XLOC_037926 (tmtc4)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_037926
gene name tmtc4
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 31494941 ~ 31525126 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00074448
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Function

symbol description
tmtc4 Predicted to enable dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase activity. Predicted to be located in endoplasmic reticulum and membrane. Predicted to be integral component of membrane. Is expressed in central nervous system; neural plate; and retinal ganglion cell layer. Orthologous to human TMTC4 (transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 4).

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
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Ensembl:

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RNA

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Neighbor

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XLOC_037925 zic5 coding downstream 180617 31274108 ~ 31314324 (-)
XLOC_037924 NA coding downstream 223015 31264412 ~ 31271926 (-)
XLOC_037923 BX469902.1 coding downstream 307082 31187738 ~ 31187859 (-)
XLOC_037922 si:ch211-184m13.4 coding downstream 358933 31134907 ~ 31136008 (-)
XLOC_037921 gpr183a coding downstream 386656 31105389 ~ 31108285 (-)
XLOC_037927 nalcn coding upstream 64299 31589425 ~ 31747106 (-)
XLOC_037928 BX571786.1 coding upstream 229955 31755081 ~ 31780466 (-)
XLOC_037929 NA coding upstream 233507 31758633 ~ 31763256 (-)
XLOC_037930 NA coding upstream 272719 31797845 ~ 31810047 (-)
XLOC_037931 fgf14 coding upstream 312918 31838044 ~ 31915423 (-)
XLOC_037918 NA non-coding downstream 604446 30865653 ~ 30890495 (-)
XLOC_037919 NA non-coding downstream 616725 30876643 ~ 30878216 (-)
XLOC_037916 BX571809.2 non-coding downstream 786987 30707839 ~ 30707954 (-)
XLOC_037932 NA non-coding upstream 532580 32057706 ~ 32058334 (-)
XLOC_037933 BX530407.2 non-coding upstream 571205 32096331 ~ 32105780 (-)

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