTCATGTACTGGTTGACCTATCACCTGGTCAGGTAAGACCACGAGCTGACCAGGAGTGTTTCATCTGACAAGACACTACCTCTCTATGGAAAAATAAGACTGTTCACTGACCATCACTTCTCCCCACCATTCGCTGCAGAGGTGCGGGACACATGCACGGATAAATAAAACCACACACAAATGGCATTGTAGAATTAGCATTGTGCGAAGTCTCACAGTACAAGTGTAACAGTAGTGTTGACCTGtcttttgtattgttttttttaaatgtaattgtcTAAGAAGGATAATTGACTGGCTCGTCATGTTTTGTATACTGTAATTAGTTATGTTTTCTAAGTATTTGTGAACATATGGTTGTATATTAGCAATCCAGCTTTGGGTCCTCAATCGCAAAAGCTTTGACTGAGCCAAGGATGGAAGCACAGTTAAGGCAAATTCATAGCCTACGTAAGTAGGCAACGCAAGAACAAAGTTAGCTCCGTGAAATGGCTGTCCTGCAGAATTGCATTGCAGAATTTGCAGCCCACAATTTGTAATGTGTCACAACTACGCAGGGAAACCATTTAATGTGAATTGTGTTCTTGCGTTACATACTTACATTGACCCAAAGGCTTTAGCATAATTTGCCTGCGCCGTCCAgtgaacacacaaaaaaagcgCTCTTAATGTCCTTAATCACAGGATGATGTATGTAAACAGatttgtggatgtgtgtttgtaaATACGAAAAGTGCTTTTTGTACATGTCTTGGTGCCACGAACTGAAGCCCAAACAAAGACTTTCAATCATGTAACAAAGTCATTAAGTCATCTTAAATTACAGCTGATGCTTTTTTAAACAAGCTTGACAAAATTACATGAGCATATGACACTGTAATTGATTTTCAGGCTTCAAACTGGAAAAGTGGAAACAATATTTAATGGTTTAAGATGTTCAAATACTAGCCTCCATTTCAAATGTAGGCCTAATTACTAGAGATATCACGCTAAAATGGTGTTGCTTGCCATGCCTCAGTTGCTTTTATGAATATTTGATATACAGAGGCGGAATAACATGGATCCTCTAATGCTCTCTTCAACTTGATAAATAAACTGAAACTGGAGTACAAATTTGATATGGCTTTTTTAAATTGAACTGTTATGAAGCTGAATATGTCTCGTCCGGTATCACTAACATACACTCAAACTTTGCTTCCTATTGATACAATTTTTTTCCaacaggaaataagctttaatgGACAATGGCTACATTGTATCTATGTAAGATTAACACCTTAGCCCTTTTCCCTCTCTGCCCCAGGTTAGGATGATATGGTAATCAATAAGGAAAGCCGGTGTGTATGATAAAGCCTGCTTACCTTGACATTAGCAGATGTATGTCAGATATTCCTGTCAATCTTGATCCAACACTGCTGCTCTGTCCCCACTGTCACAATCAGATTAACAGAAGTTGTGGTTTACACCTTGGATTAACATGTGGTTGTCATCCGTTCTTGATCGGATCACTATCTAATCGAGATGTGTTGCGTTACACATGGTAATAAAATGTGTCTTATCCACCGCTGCTTCCACATTTTGCCCAGATGCCATGGTCCCTCCCTGTATGCAAATTAATTCAACCTGTCTTGGACCTCCCATTATGAAACAAGCTGTATAAATTGAAAGGAAATGGCACGTTTTGTTTTATACTCATCATTACAGCCTACTTTTTTTATCCAATGATTTAAGACTGGCCATAATAGCCTACTGTCCCAATTAACCTTGCCCTGTCCACGGCCGTACAAATAAATATTCTGAGAATCTCTCCCATCCCTAAAAAAGTCCCCACGCAAACGAGCTGAGTATCTGGATGTGTGTACAAAATATATTGAACAGTATAAATAGAAATGACACGTAGGCTCTAATGCCCACAGTAAAAACCAAAACAAGTTCAAGTAGGCTACAAAGTGCATCTGAGTGGCGCAAAGCATTATCCAAACAGGTTTGGACAGGGTTGTTCTTTACGCATGGATGTTGTCTTTATATTATTGTAATCTTCTATTGAAAATAACCCCTATATAGGCCTAACAAGCaccacatttttaaaaaaaacgaCAGGCTGGGAGTACAACTGTGGTTTAGTTTCCTCCAAATAATTGATCAGTGATCAATCGCTAACGGAACCTGAATATAACCTATAGCAGAGACGTGGTCAAATTATGAAAATGCTTAGATAAAAGCTGCAATCGATATATTGGACAGTCGCCTTGTTCATGCTTACAGAAAGCTATGTGACTTAtaaataatacaaacaaaaaggATTGGATTGTAATACCAATGtattattttcatatctgatagGCTAATAGCAACTGAAATGGACTTTTCATTCTGGCTAGATTTAAATGTACAGGTGGAAAATTTGGCCTACACATTACACTTTGCCATATACAGTACTTGTCAAGCACTGAGCTTTTCTGCTGCGACCCAAAGATTGTAGTTGTATTATTGTTTTGCATATATTGTATCTGTTAACATTGTGTTATATTTAAACTGTGCTACTTTAGGATTTTACTATTTGTTAATAATTTATGATTGAACATTTATTTACAATTTAGTCTTTGAATGCGAGAAACCAATAAAATCTACTTGCACT

Function

NR:

description
protein YIF1B-like isoform X1

GO: NA

KEGG:

id description
K20362 YIF1; protein transport protein YIF1

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021581991.2 False 3631 mRNA 0.42 8 6148189 6157660
XM_021581990.2 True 3662 mRNA 0.42 8 6148189 6157661

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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LOC110503580 LOC106612720 coding downstream 629417 5514730 ~ 5518772 (-)
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LOC110503578 NA coding downstream 637797 5503177 ~ 5510392 (-)
LOC110503577 LOC106612723 coding downstream 653759 5490835 ~ 5494430 (-)
LOC110503585 LOC106612713 coding upstream 2050 6159711 ~ 6175088 (-)
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LOC118944097 NA coding upstream 111257 6264040 ~ 6317522 (-)
LOC110503590 LOC106612705 coding upstream 214409 6371958 ~ 6472758 (-)
LOC110503306 LOC106612708 coding upstream 227624 6385285 ~ 6456532 (-)
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G1896162 NA non-coding downstream 99558 6045593 ~ 6048631 (-)
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si:dkey-202l22.3 LOC106612399 other downstream 1853711 4289886 ~ 4294714 (-)
egln2 egln2 other downstream 2072614 4053778 ~ 4075685 (-)
G1893790 LOC106612372 other downstream 2233341 3881288 ~ 3914848 (-)
G1899875 NA other upstream 1889118 8046779 ~ 8047974 (-)
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G1901072 LOC107388308 other upstream 3847711 10005372 ~ 10012354 (-)

Expression

LOC110503586(LOC100380764) Expression in all Baseline Samples

Bar chart with 20 bars.
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying values. Range: 0 to 20.
End of interactive chart.

LOC110503586(LOC100380764) Expression in each Bioproject

Bar chart with 21 bars.
LOC110503586(LOC100380764) Expression in each Sample
The chart has 1 X axis displaying categories.
The chart has 1 Y axis displaying Expression. Range: 0 to 300.
End of interactive chart.

Co-expression Network